33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_2675 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013947  Snas_2675  hypothetical protein  100 
 
 
434 aa  847    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.397563 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2673  hypothetical protein  39.2 
 
 
434 aa  249  5e-65  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.277255 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3325  hypothetical protein  43.49 
 
 
402 aa  209  9e-53  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0514676  normal  0.538152 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2244  hypothetical protein  37.53 
 
 
450 aa  189  1e-46  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1542  hypothetical protein  36.06 
 
 
445 aa  176  8e-43  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.170969  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3252  hypothetical protein  35.31 
 
 
432 aa  156  9e-37  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0644  hypothetical protein  34.36 
 
 
412 aa  154  4e-36  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.353612  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3181  hypothetical protein  33.5 
 
 
371 aa  144  2e-33  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2368  hypothetical protein  34.64 
 
 
402 aa  140  3.9999999999999997e-32  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1560  hypothetical protein  32.83 
 
 
382 aa  132  1.0000000000000001e-29  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.214975  normal  0.807756 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1452  protein of unknown function DUF1624  30.38 
 
 
411 aa  118  1.9999999999999998e-25  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000000000000779401 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1197  hypothetical protein  32.74 
 
 
386 aa  116  8.999999999999998e-25  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.673489  normal  0.324523 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3077  hypothetical protein  34.44 
 
 
404 aa  107  5e-22  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1450  hypothetical protein  28.57 
 
 
411 aa  106  6e-22  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.763514  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_09280  hypothetical protein  31.7 
 
 
313 aa  102  1e-20  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0333  hypothetical protein  32.44 
 
 
538 aa  102  1e-20  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.115307 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1481  hypothetical protein  31.14 
 
 
378 aa  100  4e-20  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.526682  normal  0.162192 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0991  hypothetical protein  29.55 
 
 
362 aa  96.7  7e-19  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06780  hypothetical protein  29.49 
 
 
412 aa  95.9  1e-18  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20080  predicted membrane protein  30.37 
 
 
450 aa  90.9  4e-17  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.0149559 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36310  hypothetical protein  30.52 
 
 
427 aa  84  0.000000000000005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.740551  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4532  transport protein  28.25 
 
 
354 aa  80.5  0.00000000000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0017  hypothetical protein  28.5 
 
 
374 aa  79.7  0.00000000000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1720  transport protein  29.46 
 
 
344 aa  77.4  0.0000000000005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2015  hypothetical protein  21.62 
 
 
361 aa  73.2  0.00000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0652327  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3869  hypothetical protein  30.03 
 
 
385 aa  70.9  0.00000000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0435346  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2187  hypothetical protein  23.25 
 
 
361 aa  69.3  0.0000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.490446  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0858  hypothetical protein  25.97 
 
 
394 aa  68.2  0.0000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.581256  normal  0.122318 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_07140  predicted membrane protein  33.33 
 
 
423 aa  65.5  0.000000002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.125251  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_18000  hypothetical protein  26.19 
 
 
405 aa  53.1  0.000009  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.514365  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4882  hypothetical protein  31.58 
 
 
340 aa  43.9  0.005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4858  hypothetical protein  32.97 
 
 
340 aa  43.1  0.009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4889  hypothetical protein  31.58 
 
 
340 aa  43.1  0.01  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>