133 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TC0204 on replicon NC_002620
Organism: Chlamydia muridarum Nigg



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002620  TC0204  Mtr/TnaB/TyrO permease family protein  100 
 
 		 398 aa  794    Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0205  Mtr/TnaB/TyrO permease family protein  61.52 
 
 		 395 aa  470  1.0000000000000001e-131  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.702392  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0691  hypothetical protein  34.86 
 
 		 398 aa  167  4e-40  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0709  hypothetical protein  34.86 
 
 		 398 aa  166  5.9999999999999996e-40  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0692  hypothetical protein  28.64 
 
 		 396 aa  164  2.0000000000000002e-39  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0710  hypothetical protein  28.4 
 
 		 396 aa  162  1e-38  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0712  tyrosine-specific transport protein  31.94 
 
 		 400 aa  151  2e-35  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1034  tyrosine-specific transport protein  30.51 
 
 		 403 aa  147  3e-34  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000000311327  n/a   
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_36976  predicted protein  32.45 
 
 		 511 aa  147  4.0000000000000006e-34  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1736  aromatic amino acid transporter  30.33 
 
 		 403 aa  145  9e-34  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000018039  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1276  tyrosine-specific transport protein  30.33 
 
 		 403 aa  145  9e-34  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00001928  hitchhiker  0.0000367731 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01875  tyrosine transporter  30.33 
 
 		 403 aa  144  2e-33  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0104717  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01864  hypothetical protein  30.33 
 
 		 403 aa  144  2e-33  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00693993  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2005  tyrosine-specific transport protein  30.33 
 
 		 403 aa  144  2e-33  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000529329  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2140  tyrosine-specific transport protein  30.33 
 
 		 403 aa  144  2e-33  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000592969  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1729  aromatic amino acid transporter  30.33 
 
 		 403 aa  144  2e-33  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000563721  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3197  aromatic amino acid transporter  31.18 
 
 		 402 aa  144  3e-33  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2647  tyrosine-specific transport protein  30.08 
 
 		 403 aa  144  3e-33  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.588852  hitchhiker  0.0000000318595 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1118  aromatic amino acid transporter  29.71 
 
 		 402 aa  143  6e-33  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2489  aromatic amino acid transporter  32.25 
 
 		 425 aa  140  3.9999999999999997e-32  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1723  tryptophan/tyrosine permease family protein  32.21 
 
 		 424 aa  139  7.999999999999999e-32  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_10137  HAAAP family transporter: tyrosine/tryptophan  27.95 
 
 		 414 aa  139  8.999999999999999e-32  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.000465151  normal  0.0223874 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1774  tyrosine-specific transport protein (tyrosine permease)  30.14 
 
 		 390 aa  139  1e-31  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0448  tyrosine-specific transport protein  32.21 
 
 		 426 aa  139  1e-31  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1307  tyrosine-specific transport protein  29.97 
 
 		 422 aa  137  2e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000107929 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2099  tyrosine-specific transport protein  29.97 
 
 		 422 aa  137  2e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  1.23753e-19 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2152  tyrosine-specific transport protein  29.97 
 
 		 422 aa  137  2e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000000000242218 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2092  tyrosine-specific transport protein  30.41 
 
 		 422 aa  138  2e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0842051  hitchhiker  0.0000739999 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0526  aromatic amino acid transporter  31.53 
 
 		 400 aa  138  2e-31  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.560578  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2774  tyrosine-specific transport protein  29.77 
 
 		 402 aa  137  3.0000000000000003e-31  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1318  tyrosine-specific transport protein  29.77 
 
 		 402 aa  137  3.0000000000000003e-31  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2853  aromatic amino acid transporter  29.77 
 
 		 402 aa  137  3.0000000000000003e-31  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1184  tyrosine-specific transport protein  30.6 
 
 		 422 aa  137  4e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.135204  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1846  aromatic amino acid transporter  29.41 
 
 		 395 aa  134  3e-30  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.510263 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2185  aromatic amino acid transporter  29.72 
 
 		 395 aa  134  3.9999999999999996e-30  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.135373  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0511  putative tyrosine-specific transport protein  30.52 
 
 		 400 aa  133  5e-30  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4601  tryptophan-specific transport protein  27.82 
 
 		 414 aa  133  6.999999999999999e-30  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2065  tyrosine-specific transport protein  29.17 
 
 		 395 aa  132  7.999999999999999e-30  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1792  aromatic amino acid transporter  29.16 
 
 		 395 aa  132  1.0000000000000001e-29  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003573  tyrosine-specific transport protein  29.92 
 
 		 380 aa  132  1.0000000000000001e-29  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3276  aromatic amino acid transporter  30.36 
 
 		 402 aa  131  2.0000000000000002e-29  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0780  tyrosine-specific transport protein  29.75 
 
 		 403 aa  131  3e-29  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  decreased coverage  0.0000892482  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1562  tryptophan-specific transport protein  29.57 
 
 		 416 aa  130  3e-29  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  unclonable  0.000000304843  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3188  aromatic amino acid permease  28.82 
 
 		 395 aa  131  3e-29  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.497864  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2426  aromatic amino acid transporter  27.74 
 
 		 395 aa  130  3e-29  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.392601  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1925  aromatic amino acid transporter  27.48 
 
 		 395 aa  130  5.0000000000000004e-29  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.00166231  normal  0.036415 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0641  aromatic amino acid permease  28.53 
 
 		 399 aa  130  5.0000000000000004e-29  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2544  aromatic amino acid transporter  27.23 
 
 		 395 aa  129  1.0000000000000001e-28  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.487399  decreased coverage  0.00912111 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3787  aromatic amino acid transporter  27.03 
 
 		 418 aa  128  2.0000000000000002e-28  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3860  aromatic amino acid transporter  27.03 
 
 		 418 aa  127  2.0000000000000002e-28  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3987  aromatic amino acid transporter  27.03 
 
 		 418 aa  128  2.0000000000000002e-28  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2433  aromatic amino acid transporter  26.95 
 
 		 395 aa  127  3e-28  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.485869  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2186  aromatic amino acid transporter  27.3 
 
 		 395 aa  126  5e-28  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.338137  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2776  aromatic amino acid transporter  28.2 
 
 		 414 aa  126  7e-28  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3778  aromatic amino acid transporter  27.79 
 
 		 418 aa  126  8.000000000000001e-28  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3513  aromatic amino acid transport protein  28.39 
 
 		 417 aa  125  1e-27  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3298  tyrosine-specific transport protein  30.46 
 
 		 388 aa  125  2e-27  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0158  aromatic amino acid transporter  28.35 
 
 		 418 aa  124  2e-27  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4176  aromatic amino acid transporter  27.56 
 
 		 418 aa  125  2e-27  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02530  hypothetical protein  30.59 
 
 		 361 aa  125  2e-27  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3995  aromatic amino acid transporter  29.76 
 
 		 418 aa  124  2e-27  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4307  aromatic amino acid transporter  27.03 
 
 		 418 aa  124  2e-27  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.257824 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4108  aromatic amino acid transporter  27.03 
 
 		 418 aa  124  3e-27  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009371  OSTLU_47852  HAAAP family transporter: tyrosine  27 
 
 		 534 aa  122  8e-27  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  unclonable  0.00117106 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2697  tryptophan-specific transport protein  27.94 
 
 		 414 aa  122  9e-27  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3236  aromatic amino acid transporter  26.89 
 
 		 414 aa  122  9e-27  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000036044 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4434  aromatic amino acid transporter  30.4 
 
 		 400 aa  122  9e-27  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1511  tryptophan-specific transport protein  27.94 
 
 		 412 aa  119  9e-26  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3479  aromatic amino acid transport protein  30.43 
 
 		 418 aa  115  1.0000000000000001e-24  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.598645 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0182  aromatic amino acid transporter  27.11 
 
 		 418 aa  115  1.0000000000000001e-24  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001420  tyrosine-specific transport protein  30.83 
 
 		 385 aa  112  1.0000000000000001e-23  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0262  aromatic amino acid transporter  27.34 
 
 		 418 aa  110  5e-23  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06320  hypothetical protein  28.76 
 
 		 385 aa  110  6e-23  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0683  aromatic amino acid permease  29.55 
 
 		 399 aa  107  4e-22  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.205009  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1031  aromatic amino acid transporter  27.2 
 
 		 425 aa  106  7e-22  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0202  aromatic amino acid transporter  27.01 
 
 		 418 aa  105  9e-22  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3531  aromatic amino acid transporter  26.63 
 
 		 418 aa  105  1e-21  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3389  aromatic amino acid permease  29.46 
 
 		 395 aa  105  1e-21  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1337  tyrosine-specific transport protein (tyrosine permease)  28.04 
 
 		 384 aa  105  1e-21  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1166  tyrosine-specific transport protein  29.11 
 
 		 405 aa  104  2e-21  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0574  aromatic amino acid permease  26.68 
 
 		 400 aa  104  2e-21  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1135  aromatic amino acid transporter  27.08 
 
 		 409 aa  104  2e-21  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.55679  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3588  aromatic amino acid permease  28.28 
 
 		 391 aa  104  3e-21  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.281237  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3465  aromatic amino acid permease  28.24 
 
 		 391 aa  102  9e-21  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.230898  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0916  aromatic amino acid permease  31.09 
 
 		 395 aa  102  1e-20  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1074  tyrosine-specific transport protein, putative  29.2 
 
 		 395 aa  101  2e-20  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0800  tryptophan permease  27.59 
 
 		 409 aa  102  2e-20  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.121788  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3026  aromatic amino acid permease  28.8 
 
 		 391 aa  102  2e-20  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0897  aromatic amino acid permease  28.24 
 
 		 391 aa  101  2e-20  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0948  aromatic amino acid permease  28.53 
 
 		 391 aa  100  4e-20  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0522769 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0912  aromatic amino acid permease  28.53 
 
 		 391 aa  100  4e-20  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.231999  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3878  aromatic amino acid permease  28.97 
 
 		 391 aa  100  5e-20  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00957771  hitchhiker  0.00000285867 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2939  tyrosine-specific transport protein, putative  29.59 
 
 		 395 aa  99.8  8e-20  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.121322  normal  0.0322125 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_71710  tryptophan permease  26.4 
 
 		 417 aa  99.4  1e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.268423  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6222  tryptophan permease  25.59 
 
 		 467 aa  95.9  1e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3938  aromatic amino acid permease  27.6 
 
 		 392 aa  95.1  2e-18  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.176846  normal  0.472237 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0991  tryptophan permease  26.18 
 
 		 424 aa  92.8  8e-18  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1118  tryptophan-specific transport protein  26.65 
 
 		 411 aa  90.9  3e-17  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_42458  HAAAP family transporter: tyrosine  24.3 
 
 		 408 aa  90.9  4e-17  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0166063  normal  0.266354 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0097  aromatic amino acid transporter  26.34 
 
 		 419 aa  87.8  3e-16  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.103921  normal  0.507347 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>