61 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_9196 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_9196  protein of unknown function DUF1470  100 
 
 		 183 aa  360  5.0000000000000005e-99  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.859333 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1215  hypothetical protein  43.09 
 
 		 207 aa  115  3e-25  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.759773  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3324  hypothetical protein  31.84 
 
 		 193 aa  79.7  0.00000000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3480  protein of unknown function DUF1470  30.73 
 
 		 193 aa  74.3  0.000000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_14500  conserved protein containing a Zn-ribbon-like motif, possibly RNA-binding  33.93 
 
 		 188 aa  68.2  0.00000000006  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.111122 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1454  protein of unknown function DUF1470  34.97 
 
 		 174 aa  67.4  0.0000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0998  hypothetical protein  25.13 
 
 		 194 aa  66.6  0.0000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0954  hypothetical protein  31.18 
 
 		 184 aa  66.2  0.0000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4308  hypothetical protein  25.52 
 
 		 194 aa  65.5  0.0000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4844  hypothetical protein  30.73 
 
 		 215 aa  65.5  0.0000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.10336  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47200  hypothetical protein  34.54 
 
 		 195 aa  65.1  0.0000000005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6038  hypothetical protein  36.41 
 
 		 200 aa  63.9  0.000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1225  Conserved protein containing a Zn-ribbon-like protein motif possibly RNA-binding  29.59 
 
 		 191 aa  63.5  0.000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00786893 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5519  hypothetical protein  29.08 
 
 		 219 aa  63.5  0.000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5342  hypothetical protein  29.08 
 
 		 219 aa  63.5  0.000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.74312  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6249  protein of unknown function DUF1470  32.02 
 
 		 181 aa  62.4  0.000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0782544  normal  0.141305 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0139  hypothetical protein  31.79 
 
 		 206 aa  62.4  0.000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.772126  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3285  hypothetical protein  30.21 
 
 		 212 aa  62.4  0.000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0319342 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4029  hypothetical protein  33.87 
 
 		 192 aa  62.4  0.000000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.462167  normal  0.541056 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0894  hypothetical protein  24.87 
 
 		 194 aa  62  0.000000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0853  hypothetical protein  24.87 
 
 		 194 aa  62  0.000000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0952  hypothetical protein  24.87 
 
 		 194 aa  62  0.000000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1036  hypothetical protein  24.87 
 
 		 194 aa  62  0.000000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.26369e-21 
 
 
-
 
NC_003296  RS05465  hypothetical protein  34.02 
 
 		 199 aa  61.6  0.000000006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.889335  normal  0.0895575 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4823  protein of unknown function DUF1470  32.61 
 
 		 192 aa  61.6  0.000000007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1123  hypothetical protein  24.87 
 
 		 194 aa  61.2  0.000000007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3746  protein of unknown function DUF1470  32.61 
 
 		 192 aa  61.6  0.000000007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.10286  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4753  hypothetical protein  29.08 
 
 		 211 aa  60.5  0.00000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.268906  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0870  hypothetical protein  24.87 
 
 		 194 aa  60.8  0.00000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0926819  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1030  hypothetical protein  32.83 
 
 		 176 aa  60.1  0.00000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.962986  normal  0.138179 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5067  hypothetical protein  31.46 
 
 		 200 aa  59.7  0.00000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.569899 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1923  protein of unknown function DUF1470  32.95 
 
 		 200 aa  59.3  0.00000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.108789  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6461  hypothetical protein  33.33 
 
 		 210 aa  59.3  0.00000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0507888  normal  0.43229 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5391  hypothetical protein  29.95 
 
 		 220 aa  57.8  0.00000008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.421091  normal  0.322257 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2691  protein of unknown function DUF1470  29.59 
 
 		 206 aa  57.4  0.0000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0212  hypothetical protein  31.19 
 
 		 226 aa  54.7  0.0000008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1908  protein of unknown function DUF1470  30.56 
 
 		 208 aa  53.9  0.000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.975753  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7176  protein of unknown function DUF1470  30.81 
 
 		 210 aa  52.8  0.000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8261  hypothetical protein  31.91 
 
 		 200 aa  52.4  0.000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0410012 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27110  conserved protein containing a Zn-ribbon-like motif, possibly RNA-binding  31.18 
 
 		 174 aa  52.4  0.000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.902416  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4029  hypothetical protein  30.69 
 
 		 205 aa  52  0.000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.952882 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1894  hypothetical protein  33.71 
 
 		 191 aa  51.6  0.000006  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0220  hypothetical protein  28.64 
 
 		 219 aa  51.6  0.000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00646093 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4335  hypothetical protein  29.38 
 
 		 178 aa  47.8  0.00008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.107255 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2691  protein of unknown function DUF1470  32.95 
 
 		 194 aa  47.4  0.0001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5591  protein of unknown function DUF1470  25.51 
 
 		 210 aa  47.4  0.0001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.166159  normal  0.646492 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2488  protein of unknown function DUF1470  24.86 
 
 		 196 aa  46.2  0.0003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5018  hypothetical protein  45.45 
 
 		 194 aa  45.8  0.0003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.212987 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1464  hypothetical protein  30.1 
 
 		 205 aa  45.8  0.0003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00237783 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0177  hypothetical protein  27.6 
 
 		 190 aa  46.2  0.0003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1921  protein of unknown function DUF1470  29.41 
 
 		 186 aa  45.4  0.0004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000367455  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3273  hypothetical protein  34.08 
 
 		 223 aa  44.7  0.0008  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1455  protein of unknown function DUF1470  27.75 
 
 		 206 aa  43.9  0.001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.304007  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1731  protein of unknown function DUF1470  32.93 
 
 		 185 aa  43.5  0.002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3071  hypothetical protein  27.75 
 
 		 210 aa  43.5  0.002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.767749  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0559  protein of unknown function DUF1470  38.1 
 
 		 197 aa  42.7  0.003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0883  hypothetical protein  31.78 
 
 		 214 aa  42.4  0.003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.275571 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1076  protein of unknown function DUF1470  27.95 
 
 		 177 aa  41.2  0.008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0563895  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26800  conserved protein containing a Zn-ribbon-like motif, possibly RNA-binding  38.64 
 
 		 175 aa  41.2  0.009  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.30871 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8299  hypothetical protein  31.63 
 
 		 181 aa  41.2  0.009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4849  hypothetical protein  29.21 
 
 		 167 aa  41.2  0.009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>