28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_1567 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013947  Snas_1567  hypothetical protein  100 
 
 		 127 aa  242  9.999999999999999e-64  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.407046  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4148  hypothetical protein  65.85 
 
 		 126 aa  162  2.0000000000000002e-39  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2005  DoxX family protein  57.6 
 
 		 124 aa  134  4e-31  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.870189  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4336  hypothetical protein  54.4 
 
 		 123 aa  124  4.0000000000000003e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.235797  normal  0.5929 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1511  hypothetical protein  52 
 
 		 123 aa  121  4e-27  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.111942  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2193  DoxX family protein  51.2 
 
 		 123 aa  115  9.999999999999999e-26  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1667  DoxX family protein  50.83 
 
 		 118 aa  104  4e-22  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0000553116  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2609  hypothetical protein  54.4 
 
 		 123 aa  102  1e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.32019 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11930  DoxX protein  50.39 
 
 		 124 aa  101  4e-21  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.615674  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2652  DoxX family protein  54.4 
 
 		 124 aa  100  5e-21  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3523  hypothetical protein  44.53 
 
 		 128 aa  93.2  1e-18  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0416  DoxX family protein  44.8 
 
 		 123 aa  93.2  1e-18  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.337564  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0247  DoxX family protein  47.75 
 
 		 121 aa  89  2e-17  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2375  hypothetical protein  45.83 
 
 		 119 aa  87.4  5e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.000000055116  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3024  DoxX family protein  42.86 
 
 		 125 aa  85.1  3e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.459473  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_18060  DoxX protein  46.77 
 
 		 124 aa  82.8  0.000000000000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.1571  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3959  DoxX family protein  44.17 
 
 		 139 aa  79  0.00000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4749  DoxX family protein  41.41 
 
 		 129 aa  69.7  0.00000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5906  hypothetical protein  35.25 
 
 		 135 aa  67.8  0.00000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2310  hypothetical protein  36.75 
 
 		 121 aa  68.2  0.00000000004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.189779  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0608  DoxX family protein  37.69 
 
 		 130 aa  64.7  0.0000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.413078 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0915  hypothetical protein  42.5 
 
 		 132 aa  63.9  0.0000000007  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.561227  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2759  hypothetical protein  35.29 
 
 		 145 aa  62.4  0.000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4595  hypothetical protein  36.13 
 
 		 126 aa  59.3  0.00000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.901907  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3735  hypothetical protein  43.9 
 
 		 191 aa  58.5  0.00000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0148324  hitchhiker  0.00324172 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5995  DoxX family protein  36.8 
 
 		 147 aa  55.1  0.0000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.158002  normal  0.0523369 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4937  hypothetical protein  31.93 
 
 		 174 aa  52.4  0.000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.349534  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1690  DoxX family protein  37.7 
 
 		 134 aa  52.4  0.000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.231032 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>