15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_4941 on replicon NC_008697
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008697  Noca_4941  putative ABC-2 type transporter, permease protein  100 
 
 		 289 aa  563  1.0000000000000001e-159  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.396913  normal  0.0438009 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2610  ABC-2 type transporter  31.29 
 
 		 273 aa  106  3e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.331867 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4337  hypothetical protein  33.7 
 
 		 265 aa  106  6e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.100167  normal  0.636855 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2611  ABC-2 type transporter  26.94 
 
 		 271 aa  59.7  0.00000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.463283 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4940  ABC-2 type transporter  27.19 
 
 		 275 aa  56.2  0.0000006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  normal  0.0438009 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4338  hypothetical protein  26.67 
 
 		 256 aa  55.8  0.0000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0140069  normal  0.856697 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1336  ABC-2 type transporter  26.6 
 
 		 253 aa  52  0.00001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.131749  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1455  ABC-2 type transporter  30.98 
 
 		 270 aa  45.4  0.001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1500  ABC-2 type transporter  30.98 
 
 		 270 aa  45.4  0.001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2477  ABC-2 type transporter  31.52 
 
 		 286 aa  43.5  0.004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.299444 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3260  hypothetical protein  29.39 
 
 		 258 aa  43.5  0.004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.698821  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0786  ABC-2 type transporter  27.5 
 
 		 254 aa  43.1  0.006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.585621  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0096  ABC-2 type transporter  31.6 
 
 		 247 aa  42.7  0.007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0790  hypothetical protein  29.23 
 
 		 276 aa  42.4  0.008  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.883996 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2356  ABC-2 type transporter  28.67 
 
 		 286 aa  42  0.01  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.328671  normal  0.119199 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>