47 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sputcn32_2979 on replicon NC_009438
Organism: Shewanella putrefaciens CN-32



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009438  Sputcn32_2979  extracellular solute-binding protein  100 
 
 		 285 aa  592  1e-168  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1011  extracellular solute-binding protein  77.46 
 
 		 285 aa  462  1e-129  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1032  extracellular solute-binding protein family 3  77.46 
 
 		 285 aa  461  1e-129  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.267396 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1044  extracellular solute-binding protein  75.79 
 
 		 286 aa  450  1e-125  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.523341 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3328  extracellular solute-binding protein  75.79 
 
 		 286 aa  447  1.0000000000000001e-124  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3247  extracellular solute-binding protein  71.96 
 
 		 285 aa  412  1e-114  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0876  extracellular solute-binding protein  71.27 
 
 		 285 aa  409  1e-113  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3146  extracellular solute-binding protein  70.9 
 
 		 285 aa  407  1.0000000000000001e-112  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3307  extracellular solute-binding protein  61.29 
 
 		 286 aa  322  6e-87  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2915  extracellular solute-binding protein  55.32 
 
 		 270 aa  266  4e-70  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.418761 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03935  ABC-type amino acid transport/signal transduction system  37.39 
 
 		 229 aa  143  3e-33  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3190  extracellular solute-binding protein  34.23 
 
 		 226 aa  139  4.999999999999999e-32  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.0211783 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3620  amino acid ABC transporter periplasmic protein  32.3 
 
 		 278 aa  133  3.9999999999999996e-30  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0704  putative amino acid-binding protein  37.55 
 
 		 257 aa  132  9e-30  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.440677  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3196  hypothetical protein  33.33 
 
 		 322 aa  130  2.0000000000000002e-29  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.144092 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2793  putative amino acid-binding protein  32.62 
 
 		 231 aa  128  1.0000000000000001e-28  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.287982  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4021  ABC-type amino acid transport/signal transduction system  32.89 
 
 		 241 aa  122  8e-27  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4114  ABC-type amino acid transport/signal transduction system  32.44 
 
 		 241 aa  120  3e-26  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3921  extracellular solute-binding protein family 3  32.44 
 
 		 241 aa  120  3e-26  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3998  ABC-type amino acid transport/signal transduction system  32.44 
 
 		 241 aa  120  3e-26  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3276  ABC-type amino acid transport/signal transduction system  33.33 
 
 		 247 aa  119  3.9999999999999996e-26  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0850  hypothetical protein  34.08 
 
 		 275 aa  117  1.9999999999999998e-25  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000173614  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1807  extracellular solute-binding protein  31.82 
 
 		 260 aa  114  2.0000000000000002e-24  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2865  Signal transduction histidine kinase-like protein  28.24 
 
 		 2213 aa  113  4.0000000000000004e-24  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000726448 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3920  putative amino acid-binding protein  32.9 
 
 		 246 aa  112  1.0000000000000001e-23  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0551  hypothetical protein  31.58 
 
 		 257 aa  106  4e-22  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.831394  decreased coverage  0.00317207 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3588  hypothetical protein  28.95 
 
 		 247 aa  99.4  5e-20  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.623219  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0627  ABC-type amino acid transport/signal transduction systems  30.33 
 
 		 280 aa  92  1e-17  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.225445  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1591  amino acid ABC transporter periplasmic protein  28.96 
 
 		 230 aa  89  8e-17  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.115336  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1048  ABC-type amino acid transport/signal transduction systems  27.83 
 
 		 260 aa  85.1  0.000000000000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.163462 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3267  ABC-type amino acid transport/signal transduction system  28.31 
 
 		 260 aa  74.7  0.000000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1085  hypothetical protein  23.75 
 
 		 264 aa  52.4  0.000008  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.113674  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1085  hypothetical protein  24.67 
 
 		 264 aa  51.6  0.00001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0391886  normal  0.830979 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1151  hypothetical protein  24.34 
 
 		 264 aa  52  0.00001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000453875  normal  0.246745 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2369  ABC-type amino acid transport/signal transduction system  25.76 
 
 		 233 aa  51.2  0.00002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0260  putative amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  23.53 
 
 		 243 aa  50.8  0.00003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.906193  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4388  amino acid ABC transporter  26.67 
 
 		 259 aa  50.1  0.00004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000078049 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0421  extracellular solute-binding protein  22.92 
 
 		 252 aa  48.1  0.0001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3146  extracellular solute-binding protein family 3  24.68 
 
 		 288 aa  46.6  0.0005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1202  extracellular solute-binding protein family 3  21.84 
 
 		 264 aa  46.2  0.0007  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00000133475  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0592  amino acid ABC transporter, permease/substrate-binding lipoprotein  23.77 
 
 		 252 aa  45.8  0.0007  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000143889  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3312  hypothetical protein  21.46 
 
 		 264 aa  44.3  0.003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000132852  normal  0.0735869 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3169  hypothetical protein  21.46 
 
 		 264 aa  43.9  0.003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000178583  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0823  extracellular solute-binding protein  23.87 
 
 		 270 aa  43.5  0.004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.457883  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1869  extracellular solute-binding protein family 3  20.85 
 
 		 272 aa  43.5  0.004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.000000000802311  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3168  hypothetical protein  21.07 
 
 		 264 aa  42.4  0.009  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000679304  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2669  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  24.81 
 
 		 1047 aa  42  0.01  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>