43 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_6140 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_6140  putative transcriptional regulator, PaaX family  100 
 
 		 251 aa  484  1e-136  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.353105  normal  0.192867 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0977  PaaX-like protein  52.89 
 
 		 243 aa  207  2e-52  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0995  PaaX domain-containing protein, C- domain  52.89 
 
 		 243 aa  207  2e-52  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1005  PaaX domain-containing protein, C- domain  52.89 
 
 		 243 aa  207  2e-52  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.457167 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10688  hypothetical protein  53.39 
 
 		 240 aa  205  5e-52  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1271  PaaX domain-containing protein, C- domain  48.02 
 
 		 237 aa  194  1e-48  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  decreased coverage  0.00141132  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5085  PaaX domain-containing protein, C- domain  46.64 
 
 		 244 aa  186  2e-46  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.706044 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4285  PaaX domain protein protein domain protein  46.91 
 
 		 244 aa  183  2.0000000000000003e-45  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.246767  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0915  PaaX domain-containing protein  34.32 
 
 		 275 aa  62  0.000000008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0524  hypothetical protein  32.77 
 
 		 281 aa  57.8  0.0000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00945  PaaX-like protein  27.57 
 
 		 266 aa  57.4  0.0000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.067887  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3911  PaaX-like  30.7 
 
 		 239 aa  55.8  0.0000006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.547243  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2835  transcriptional regulator, PaaX family  22.87 
 
 		 285 aa  53.1  0.000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19070  phenylacetic acid-responsive transcriptional repressor  28.57 
 
 		 292 aa  52.8  0.000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0202563  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2859  transcriptional regulator, PaaX family  23.29 
 
 		 285 aa  52.8  0.000006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2878  putative transcriptional regulator, PaaX family  32.54 
 
 		 263 aa  52  0.000009  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.212697  normal  0.21699 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0196  transcriptional regulator, PaaX family  25.6 
 
 		 319 aa  49.7  0.00005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2025  transcriptional regulator, PaaX family  25.54 
 
 		 306 aa  49.7  0.00005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0692  phenylacetic acid degradation operon negative regulatory protein PaaX  32.69 
 
 		 287 aa  49.7  0.00005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.717402  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4146  PaaX family transcriptional regulator  28.1 
 
 		 305 aa  48.9  0.00008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.85173 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8420  putative transcriptional regulator, PaaX family  31.97 
 
 		 260 aa  48.1  0.0001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.289328  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3083  PaaX family transcriptional regulator  24.21 
 
 		 312 aa  47.8  0.0002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.415086 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0980  transcriptional regulator, PaaX family  25.2 
 
 		 259 aa  47.8  0.0002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.148761 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3103  PaaX family transcriptional regulator  24.3 
 
 		 307 aa  47.4  0.0002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  decreased coverage  0.000000661945  decreased coverage  0.0000397547 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0895  PaaX family transcriptional regulator  30.85 
 
 		 305 aa  47.8  0.0002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.947925  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2864  phenylacetic acid degradation operon negative regulatory protein paaX  26.34 
 
 		 293 aa  47  0.0003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  decreased coverage  0.00499823  normal  0.0484276 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0588  transcriptional regulator, PaaX family  28.15 
 
 		 276 aa  46.6  0.0004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0283  hypothetical protein  29 
 
 		 278 aa  46.2  0.0005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.535361  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3480  hypothetical protein  29 
 
 		 278 aa  46.2  0.0005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1827  hypothetical protein  29 
 
 		 278 aa  46.2  0.0005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0069  hypothetical protein  29 
 
 		 278 aa  46.2  0.0005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0067  hypothetical protein  29 
 
 		 278 aa  46.2  0.0005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2726  hypothetical protein  29 
 
 		 278 aa  46.2  0.0005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1206  PaaX domain-containing protein, C- domain  30.99 
 
 		 258 aa  45.8  0.0006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1609  PaaX family transcriptional regulator  25.66 
 
 		 258 aa  45.4  0.001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2009  transcriptional regulator, PaaX family  28.22 
 
 		 281 aa  44.3  0.002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.429433  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2629  PaaX family transcriptional regulator  24.79 
 
 		 259 aa  44.7  0.002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.495501  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0294  transcriptional regulator, PaaX family  28.63 
 
 		 318 aa  44.3  0.002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0429653  hitchhiker  0.0000864342 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0058  hypothetical protein  29.49 
 
 		 278 aa  44.7  0.002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2623  PaaX family transcriptional regulator  25.54 
 
 		 334 aa  43.5  0.004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.312733  normal  0.0873289 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0661  PaaX domain-containing protein, C- domain  20.09 
 
 		 285 aa  42.7  0.006  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7200  transcriptional regulator, PaaX family  30.86 
 
 		 292 aa  42.4  0.007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.803046  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0094  PaaX family transcriptional regulator  28.99 
 
 		 289 aa  42.4  0.007  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.339453  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>