123 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spro_2890 on replicon NC_009832
Organism: Serratia proteamaculans 568



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009832  Spro_2890  glycosyl transferase family protein  100 
 
 
301 aa  611  9.999999999999999e-175  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0380  glycosyl transferase family 2  33.33 
 
 
298 aa  130  2.0000000000000002e-29  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3066  glycosyl transferase family protein  25.37 
 
 
402 aa  59.3  0.00000008  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1267  putative glycosyl transferase  25.91 
 
 
300 aa  57.8  0.0000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2187  glycosyl transferase, group 2 family protein  26.76 
 
 
256 aa  57.8  0.0000002  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000000104716  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1815  glycosyl transferase family 2  30.47 
 
 
958 aa  57.4  0.0000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.613695  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1888  glycosyl transferase family protein  27.22 
 
 
324 aa  53.9  0.000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.826317  normal  0.852765 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0715  glycosyl transferase, group 2 family protein  25 
 
 
334 aa  53.9  0.000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.887983  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3960  glycosyl transferase, group 2 family protein  24.66 
 
 
327 aa  53.9  0.000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0389703  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0309  glycosyl transferase family 2  26.13 
 
 
291 aa  53.5  0.000005  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000259013  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0706  glycosyl transferase group 2 family protein  25 
 
 
334 aa  52.8  0.000006  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.912597  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3044  glycosyl transferase family protein  26.11 
 
 
297 aa  52.8  0.000007  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22790  glycosyl transferase family 2  22.95 
 
 
250 aa  52  0.00001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3834  glycosyl transferase, group 2 family protein  23.97 
 
 
327 aa  52.4  0.00001  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000153474  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0086  glycosyl transferase family protein  23.97 
 
 
327 aa  52.4  0.00001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0142969  normal  0.0610644 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03480  putative beta1,3-glucosyltransferase  24.5 
 
 
327 aa  50.8  0.00002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.307597  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3199  glycosyl transferase family 2  26.32 
 
 
349 aa  51.2  0.00002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03431  hypothetical protein  24.5 
 
 
327 aa  50.8  0.00002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.1979  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3118  glycosyl transferase family protein  31.68 
 
 
235 aa  51.6  0.00002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000000616031  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1874  hypothetical protein  32.61 
 
 
249 aa  50.4  0.00003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.953191 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1106  glycosyl transferase  25.42 
 
 
215 aa  50.8  0.00003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.648038  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4126  glycosyl transferase, group 2 family protein  24.5 
 
 
327 aa  50.8  0.00003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.521987  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4050  glycosyl transferase, group 2 family protein  24.5 
 
 
327 aa  50.8  0.00003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0155  glycosyl transferase family 2  23.48 
 
 
298 aa  50.1  0.00005  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1327  hypothetical protein  27.31 
 
 
338 aa  49.7  0.00006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0232591  normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1441  cell wall biosynthesis glycosyltransferase  24.39 
 
 
322 aa  49.7  0.00006  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.692478  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3520  cell wall biosynthesis glycosyltransferase-like protein  25 
 
 
323 aa  49.7  0.00007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1227  lipooligosaccharide biosynthesis glycosyltransferase  24.65 
 
 
270 aa  48.9  0.0001  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000982569  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0589  glycosyl transferase family protein  27.12 
 
 
226 aa  48.5  0.0001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1428  glycosyl transferase family protein  23.93 
 
 
244 aa  48.9  0.0001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3336  glycosyl transferase family protein  33.33 
 
 
1268 aa  48.9  0.0001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1268  glycosyl transferase family 2  27.12 
 
 
369 aa  48.9  0.0001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.6355  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_09810  glycosyl transferase  27.43 
 
 
405 aa  48.1  0.0002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.440212 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2262  glycosyl transferase, group 2  28.07 
 
 
386 aa  48.1  0.0002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1278  lipooligosaccharide biosynthesis galactosyltransferase, putative  28.57 
 
 
295 aa  47.8  0.0003  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.0908017  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0146  glycosyl transferase family protein  28.57 
 
 
336 aa  47.4  0.0003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.90394 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0481  glycosyl transferase family protein  23.33 
 
 
321 aa  47.4  0.0003  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1385  glycosyl transferase family 2  26.09 
 
 
319 aa  47.4  0.0003  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2974  WbdN  21.14 
 
 
260 aa  47.8  0.0003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0521919  hitchhiker  0.0000000316715 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1325  glycosyl transferase family protein  23.53 
 
 
255 aa  47  0.0004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0141129  hitchhiker  0.00457446 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0218  glycosyl transferase family protein  23.08 
 
 
379 aa  47  0.0004  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3023  glycosyl transferase family 2  24.35 
 
 
323 aa  47  0.0004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1470  dolichol-phosphate mannosyltransferase  27.62 
 
 
240 aa  46.6  0.0005  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.797995  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1821  glycosyl transferase family 2  27.19 
 
 
345 aa  46.2  0.0006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  hitchhiker  0.000034803  normal  0.126643 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1727  glycosyl transferase family 2  26.83 
 
 
689 aa  46.6  0.0006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.158076 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0114  glycosyl transferase family 2  30.28 
 
 
410 aa  46.2  0.0007  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3248  glycosyl transferase family 2  28.48 
 
 
323 aa  46.2  0.0007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2370  glycosyltransferase  25.4 
 
 
319 aa  45.8  0.0008  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2088  AMP-dependent synthetase and ligase  25.9 
 
 
807 aa  45.8  0.0009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.169515  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3374  glycosyl transferase family 2  32.18 
 
 
1435 aa  45.8  0.0009  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1532  glycosyl transferase family protein  29.21 
 
 
249 aa  45.8  0.001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0876936  normal  0.196809 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2407  glycosyl transferase family protein  32.18 
 
 
312 aa  45.4  0.001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.116461  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1156  beta-1,3-galactosyltransferase  23.74 
 
 
181 aa  45.1  0.001  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.000973066  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4174  glycosyl transferase family protein  27.27 
 
 
257 aa  45.4  0.001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0739  glycosyl transferase family 2  23.89 
 
 
348 aa  45.4  0.001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.646928  normal  0.825745 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2038  glycosyl transferase family 2  25.9 
 
 
340 aa  45.1  0.001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.723912 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0710  glycosyl transferase family 2  23.89 
 
 
348 aa  45.4  0.001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4543  glycosyl transferase family 2  27.27 
 
 
257 aa  45.4  0.001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0437708  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1920  glucosaminyltransferase  24.79 
 
 
403 aa  45.1  0.002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.807733 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0242  hypothetical protein  25.93 
 
 
253 aa  44.3  0.002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000022045  hitchhiker  0.00000000126838 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1987  cell wall biosynthesis glycosyltransferase-like protein  26.39 
 
 
380 aa  45.1  0.002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2683  glycosyl transferase family 2  31.73 
 
 
361 aa  44.7  0.002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.624324  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1908  cell wall biosynthesis glycosyltransferase-like protein  28.85 
 
 
780 aa  44.3  0.002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2371  glycosyltransferase  22.12 
 
 
326 aa  44.7  0.002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1738  glycosyltransferase-like protein  25.34 
 
 
312 aa  44.7  0.002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0907  glycosyl transferase family protein  26.37 
 
 
415 aa  44.3  0.002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.00249013  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0203  glycosyl transferase family protein  27.27 
 
 
314 aa  44.3  0.002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2145  glycosyl transferase family 2  24.43 
 
 
249 aa  45.1  0.002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.0368252 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2888  glycosyl transferase family protein  21.37 
 
 
247 aa  44.7  0.002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.468847  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1081  glycosyl transferase family protein  27.73 
 
 
324 aa  44.7  0.002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0364187  normal  0.921384 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3455  glycosyl transferase family protein  25.62 
 
 
315 aa  44.3  0.002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4687  glycosyl transferase family 2  26.26 
 
 
252 aa  44.7  0.002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.945495 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2329  glycosyl transferase family 2  30.11 
 
 
344 aa  44.7  0.002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2924  glycosyl transferase family protein  28.69 
 
 
262 aa  43.9  0.003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0701  glycosyl transferase family 2  26.26 
 
 
355 aa  43.9  0.003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000226644  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0128  glycosyl transferase family 2  28.97 
 
 
1077 aa  44.3  0.003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1450  cell wall biosynthesis glycosyltransferase-like protein  28.04 
 
 
134 aa  43.9  0.003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.069354  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1716  glycosyl transferase family protein  27.55 
 
 
243 aa  44.3  0.003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1397  glycosyl transferase family protein  24.26 
 
 
240 aa  44.3  0.003  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1525  glycosyl transferase family 2  30.53 
 
 
857 aa  44.3  0.003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1391  glycosyl transferase family 2  23.7 
 
 
209 aa  43.9  0.003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.961124  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0623  glycosyl transferase, group 2 family protein  31.75 
 
 
316 aa  43.9  0.004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.517222  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5106  beta-1,3-N-acetylglucosaminyltransferase  25 
 
 
326 aa  43.5  0.004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0339  glycosyl transferase family 2  26.26 
 
 
304 aa  43.5  0.004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.479436  normal  0.396217 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2759  glycosyl transferase family protein  25.46 
 
 
340 aa  43.9  0.004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3275  glycosyl transferase family 2  26.92 
 
 
362 aa  43.5  0.004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.355424  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_13831  hypothetical protein  21.49 
 
 
302 aa  43.5  0.004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.906412  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0585  beta-1,3-galactosyltransferase  27.47 
 
 
287 aa  43.5  0.004  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3964  glycosyl transferase group 1  29 
 
 
1264 aa  43.9  0.004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3962  glycosyl transferase family 2  28.89 
 
 
240 aa  43.5  0.004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1391  glycosyl transferase, group 2 family protein  33.33 
 
 
335 aa  43.1  0.005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3065  glycosyl transferase family protein  28.8 
 
 
289 aa  43.5  0.005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.807338  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0359  glycosyl transferase family protein  28.89 
 
 
568 aa  43.1  0.005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.143693  normal  0.385412 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1881  undecaprenyl-phosphate 4-deoxy-4-formamido-L-arabinose transferase  33.33 
 
 
335 aa  43.1  0.005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.254489  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0016  glycosyl transferase, group 2 family protein  33.33 
 
 
335 aa  43.1  0.005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2238  undecaprenyl-phosphate 4-deoxy-4-formamido-L-arabinose transferase  33.33 
 
 
335 aa  43.1  0.005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2276  undecaprenyl-phosphate 4-deoxy-4-formamido-L-arabinose transferase  33.33 
 
 
335 aa  43.1  0.005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1153  undecaprenyl-phosphate 4-deoxy-4-formamido-L-arabinose transferase  33.33 
 
 
335 aa  43.1  0.005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1309  glycosyl transferase family 2  26.39 
 
 
272 aa  43.5  0.005  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1552  glycosyl transferase family 2  28.93 
 
 
299 aa  43.5  0.005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>