31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_3325 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013947  Snas_3325  hypothetical protein  100 
 
 
402 aa  775    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0514676  normal  0.538152 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2673  hypothetical protein  44.02 
 
 
434 aa  268  1e-70  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.277255 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2675  hypothetical protein  42.07 
 
 
434 aa  249  6e-65  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.397563 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2244  hypothetical protein  42.14 
 
 
450 aa  206  7e-52  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1542  hypothetical protein  37.31 
 
 
445 aa  180  4.999999999999999e-44  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.170969  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3252  hypothetical protein  37.41 
 
 
432 aa  176  6e-43  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3181  hypothetical protein  39.21 
 
 
371 aa  170  3e-41  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2368  hypothetical protein  36.86 
 
 
402 aa  157  2e-37  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0644  hypothetical protein  38.53 
 
 
412 aa  156  6e-37  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.353612  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1560  hypothetical protein  36.32 
 
 
382 aa  152  1e-35  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.214975  normal  0.807756 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1481  hypothetical protein  35.43 
 
 
378 aa  146  7.0000000000000006e-34  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.526682  normal  0.162192 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1197  hypothetical protein  35.96 
 
 
386 aa  137  3.0000000000000003e-31  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.673489  normal  0.324523 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0991  hypothetical protein  33.96 
 
 
362 aa  124  4e-27  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_09280  hypothetical protein  40.09 
 
 
313 aa  123  6e-27  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1452  protein of unknown function DUF1624  30.07 
 
 
411 aa  115  2.0000000000000002e-24  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000000000000779401 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3077  hypothetical protein  33.09 
 
 
404 aa  112  8.000000000000001e-24  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0333  hypothetical protein  34.87 
 
 
538 aa  111  2.0000000000000002e-23  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.115307 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06780  hypothetical protein  29.47 
 
 
412 aa  102  1e-20  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20080  predicted membrane protein  33.44 
 
 
450 aa  97.8  3e-19  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.0149559 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1450  hypothetical protein  30.12 
 
 
411 aa  95.9  1e-18  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.763514  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2015  hypothetical protein  27.04 
 
 
361 aa  92.4  1e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0652327  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36310  hypothetical protein  30.99 
 
 
427 aa  87.4  4e-16  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.740551  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3869  hypothetical protein  31.63 
 
 
385 aa  85.9  0.000000000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0435346  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_07140  predicted membrane protein  34.29 
 
 
423 aa  85.1  0.000000000000002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.125251  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2187  hypothetical protein  23.26 
 
 
361 aa  85.1  0.000000000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.490446  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4532  transport protein  28.54 
 
 
354 aa  82.8  0.00000000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0017  hypothetical protein  28.22 
 
 
374 aa  72  0.00000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_18000  hypothetical protein  33.17 
 
 
405 aa  65.5  0.000000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.514365  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1720  transport protein  29.31 
 
 
344 aa  60.5  0.00000005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3566  protein of unknown function DUF418  30.67 
 
 
459 aa  47.4  0.0005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.726105 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0858  hypothetical protein  28.47 
 
 
394 aa  43.9  0.005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.581256  normal  0.122318 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>