129 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATR_36976 on replicon NC_011679
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011679  PHATR_36976  predicted protein  100 
 
 		 511 aa  1021    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_10137  HAAAP family transporter: tyrosine/tryptophan  34.79 
 
 		 414 aa  208  2e-52  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.000465151  normal  0.0223874 
 
 
-
 
NC_009371  OSTLU_47852  HAAAP family transporter: tyrosine  30.18 
 
 		 534 aa  166  1.0000000000000001e-39  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  unclonable  0.00117106 
 
 
-
 
NC_002620  TC0204  Mtr/TnaB/TyrO permease family protein  32.56 
 
 		 398 aa  161  2e-38  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0205  Mtr/TnaB/TyrO permease family protein  32.16 
 
 		 395 aa  141  3e-32  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.702392  n/a   
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_42458  HAAAP family transporter: tyrosine  31.25 
 
 		 408 aa  135  1.9999999999999998e-30  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0166063  normal  0.266354 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1925  aromatic amino acid transporter  29.77 
 
 		 395 aa  120  6e-26  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.00166231  normal  0.036415 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2426  aromatic amino acid transporter  29.52 
 
 		 395 aa  119  9.999999999999999e-26  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.392601  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2544  aromatic amino acid transporter  29.52 
 
 		 395 aa  118  1.9999999999999998e-25  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.487399  decreased coverage  0.00912111 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2433  aromatic amino acid transporter  29.87 
 
 		 395 aa  115  1.0000000000000001e-24  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.485869  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0712  tyrosine-specific transport protein  28.95 
 
 		 400 aa  113  7.000000000000001e-24  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0692  hypothetical protein  28.27 
 
 		 396 aa  112  2.0000000000000002e-23  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0710  hypothetical protein  28.27 
 
 		 396 aa  111  3e-23  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3995  aromatic amino acid transporter  27.57 
 
 		 418 aa  111  3e-23  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2186  aromatic amino acid transporter  29.35 
 
 		 395 aa  111  4.0000000000000004e-23  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.338137  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0709  hypothetical protein  28.53 
 
 		 398 aa  110  7.000000000000001e-23  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0511  putative tyrosine-specific transport protein  30.16 
 
 		 400 aa  110  7.000000000000001e-23  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0691  hypothetical protein  28.53 
 
 		 398 aa  109  1e-22  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0526  aromatic amino acid transporter  31.02 
 
 		 400 aa  108  2e-22  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.560578  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3513  aromatic amino acid transport protein  27.89 
 
 		 417 aa  108  3e-22  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4176  aromatic amino acid transporter  28.04 
 
 		 418 aa  108  3e-22  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4307  aromatic amino acid transporter  28.04 
 
 		 418 aa  107  4e-22  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.257824 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0262  aromatic amino acid transporter  29 
 
 		 418 aa  107  5e-22  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1774  tyrosine-specific transport protein (tyrosine permease)  27.25 
 
 		 390 aa  107  6e-22  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4108  aromatic amino acid transporter  27.78 
 
 		 418 aa  106  9e-22  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3298  tyrosine-specific transport protein  30.34 
 
 		 388 aa  105  1e-21  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3860  aromatic amino acid transporter  27.79 
 
 		 418 aa  106  1e-21  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0182  aromatic amino acid transporter  27.07 
 
 		 418 aa  105  1e-21  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003573  tyrosine-specific transport protein  28.85 
 
 		 380 aa  105  2e-21  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1792  aromatic amino acid transporter  28.57 
 
 		 395 aa  105  2e-21  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3787  aromatic amino acid transporter  27.18 
 
 		 418 aa  105  2e-21  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1846  aromatic amino acid transporter  28.83 
 
 		 395 aa  105  2e-21  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.510263 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3987  aromatic amino acid transporter  27.18 
 
 		 418 aa  105  2e-21  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4601  tryptophan-specific transport protein  26.82 
 
 		 414 aa  104  4e-21  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0158  aromatic amino acid transporter  27.51 
 
 		 418 aa  103  5e-21  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1562  tryptophan-specific transport protein  26.37 
 
 		 416 aa  103  7e-21  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  unclonable  0.000000304843  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3778  aromatic amino acid transporter  26.81 
 
 		 418 aa  103  7e-21  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2697  tryptophan-specific transport protein  26.18 
 
 		 414 aa  103  9e-21  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0202  aromatic amino acid transporter  26.51 
 
 		 418 aa  102  1e-20  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2776  aromatic amino acid transporter  26.18 
 
 		 414 aa  102  1e-20  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2065  tyrosine-specific transport protein  27.7 
 
 		 395 aa  102  2e-20  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1031  aromatic amino acid transporter  29.02 
 
 		 425 aa  102  2e-20  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3531  aromatic amino acid transporter  27.78 
 
 		 418 aa  102  2e-20  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0991  tryptophan permease  27.2 
 
 		 424 aa  102  2e-20  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3236  aromatic amino acid transporter  26.25 
 
 		 414 aa  102  2e-20  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000036044 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2185  aromatic amino acid transporter  28.06 
 
 		 395 aa  100  6e-20  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.135373  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1034  tyrosine-specific transport protein  29.05 
 
 		 403 aa  100  8e-20  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000000311327  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3197  aromatic amino acid transporter  29.1 
 
 		 402 aa  99.8  1e-19  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02530  hypothetical protein  29.28 
 
 		 361 aa  99.8  1e-19  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0641  aromatic amino acid permease  28.93 
 
 		 399 aa  99.8  1e-19  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1118  aromatic amino acid transporter  28.81 
 
 		 402 aa  98.2  3e-19  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0755  tryptophan permease  27.22 
 
 		 424 aa  98.2  3e-19  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01875  tyrosine transporter  29.05 
 
 		 403 aa  97.8  4e-19  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0104717  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2647  tyrosine-specific transport protein  29.05 
 
 		 403 aa  97.8  4e-19  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.588852  hitchhiker  0.0000000318595 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01864  hypothetical protein  29.05 
 
 		 403 aa  97.8  4e-19  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00693993  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2005  tyrosine-specific transport protein  29.05 
 
 		 403 aa  97.8  4e-19  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000529329  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2140  tyrosine-specific transport protein  29.05 
 
 		 403 aa  97.8  4e-19  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000592969  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1729  aromatic amino acid transporter  29.05 
 
 		 403 aa  97.8  4e-19  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000563721  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1736  aromatic amino acid transporter  29.05 
 
 		 403 aa  97.4  5e-19  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000018039  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1276  tyrosine-specific transport protein  29.05 
 
 		 403 aa  97.4  5e-19  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00001928  hitchhiker  0.0000367731 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06320  hypothetical protein  27.81 
 
 		 385 aa  97.1  7e-19  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1511  tryptophan-specific transport protein  26.12 
 
 		 412 aa  96.3  1e-18  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6222  tryptophan permease  25.79 
 
 		 467 aa  94.4  4e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001420  tyrosine-specific transport protein  27.73 
 
 		 385 aa  94.4  5e-18  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1307  tyrosine-specific transport protein  28.31 
 
 		 422 aa  93.2  1e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000107929 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4434  aromatic amino acid transporter  29.17 
 
 		 400 aa  93.2  1e-17  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2099  tyrosine-specific transport protein  28.31 
 
 		 422 aa  93.2  1e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  1.23753e-19 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2152  tyrosine-specific transport protein  28.31 
 
 		 422 aa  93.2  1e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000000000242218 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1184  tyrosine-specific transport protein  28.53 
 
 		 422 aa  92.4  2e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.135204  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2092  tyrosine-specific transport protein  28.31 
 
 		 422 aa  92.4  2e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0842051  hitchhiker  0.0000739999 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_71710  tryptophan permease  25.26 
 
 		 417 aa  91.7  3e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.268423  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0097  aromatic amino acid transporter  27.27 
 
 		 419 aa  91.7  3e-17  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.103921  normal  0.507347 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3188  aromatic amino acid permease  26.3 
 
 		 395 aa  91.7  3e-17  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.497864  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2774  tyrosine-specific transport protein  28.65 
 
 		 402 aa  91.7  3e-17  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1318  tyrosine-specific transport protein  28.65 
 
 		 402 aa  91.7  3e-17  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2853  aromatic amino acid transporter  28.65 
 
 		 402 aa  91.7  3e-17  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0780  tyrosine-specific transport protein  28.35 
 
 		 403 aa  91.3  4e-17  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  decreased coverage  0.0000892482  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3276  aromatic amino acid transporter  29.75 
 
 		 402 aa  90.1  8e-17  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0574  aromatic amino acid permease  27.89 
 
 		 400 aa  89.7  1e-16  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03593  tryptophan transporter of low affinity  25.53 
 
 		 415 aa  89  2e-16  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3923  tryptophan permease TnaB  25.53 
 
 		 415 aa  89  2e-16  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4218  tryptophan permease TnaB  25.53 
 
 		 415 aa  89  2e-16  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5140  tryptophan permease TnaB  25.53 
 
 		 415 aa  88.6  2e-16  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.406172 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4285  tryptophan permease TnaB  25.53 
 
 		 415 aa  89  2e-16  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03537  hypothetical protein  25.53 
 
 		 415 aa  89  2e-16  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4258  aromatic amino acid transporter  25.53 
 
 		 415 aa  88.2  3e-16  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1723  tryptophan/tyrosine permease family protein  27.89 
 
 		 424 aa  87  6e-16  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0448  tyrosine-specific transport protein  27.89 
 
 		 426 aa  87  8e-16  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1135  aromatic amino acid transporter  25.97 
 
 		 409 aa  86.7  0.000000000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.55679  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2489  aromatic amino acid transporter  28.25 
 
 		 425 aa  86.7  0.000000000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3479  aromatic amino acid transport protein  29.27 
 
 		 418 aa  84.7  0.000000000000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.598645 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4213  tryptophan permease TnaB  25.53 
 
 		 413 aa  85.1  0.000000000000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3634  tryptophan permease  26.86 
 
 		 414 aa  83.6  0.000000000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3572  tryptophan permease  26.6 
 
 		 414 aa  82.8  0.00000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3466  tryptophan permease  26.78 
 
 		 414 aa  82.8  0.00000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3535  tryptophan permease  26.6 
 
 		 414 aa  82.8  0.00000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3466  tryptophan permease  26.78 
 
 		 414 aa  82  0.00000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0683  aromatic amino acid permease  28.16 
 
 		 399 aa  81.3  0.00000000000004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.205009  n/a   
 
 
-
 
NC_011676  PHATRDRAFT_45852  predicted protein  26.55 
 
 		 536 aa  81.3  0.00000000000004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0205914  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3611  tryptophan permease  25.07 
 
 		 414 aa  80.1  0.00000000000009  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>