62 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_3260 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013595  Sros_3260  hypothetical protein  100 
 
 
300 aa  595  1e-169  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.913929  normal  0.957534 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0041  aminoglycoside phosphotransferase  76.82 
 
 
299 aa  444  1.0000000000000001e-124  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0393  aminoglycoside phosphotransferase  77.52 
 
 
301 aa  393  1e-108  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.948995  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1324  aminoglycoside phosphotransferase  76.01 
 
 
305 aa  377  1e-103  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.547927  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0209  aminoglycoside phosphotransferase  53.97 
 
 
303 aa  261  8.999999999999999e-69  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1996  aminoglycoside phosphotransferase  54.3 
 
 
301 aa  248  7e-65  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.291858  normal  0.365925 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2104  aminoglycoside phosphotransferase  54.79 
 
 
305 aa  234  1.0000000000000001e-60  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.714313  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1948  aminoglycoside phosphotransferase  43.35 
 
 
293 aa  180  2e-44  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.013285 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3611  aminoglycoside phosphotransferase  39.3 
 
 
294 aa  168  9e-41  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5725  aminoglycoside phosphotransferase  37.88 
 
 
287 aa  163  4.0000000000000004e-39  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0907707  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1003  aminoglycoside phosphotransferase  35.67 
 
 
291 aa  155  8e-37  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4220  aminoglycoside phosphotransferase  38.38 
 
 
315 aa  153  2.9999999999999998e-36  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.24311 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1715  aminoglycoside phosphotransferase  41.54 
 
 
298 aa  152  5.9999999999999996e-36  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.39264 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4227  aminoglycoside phosphotransferase  38.66 
 
 
303 aa  152  5.9999999999999996e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0563454  normal  0.0191477 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5350  aminoglycoside phosphotransferase  39.55 
 
 
303 aa  150  3e-35  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0776813  normal  0.0441787 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13254  transferase  39.69 
 
 
474 aa  149  8e-35  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.323872  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2694  aminoglycoside phosphotransferase  35.53 
 
 
310 aa  148  9e-35  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4097  aminoglycoside phosphotransferase  38.49 
 
 
300 aa  146  4.0000000000000006e-34  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.402369  normal  0.57426 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4507  aminoglycoside phosphotransferase  36.9 
 
 
305 aa  145  8.000000000000001e-34  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0298269 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5432  aminoglycoside phosphotransferase  38.75 
 
 
299 aa  144  1e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.583011 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_14460  predicted aminoglycoside phosphotransferase  38.24 
 
 
303 aa  142  6e-33  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.25682  normal  0.25424 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2894  aminoglycoside phosphotransferase family protein  34.33 
 
 
292 aa  141  9.999999999999999e-33  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.5849  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3111  aminoglycoside phosphotransferase family protein  34.33 
 
 
292 aa  141  9.999999999999999e-33  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16270  predicted aminoglycoside phosphotransferase  36.57 
 
 
329 aa  141  9.999999999999999e-33  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.544506  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2137  aminoglycoside phosphotransferase family protein  35.21 
 
 
293 aa  140  1.9999999999999998e-32  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0596  hypothetical protein  33.33 
 
 
293 aa  139  3.9999999999999997e-32  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3114  aminoglycoside phosphotransferase family protein  33.96 
 
 
292 aa  139  6e-32  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4212  aminoglycoside phosphotransferase  35.09 
 
 
302 aa  137  1e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.429799  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3100  aminoglycoside phosphotransferase family protein  34.83 
 
 
292 aa  135  9.999999999999999e-31  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2863  phosphotransferase family protein  33.58 
 
 
292 aa  135  9.999999999999999e-31  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2889  aminoglycoside phosphotransferase  34.17 
 
 
292 aa  134  1.9999999999999998e-30  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.181023  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2781  aminoglycoside phosphotransferase  36.23 
 
 
299 aa  134  1.9999999999999998e-30  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.907134  n/a   
 
 
-
 
NC_006365  plpp0116  hypothetical protein  35.71 
 
 
534 aa  132  1.0000000000000001e-29  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3344  aminoglycoside phosphotransferase  36.54 
 
 
296 aa  128  1.0000000000000001e-28  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.0459569 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2351  aminoglycoside phosphotransferase  34.59 
 
 
332 aa  127  3e-28  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1902  aminoglycoside phosphotransferase  39.24 
 
 
323 aa  122  8e-27  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1967  aminoglycoside phosphotransferase  36.9 
 
 
299 aa  118  1.9999999999999998e-25  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.15745  normal  0.449635 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0072  aminoglycoside phosphotransferase  36.15 
 
 
324 aa  117  3e-25  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  hitchhiker  0.00601594  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4129  aminoglycoside phosphotransferase  35.82 
 
 
339 aa  108  1e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.753306  normal  0.346085 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5153  aminoglycoside phosphotransferase  31.82 
 
 
302 aa  107  3e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.325444  normal  0.0433393 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4721  aminoglycoside phosphotransferase  31.75 
 
 
293 aa  101  1e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4063  aminoglycoside phosphotransferase  29.26 
 
 
297 aa  88.6  1e-16  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.32149  normal  0.620997 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2713  NB-ARC domain protein  63.49 
 
 
838 aa  85.9  8e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.0000220271  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2624  aminoglycoside phosphotransferase  30.28 
 
 
319 aa  80.1  0.00000000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000546322  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3990  aminoglycoside phosphotransferase  27.95 
 
 
299 aa  70.5  0.00000000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2507  hypothetical protein  42.05 
 
 
213 aa  69.3  0.00000000008  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4461  aminoglycoside phosphotransferase  28.1 
 
 
298 aa  63.2  0.000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4473  aminoglycoside phosphotransferase  35.82 
 
 
270 aa  59.7  0.00000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1900  kanamycin kinase (aminoglycoside phosphotransferase, gentamicin resistance protein)  22.88 
 
 
293 aa  59.3  0.00000008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2179  6'-aminoglycoside N-acetyltransferase/2''-aminoglycoside phosphotransferase, putative  22.55 
 
 
293 aa  58.9  0.00000009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.174828  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1911  aminoglycoside phophotransferase family protein  24.43 
 
 
293 aa  55.8  0.0000008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0214215  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2024  hypothetical protein  29.56 
 
 
333 aa  53.9  0.000004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.010627  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20250  predicted aminoglycoside phosphotransferase  28.51 
 
 
315 aa  53.1  0.000005  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.227699  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1717  aminoglycoside phosphotransferase  27.42 
 
 
267 aa  50.4  0.00004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008539  Arth_4256  aminoglycoside phosphotransferase  28.5 
 
 
273 aa  48.9  0.0001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5102  hypothetical protein  40.98 
 
 
319 aa  47.4  0.0003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0159  aminoglycoside 3'-phosphotransferase  25.27 
 
 
271 aa  47.4  0.0003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.193227  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2472  aminoglycoside phosphotransferase  29.61 
 
 
312 aa  47.4  0.0003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0185974  hitchhiker  0.00725636 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1195  hypothetical protein  37.74 
 
 
482 aa  43.5  0.004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0940  aminoglycoside phosphotransferase  29.23 
 
 
293 aa  43.5  0.005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.587113  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1322  aminoglycoside phosphotransferase  44.12 
 
 
313 aa  42.7  0.008  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.92543  normal  0.0124047 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2343  aminoglycoside phosphotransferase  25.08 
 
 
294 aa  42.7  0.008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.523631  normal  0.421232 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>