22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_2822 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013947  Snas_2822  Glycosyl hydrolase family 32 domain-containing protein  100 
 
 
673 aa  1357    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2049  hypothetical protein  35 
 
 
556 aa  118  3.9999999999999997e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.383654 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3085  hypothetical protein  27.53 
 
 
757 aa  84  0.000000000000009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.105752 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4030  hypothetical protein  28.52 
 
 
298 aa  68.2  0.0000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.102494  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2034  hypothetical protein  25 
 
 
371 aa  57.4  0.0000008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1755  hypothetical protein  25.73 
 
 
336 aa  55.8  0.000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.459643  normal  0.448559 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2732  glycoside hydrolase family 43  29.17 
 
 
315 aa  53.5  0.00001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0718  glycosidase PH1107-related protein  29.67 
 
 
328 aa  53.1  0.00002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0779559  normal  0.015254 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0179  cellulose-binding family II  27.75 
 
 
598 aa  53.1  0.00002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00318302 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0516  Arabinan endo-1,5-alpha-L-arabinosidase  28.4 
 
 
366 aa  52  0.00003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  hitchhiker  0.00000112186  decreased coverage  0.000226611 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22440  Glycosyl hydrolase family 32 domain protein  35.78 
 
 
210 aa  50.4  0.0001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0206  glycoside hydrolase family 43  26.18 
 
 
304 aa  48.1  0.0006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.306204  normal  0.253285 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2051  arabinan endo-1,5-alpha-L-arabinosidase  27.33 
 
 
357 aa  47  0.001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3103  hypothetical protein  25 
 
 
536 aa  46.2  0.002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.186273  hitchhiker  0.0036434 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_04520  beta-xylosidase  30.61 
 
 
491 aa  45.8  0.002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.130696  normal  0.0670778 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02534  endoarabinanase (Eurofung)  36.11 
 
 
380 aa  45.4  0.003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3097  hypothetical protein  25 
 
 
547 aa  45.8  0.003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0360838 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1788  glycosidase, PH1107-related  32.35 
 
 
296 aa  45.1  0.005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2082  arabinan endo-1,5-alpha-L-arabinosidase  27.33 
 
 
356 aa  45.1  0.005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000230744  hitchhiker  0.000000189943 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1980  arabinan endo-1,5-alpha-L-arabinosidase  27.21 
 
 
355 aa  45.1  0.005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.0000532018  hitchhiker  0.000349844 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1390  arabinan endo-1,5-alpha-L-arabinosidase  25.48 
 
 
341 aa  43.9  0.009  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.287204  normal  0.664348 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_08007  Endo-alpha-1,5-arabinanasePutative uncharacterized protein ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q5AUM3]  27.32 
 
 
320 aa  43.9  0.01  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.766445 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>