128 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_5424 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013595  Sros_5424  hypothetical protein  100 
 
 
311 aa  624  1e-178  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.741222  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3761  Hemerythrin HHE cation binding domain protein  43.25 
 
 
274 aa  217  2e-55  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.80349  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2183  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  41.47 
 
 
306 aa  216  2.9999999999999998e-55  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.576413  normal  0.216575 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4541  hypothetical protein  55.88 
 
 
177 aa  154  2.9999999999999998e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.19385  normal  0.304332 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3783  hypothetical protein  50 
 
 
150 aa  137  2e-31  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2616  hypothetical protein  51.15 
 
 
149 aa  134  1.9999999999999998e-30  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4642  hypothetical protein  50.39 
 
 
135 aa  132  6.999999999999999e-30  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.543378  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4211  hypothetical protein  50.39 
 
 
135 aa  130  2.0000000000000002e-29  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1007  hypothetical protein  48.85 
 
 
140 aa  123  3e-27  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.2875 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1416  hypothetical protein  48.85 
 
 
149 aa  123  5e-27  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.61227  normal  0.064122 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1187  hypothetical protein  50.76 
 
 
146 aa  122  5e-27  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2315  hypothetical protein  48.85 
 
 
142 aa  122  8e-27  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.121739  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2362  hypothetical protein  48.85 
 
 
142 aa  122  8e-27  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.579861  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2354  hypothetical protein  48.09 
 
 
142 aa  121  1.9999999999999998e-26  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0885  hypothetical protein  43.85 
 
 
151 aa  119  6e-26  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2125  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  31.53 
 
 
284 aa  117  3e-25  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0724883  normal  0.145093 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2630  hypothetical protein  50 
 
 
153 aa  115  6e-25  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.421408  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2675  hypothetical protein  50 
 
 
153 aa  115  6e-25  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.313846 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2659  hypothetical protein  50 
 
 
153 aa  115  6e-25  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.463167 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2212  hypothetical protein  45.65 
 
 
144 aa  110  2.0000000000000002e-23  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6160  hypothetical protein  47.41 
 
 
144 aa  108  8.000000000000001e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.237259  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2511  hypothetical protein  45.04 
 
 
134 aa  107  2e-22  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00847737  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7866  hypothetical protein  47.33 
 
 
145 aa  106  5e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5355  hypothetical protein  40.37 
 
 
145 aa  105  9e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.161849  normal  0.474804 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0482  hypothetical protein  42.64 
 
 
164 aa  103  5e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13580  hypothetical protein  41.67 
 
 
151 aa  100  5e-20  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.0664685 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0623  hypothetical protein  43.9 
 
 
144 aa  99.8  5e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2023  hypothetical protein  41.13 
 
 
145 aa  99.8  5e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.481727  normal  0.406652 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11287  hypothetical protein  46.03 
 
 
149 aa  99.4  7e-20  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.91215  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0956  hypothetical protein  39.84 
 
 
161 aa  99  8e-20  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.2542  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2106  hypothetical protein  39.23 
 
 
177 aa  98.2  1e-19  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.334754 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2798  hypothetical protein  46.67 
 
 
140 aa  97.4  2e-19  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  hitchhiker  0.00699009  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0266  hypothetical protein  42.31 
 
 
133 aa  97.4  3e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5840  hypothetical protein  42.59 
 
 
143 aa  97.1  4e-19  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.765788  normal  0.503571 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5388  hypothetical protein  39.84 
 
 
144 aa  97.1  4e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1237  hypothetical protein  34.69 
 
 
157 aa  96.7  5e-19  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5096  hypothetical protein  35.8 
 
 
196 aa  96.7  5e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0570836  normal  0.0453765 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1090  hypothetical protein  52.83 
 
 
145 aa  95.5  1e-18  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.769148 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4989  hypothetical protein  40.32 
 
 
145 aa  95.1  1e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.794366  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1788  hypothetical protein  40.16 
 
 
161 aa  92.8  6e-18  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.370056 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3969  hypothetical protein  44.35 
 
 
147 aa  92.8  7e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.827845  normal  0.0645114 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1126  hypothetical protein  41.13 
 
 
147 aa  92.8  7e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.726493  normal  0.303948 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10710  conserved hypothetical protein TIGR00026  39.53 
 
 
360 aa  92.4  9e-18  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.735464 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11000  conserved hypothetical protein TIGR00026  39.53 
 
 
138 aa  92.4  1e-17  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3955  hypothetical protein  43.55 
 
 
147 aa  91.7  2e-17  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4029  hypothetical protein  43.55 
 
 
147 aa  91.7  2e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.412865  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2456  hypothetical protein  39.42 
 
 
140 aa  91.3  2e-17  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.597915  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1156  Hemerythrin HHE cation binding domain protein  38.67 
 
 
157 aa  90.1  4e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.902168 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0985  hypothetical protein  38.71 
 
 
145 aa  89.7  6e-17  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0468293  normal  0.0249112 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3084  hypothetical protein  38.52 
 
 
145 aa  88.2  1e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3144  hypothetical protein  38.52 
 
 
145 aa  88.2  1e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.193303  normal  0.123554 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3827  hypothetical protein  38.02 
 
 
146 aa  88.2  1e-16  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3104  hypothetical protein  38.52 
 
 
145 aa  87.8  2e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.412887  normal  0.643759 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0997  hypothetical protein  41.9 
 
 
140 aa  88.2  2e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4680  hypothetical protein  33.88 
 
 
150 aa  87  3e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4766  hypothetical protein  33.88 
 
 
150 aa  87  3e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.203772  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0042  hypothetical protein  38.28 
 
 
159 aa  87  3e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.274125  normal  0.0949718 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0052  hypothetical protein  38.28 
 
 
159 aa  86.7  5e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0902572  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0061  hypothetical protein  38.28 
 
 
159 aa  86.7  5e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0484096 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5065  hypothetical protein  33.88 
 
 
150 aa  85.5  0.000000000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.336664  normal  0.524632 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11590  hypothetical protein  37.7 
 
 
148 aa  85.5  0.000000000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  1.30585e-85  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2498  hypothetical protein  40.98 
 
 
157 aa  85.1  0.000000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0978  hypothetical protein  46.67 
 
 
145 aa  84.7  0.000000000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00155149 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3972  hypothetical protein  36.84 
 
 
169 aa  84.3  0.000000000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.604025  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0257  hypothetical protein  35.94 
 
 
147 aa  84.3  0.000000000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4153  hypothetical protein  40.44 
 
 
152 aa  84  0.000000000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2976  hypothetical protein  37.12 
 
 
163 aa  84  0.000000000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.000000649339  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2156  hypothetical protein  41.73 
 
 
155 aa  83.2  0.000000000000005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1505  hypothetical protein  31.78 
 
 
166 aa  82.4  0.000000000000009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2031  hypothetical protein  41.27 
 
 
125 aa  82.4  0.000000000000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0287759  normal  0.679852 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4457  hypothetical protein  38.89 
 
 
152 aa  82.4  0.00000000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0749  hypothetical protein  40.38 
 
 
167 aa  80.9  0.00000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.441888  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0763  hypothetical protein  40.38 
 
 
167 aa  80.9  0.00000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.127408  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0743  hypothetical protein  40.38 
 
 
167 aa  80.9  0.00000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.163997  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1559  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related FMN-binding  36.29 
 
 
143 aa  79.7  0.00000000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.336696  normal  0.577316 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0833  hypothetical protein  41.73 
 
 
143 aa  79.7  0.00000000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5261  hypothetical protein  31.78 
 
 
168 aa  79.3  0.00000000000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.442083 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1829  hypothetical protein  41.27 
 
 
169 aa  77  0.0000000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0349871  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1876  hypothetical protein  41.27 
 
 
169 aa  77  0.0000000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0838475  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1810  hypothetical protein  41.27 
 
 
169 aa  77  0.0000000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0179461  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5225  hypothetical protein  37.04 
 
 
154 aa  77  0.0000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.653712 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2238  hypothetical protein  38.89 
 
 
152 aa  75.9  0.0000000000008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.477242  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1728  hypothetical protein  39.55 
 
 
138 aa  75.9  0.0000000000008  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.247315  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2015  hypothetical protein  41.67 
 
 
168 aa  75.9  0.0000000000008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.364404  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6204  hypothetical protein  40 
 
 
164 aa  75.5  0.0000000000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.474023  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1126  hypothetical protein  37.96 
 
 
146 aa  75.9  0.0000000000009  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.331179  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4262  hypothetical protein  50 
 
 
146 aa  75.5  0.000000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.877042  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5872  hypothetical protein  34.62 
 
 
144 aa  74.7  0.000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0817748 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0254  hypothetical protein  36.96 
 
 
157 aa  73.6  0.000000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1328  hypothetical protein  34.35 
 
 
153 aa  73.2  0.000000000006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4618  hypothetical protein  39.2 
 
 
164 aa  72.8  0.000000000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.168908  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2085  hypothetical protein  38.46 
 
 
164 aa  72.4  0.000000000009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.776425  normal  0.252663 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1375  Hemerythrin HHE cation binding domain protein  29.94 
 
 
168 aa  72.4  0.00000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0512  hypothetical protein  29.85 
 
 
157 aa  71.2  0.00000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1321  hypothetical protein  38.3 
 
 
174 aa  70.5  0.00000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.641608  normal  0.0856253 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3347  Hemerythrin HHE cation binding domain protein  34.87 
 
 
164 aa  70.9  0.00000000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.329659  hitchhiker  0.00378546 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4640  hypothetical protein  33.86 
 
 
143 aa  70.9  0.00000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1364  hypothetical protein  43.01 
 
 
159 aa  70.1  0.00000000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.951673  normal  0.623642 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3031  coenzyme F420-dependent N5 N10-methylene tetrahydromethanopterin reductase and related flavin-dependent oxidoreductase  30.29 
 
 
557 aa  68.6  0.0000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1838  hypothetical protein  35.19 
 
 
162 aa  68.6  0.0000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>