36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_5232 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013947  Snas_5232  hypothetical protein  100 
 
 
79 aa  162  1.0000000000000001e-39  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.664195  normal  0.424507 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4318  hypothetical protein  47.56 
 
 
85 aa  72  0.000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7553  hypothetical protein  44.83 
 
 
99 aa  55.5  0.0000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2127  protein of unknown function DUF397  41.33 
 
 
110 aa  51.2  0.000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000239677  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0228  hypothetical protein  48.15 
 
 
80 aa  50.1  0.00001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.921134 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5452  protein of unknown function DUF397  43.4 
 
 
59 aa  48.9  0.00002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.455168  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3929  protein of unknown function DUF397  44.44 
 
 
57 aa  49.3  0.00002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5993  protein of unknown function DUF397  42.62 
 
 
64 aa  48.9  0.00002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.342099  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24730  protein of unknown function (DUF397)  42.11 
 
 
69 aa  48.1  0.00003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7003  protein of unknown function DUF397  46.58 
 
 
84 aa  48.5  0.00003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4695  protein of unknown function DUF397  44 
 
 
127 aa  48.1  0.00004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1295  protein of unknown function DUF397  41.56 
 
 
82 aa  47.8  0.00005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6706  protein of unknown function DUF397  37.97 
 
 
59 aa  47.4  0.00007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4088  hypothetical protein  48.98 
 
 
57 aa  46.6  0.0001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1378  hypothetical protein  41.82 
 
 
58 aa  45.8  0.0002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1802  hypothetical protein  45.61 
 
 
63 aa  44.7  0.0004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4609  protein of unknown function DUF397  42.59 
 
 
66 aa  44.3  0.0006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1876  protein of unknown function DUF397  43.4 
 
 
56 aa  43.9  0.0008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3357  hypothetical protein  44.83 
 
 
64 aa  43.1  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0411145  normal  0.0781791 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4682  protein of unknown function DUF397  40.68 
 
 
63 aa  42.4  0.002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0631  hypothetical protein  46.3 
 
 
72 aa  42.7  0.002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.243928  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1471  hypothetical protein  40.68 
 
 
76 aa  42.4  0.002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.394456  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3501  protein of unknown function DUF397  38.27 
 
 
79 aa  42.4  0.002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2767  protein of unknown function DUF397  43.4 
 
 
60 aa  42.4  0.002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0824129  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2580  protein of unknown function DUF397  37.5 
 
 
59 aa  42.4  0.002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.0232734 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1161  protein of unknown function DUF397  40.74 
 
 
62 aa  42.4  0.002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.653899  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1019  hypothetical protein  38.57 
 
 
81 aa  42  0.003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0643  hypothetical protein  44.07 
 
 
61 aa  41.6  0.003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3779  protein of unknown function DUF397  37.29 
 
 
66 aa  41.6  0.004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2071  hypothetical protein  43.86 
 
 
67 aa  41.6  0.004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.392038  normal  0.686099 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4137  protein of unknown function DUF397  39.62 
 
 
58 aa  40.8  0.005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1432  hypothetical protein  42.37 
 
 
62 aa  40.8  0.006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.353493  hitchhiker  0.000418088 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6649  hypothetical protein  44.23 
 
 
79 aa  40.4  0.009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.476212  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2768  protein of unknown function DUF397  39.62 
 
 
56 aa  40.4  0.009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.141211  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1304  protein of unknown function DUF397  43.86 
 
 
68 aa  40.4  0.009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0379944  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4159  protein of unknown function DUF397  39.66 
 
 
67 aa  40  0.009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>