18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_4337 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_4337  hypothetical protein  100 
 
 		 265 aa  513  1e-144  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.100167  normal  0.636855 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2610  ABC-2 type transporter  75 
 
 		 273 aa  378  1e-104  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.331867 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2611  ABC-2 type transporter  28.57 
 
 		 271 aa  83.6  0.000000000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.463283 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4941  putative ABC-2 type transporter, permease protein  31.6 
 
 		 289 aa  83.2  0.000000000000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.396913  normal  0.0438009 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4338  hypothetical protein  29.41 
 
 		 256 aa  71.6  0.00000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0140069  normal  0.856697 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2330  ABC-2 type transporter  31.58 
 
 		 256 aa  56.2  0.0000005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.813054 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4940  ABC-2 type transporter  31 
 
 		 275 aa  53.1  0.000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  normal  0.0438009 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1410  ABC-type polysaccharide/polyol phosphate export system, permease component  23.7 
 
 		 256 aa  49.7  0.00004  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000000000143094  unclonable  2.44279e-28 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1455  ABC-2 type transporter  28.15 
 
 		 270 aa  50.1  0.00004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1500  ABC-2 type transporter  28.15 
 
 		 270 aa  50.1  0.00004  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3260  hypothetical protein  28.5 
 
 		 258 aa  49.3  0.00006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.698821  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1336  ABC-2 type transporter  27.37 
 
 		 253 aa  46.6  0.0005  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.131749  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0790  hypothetical protein  28.35 
 
 		 276 aa  46.2  0.0006  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.883996 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0406  ABC-2 type transporter  25.35 
 
 		 279 aa  45.8  0.0008  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0129272  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1211  ABC-2 type transporter  29 
 
 		 252 aa  43.9  0.002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3574  ABC transporter, permease protein  24.31 
 
 		 254 aa  43.5  0.003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.426841  normal  0.115682 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1399  ABC-2 type transporter  30.28 
 
 		 278 aa  43.1  0.005  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0407  ABC-2 type transporter  26.02 
 
 		 308 aa  42  0.01  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>