70 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spro_4304 on replicon NC_009832
Organism: Serratia proteamaculans 568



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009832  Spro_4304  aromatic amino acid permease  100 
 
 		 414 aa  823    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1351  aromatic amino acid transporter  70.48 
 
 		 418 aa  568  1e-161  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15700  putative amino acid permease  69.97 
 
 		 418 aa  564  1e-160  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.328993  hitchhiker  0.00000000000353656 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_39750  putative amino acid permease  55.73 
 
 		 410 aa  441  9.999999999999999e-123  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0459  Amino acid transporter transmembrane  25.75 
 
 		 386 aa  115  1.0000000000000001e-24  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0692  hypothetical protein  24.12 
 
 		 396 aa  77.4  0.0000000000004  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0710  hypothetical protein  24.12 
 
 		 396 aa  77  0.0000000000006  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2152  tyrosine-specific transport protein  26.36 
 
 		 422 aa  73.6  0.000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000000000242218 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2099  tyrosine-specific transport protein  26.36 
 
 		 422 aa  73.6  0.000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  1.23753e-19 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1307  tyrosine-specific transport protein  26.36 
 
 		 422 aa  73.6  0.000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000107929 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2092  tyrosine-specific transport protein  26.36 
 
 		 422 aa  73.2  0.000000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0842051  hitchhiker  0.0000739999 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1184  tyrosine-specific transport protein  26.36 
 
 		 422 aa  72  0.00000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.135204  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0691  hypothetical protein  23.43 
 
 		 398 aa  68.9  0.0000000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1034  tyrosine-specific transport protein  26.23 
 
 		 403 aa  68.6  0.0000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000000311327  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0709  hypothetical protein  23.43 
 
 		 398 aa  68.9  0.0000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1276  tyrosine-specific transport protein  26.23 
 
 		 403 aa  67.4  0.0000000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00001928  hitchhiker  0.0000367731 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1736  aromatic amino acid transporter  26.23 
 
 		 403 aa  67.4  0.0000000004  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000018039  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01875  tyrosine transporter  26.23 
 
 		 403 aa  66.6  0.0000000008  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0104717  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2140  tyrosine-specific transport protein  26.23 
 
 		 403 aa  66.6  0.0000000008  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000592969  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01864  hypothetical protein  26.23 
 
 		 403 aa  66.6  0.0000000008  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00693993  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1729  aromatic amino acid transporter  26.23 
 
 		 403 aa  66.6  0.0000000008  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000563721  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2005  tyrosine-specific transport protein  26.23 
 
 		 403 aa  66.6  0.0000000008  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000529329  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2647  tyrosine-specific transport protein  26.23 
 
 		 403 aa  66.2  0.000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.588852  hitchhiker  0.0000000318595 
 
 
-
 
NC_002620  TC0204  Mtr/TnaB/TyrO permease family protein  23.69 
 
 		 398 aa  62  0.00000002  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3298  tyrosine-specific transport protein  25.71 
 
 		 388 aa  61.6  0.00000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3197  aromatic amino acid transporter  24.24 
 
 		 402 aa  59.3  0.0000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_10137  HAAAP family transporter: tyrosine/tryptophan  25.25 
 
 		 414 aa  59.3  0.0000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.000465151  normal  0.0223874 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1118  aromatic amino acid transporter  24.03 
 
 		 402 aa  58.5  0.0000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2774  tyrosine-specific transport protein  24.93 
 
 		 402 aa  57.8  0.0000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2853  aromatic amino acid transporter  24.93 
 
 		 402 aa  57.8  0.0000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1318  tyrosine-specific transport protein  24.93 
 
 		 402 aa  57.8  0.0000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009371  OSTLU_47852  HAAAP family transporter: tyrosine  22.9 
 
 		 534 aa  57.4  0.0000004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  unclonable  0.00117106 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2489  aromatic amino acid transporter  25.15 
 
 		 425 aa  57.4  0.0000005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1562  tryptophan-specific transport protein  23.51 
 
 		 416 aa  56.2  0.000001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  unclonable  0.000000304843  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3479  aromatic amino acid transport protein  25.26 
 
 		 418 aa  55.8  0.000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.598645 
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_36976  predicted protein  23.71 
 
 		 511 aa  53.1  0.000009  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0712  tyrosine-specific transport protein  24.01 
 
 		 400 aa  52.8  0.00001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1031  aromatic amino acid transporter  25.13 
 
 		 425 aa  52.4  0.00001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3188  aromatic amino acid permease  22.19 
 
 		 395 aa  51.6  0.00002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.497864  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3276  aromatic amino acid transporter  24.71 
 
 		 402 aa  51.2  0.00004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0182  aromatic amino acid transporter  22.45 
 
 		 418 aa  50.4  0.00005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2697  tryptophan-specific transport protein  21.58 
 
 		 414 aa  50.4  0.00005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2776  aromatic amino acid transporter  21.58 
 
 		 414 aa  50.4  0.00005  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6222  tryptophan permease  24.48 
 
 		 467 aa  48.5  0.0002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0202  aromatic amino acid transporter  22.45 
 
 		 418 aa  48.1  0.0003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_71710  tryptophan permease  23.96 
 
 		 417 aa  47.4  0.0005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.268423  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1118  tryptophan-specific transport protein  23.98 
 
 		 411 aa  47  0.0006  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4176  aromatic amino acid transporter  23.06 
 
 		 418 aa  46.6  0.0009  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0574  aromatic amino acid permease  23.04 
 
 		 400 aa  46.2  0.001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3787  aromatic amino acid transporter  23.29 
 
 		 418 aa  45.8  0.001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0641  aromatic amino acid permease  22.73 
 
 		 399 aa  45.4  0.002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4108  aromatic amino acid transporter  22.8 
 
 		 418 aa  45.4  0.002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4307  aromatic amino acid transporter  22.8 
 
 		 418 aa  45.8  0.002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.257824 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3987  aromatic amino acid transporter  23.36 
 
 		 418 aa  45.1  0.002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0158  aromatic amino acid transporter  22.8 
 
 		 418 aa  45.4  0.002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3531  aromatic amino acid transporter  22.6 
 
 		 418 aa  45.4  0.002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3860  aromatic amino acid transporter  23.29 
 
 		 418 aa  45.1  0.002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0526  aromatic amino acid transporter  24.86 
 
 		 400 aa  45.1  0.002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.560578  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3465  aromatic amino acid permease  24.46 
 
 		 391 aa  45.1  0.003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.230898  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1511  tryptophan-specific transport protein  21.81 
 
 		 412 aa  44.3  0.004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3598  tryptophan permease  21.73 
 
 		 414 aa  43.9  0.005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0157208 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3513  aromatic amino acid transport protein  21.15 
 
 		 417 aa  43.9  0.005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0190  putative amino acid/amine transport protein  21.39 
 
 		 452 aa  43.9  0.006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4601  tryptophan-specific transport protein  22.99 
 
 		 414 aa  43.9  0.006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3535  tryptophan permease  22.86 
 
 		 414 aa  43.5  0.006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0897  aromatic amino acid permease  24.46 
 
 		 391 aa  43.5  0.006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1774  tyrosine-specific transport protein (tyrosine permease)  22.25 
 
 		 390 aa  43.5  0.008  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3389  aromatic amino acid permease  24.19 
 
 		 395 aa  43.1  0.008  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3572  tryptophan permease  23.9 
 
 		 414 aa  43.1  0.009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3588  aromatic amino acid permease  24.19 
 
 		 391 aa  43.1  0.009  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.281237  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>