58 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_2309 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013947  Snas_2309  hypothetical protein  100 
 
 
99 aa  206  7e-53  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2337  protein of unknown function DUF1330  39.13 
 
 
100 aa  68.2  0.00000000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2076  hypothetical protein  32.22 
 
 
95 aa  63.9  0.0000000006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.501523 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3229  hypothetical protein  34.44 
 
 
95 aa  61.2  0.000000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1042  hypothetical protein  36.96 
 
 
97 aa  61.2  0.000000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.797208  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1268  hypothetical protein  31.82 
 
 
95 aa  57.4  0.00000006  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.253243  normal  0.411304 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4723  hypothetical protein  33.33 
 
 
102 aa  53.1  0.000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.153219  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1844  hypothetical protein  29.35 
 
 
101 aa  52.8  0.000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0176  protein of unknown function DUF1330  28.92 
 
 
112 aa  52.4  0.000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3743  hypothetical protein  33.33 
 
 
98 aa  51.6  0.000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.679918 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_12241  hypothetical protein  36.25 
 
 
115 aa  51.2  0.000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0684  hypothetical protein  28.72 
 
 
97 aa  50.8  0.000007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3978  glucose inhibited division protein  28.4 
 
 
96 aa  49.7  0.00001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.174401 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0092  protein of unknown function DUF1330  28.26 
 
 
96 aa  49.7  0.00001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.273128  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6641  protein of unknown function DUF1330  25.27 
 
 
95 aa  49.7  0.00001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1655  protein of unknown function DUF1330  28.26 
 
 
96 aa  49.3  0.00002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1504  hypothetical protein  34.07 
 
 
127 aa  49.3  0.00002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0722  protein of unknown function DUF1330  31.31 
 
 
102 aa  48.9  0.00003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3539  hypothetical protein  31.82 
 
 
95 aa  48.1  0.00004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3445  protein of unknown function DUF1330  27.5 
 
 
96 aa  47.4  0.00006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6612  hypothetical protein  26.09 
 
 
104 aa  47  0.00008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0310  hypothetical protein  27.71 
 
 
97 aa  47  0.00009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.105649  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4630  protein of unknown function DUF1330  27.78 
 
 
109 aa  47  0.00009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0345  hypothetical protein  34.83 
 
 
96 aa  46.6  0.0001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0272597  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0785  hypothetical protein  30.34 
 
 
95 aa  46.6  0.0001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.560924  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0334  hypothetical protein  30.85 
 
 
100 aa  45.8  0.0002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.255499  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR2129  hypothetical protein  30.34 
 
 
95 aa  45.4  0.0003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.140278  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2045  hypothetical protein  30.34 
 
 
95 aa  45.4  0.0003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0164673  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5022  protein of unknown function DUF1330  32.95 
 
 
112 aa  45.1  0.0003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0320092  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0196  hypothetical protein  29.79 
 
 
100 aa  44.7  0.0004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1325  hypothetical protein  30 
 
 
96 aa  44.3  0.0006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2552  hypothetical protein  30.12 
 
 
98 aa  43.9  0.0008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.758966  normal  0.349195 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2621  hypothetical protein  26.6 
 
 
105 aa  43.9  0.0008  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.249964  normal  0.209619 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5107  hypothetical protein  27.27 
 
 
96 aa  43.9  0.0008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.496431 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2483  hypothetical protein  30.85 
 
 
97 aa  42.7  0.001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6409  protein of unknown function DUF1330  30.77 
 
 
97 aa  43.1  0.001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4324  protein of unknown function DUF1330  29.55 
 
 
95 aa  42.7  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0724  hypothetical protein  30.11 
 
 
129 aa  42.7  0.002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3189  hypothetical protein  25.93 
 
 
93 aa  42.4  0.002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.63828  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1194  hypothetical protein  30.77 
 
 
107 aa  42.4  0.002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.707621  normal 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4583  hypothetical protein  27.5 
 
 
115 aa  42.4  0.002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.165656 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3722  hypothetical protein  26.25 
 
 
89 aa  42.7  0.002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.104061  normal  0.935166 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1673  hypothetical protein  28.75 
 
 
92 aa  41.6  0.003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.688038  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1054  hypothetical protein  26.92 
 
 
96 aa  41.6  0.003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4055  hypothetical protein  30.68 
 
 
112 aa  42  0.003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.150808 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3241  protein of unknown function DUF1330  26.67 
 
 
98 aa  42  0.003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.386279  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2807  protein of unknown function DUF1330  26.44 
 
 
95 aa  41.6  0.004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0913  protein of unknown function DUF1330  28.89 
 
 
96 aa  41.6  0.004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4587  protein of unknown function DUF1330  29.55 
 
 
95 aa  41.6  0.004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.226521 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2403  hypothetical protein  29.73 
 
 
96 aa  41.6  0.004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.79558  normal  0.741886 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6432  hypothetical protein  26.37 
 
 
97 aa  41.2  0.005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.386875 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_11881  hypothetical protein  34.62 
 
 
113 aa  41.2  0.005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.22766 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1859  hypothetical protein  28.74 
 
 
96 aa  41.2  0.005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000000278867  normal  0.769812 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3239  hypothetical protein  27.47 
 
 
97 aa  40.8  0.006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0371902  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_06361  hypothetical protein  32.22 
 
 
114 aa  40.8  0.006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal  0.481092 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1076  hypothetical protein  28.05 
 
 
99 aa  40.4  0.008  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.262747  normal  0.355591 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2285  hypothetical protein  21.98 
 
 
96 aa  40.4  0.009  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0613201  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0823  hypothetical protein  28.74 
 
 
105 aa  40.4  0.009  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.636113  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>