21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_2049 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013131  Caci_2049  hypothetical protein  100 
 
 
556 aa  1101    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.383654 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3085  hypothetical protein  25.41 
 
 
757 aa  117  7.999999999999999e-25  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.105752 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2822  Glycosyl hydrolase family 32 domain-containing protein  33.78 
 
 
673 aa  114  5e-24  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5354  twin-arginine translocation pathway signal  35.5 
 
 
256 aa  83.6  0.000000000000008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5733  twin-arginine translocation pathway signal  35.5 
 
 
256 aa  83.6  0.000000000000008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5443  twin-arginine translocation pathway signal  35.5 
 
 
256 aa  83.6  0.000000000000008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.558403 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5923  twin-arginine translocation pathway signal  34.6 
 
 
253 aa  81.6  0.00000000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0504  twin-arginine translocation pathway signal  35.45 
 
 
255 aa  79.3  0.0000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1693  twin-arginine translocation pathway signal  32.42 
 
 
305 aa  75.9  0.000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.269056  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1762  twin-arginine translocation pathway signal  32.03 
 
 
305 aa  73.2  0.00000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1716  twin-arginine translocation pathway signal  32.03 
 
 
305 aa  73.2  0.00000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.617578  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3097  hypothetical protein  25.77 
 
 
547 aa  70.1  0.0000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0360838 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3103  hypothetical protein  25.77 
 
 
536 aa  69.7  0.0000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.186273  hitchhiker  0.0036434 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12546  hypothetical protein  31.84 
 
 
240 aa  65.5  0.000000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00151773 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1853  hypothetical protein  29.81 
 
 
520 aa  64.7  0.000000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4030  hypothetical protein  29.36 
 
 
298 aa  58.5  0.0000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.102494  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8021  hypothetical protein  36.5 
 
 
671 aa  57  0.0000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.555479  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3662  hypothetical protein  29.1 
 
 
241 aa  45.8  0.002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.728118 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1752  glycosyl hydrolase  25 
 
 
1514 aa  45.8  0.002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3722  hypothetical protein  28.57 
 
 
231 aa  43.9  0.007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.367181  normal  0.854674 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3649  hypothetical protein  28.57 
 
 
231 aa  43.9  0.007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.197463  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>