More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_5853 on replicon NC_009621
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009621  Smed_5853  peptidase M24  100 
 
 		 395 aa  813    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.183484  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4994  peptidase M24  81.06 
 
 		 396 aa  674    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.510729  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1454  peptidase M24  46.17 
 
 		 384 aa  322  7e-87  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0876475 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2712  peptidase M24  31.85 
 
 		 367 aa  101  2e-20  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2697  peptidase M24  24.52 
 
 		 364 aa  97.1  5e-19  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0766  peptidase M24  27.37 
 
 		 364 aa  95.5  1e-18  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0663  peptidase M24  26.98 
 
 		 387 aa  94.7  2e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0232  peptidase M24  25.72 
 
 		 353 aa  95.1  2e-18  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6059  peptidase M24  27.57 
 
 		 379 aa  94  4e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.906893  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4421  peptidase M24  27.09 
 
 		 399 aa  93.2  7e-18  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2395  peptidase M24  24.47 
 
 		 378 aa  92.4  1e-17  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.305736  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3046  peptidase M24  26.75 
 
 		 404 aa  92.8  1e-17  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0197  peptidase M24  29.8 
 
 		 376 aa  90.1  7e-17  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.307422  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0299  peptidase M24  25.2 
 
 		 355 aa  88.2  2e-16  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.987373  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0678  dipeptidase  28.35 
 
 		 361 aa  88.6  2e-16  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1051  peptidase M24  26.61 
 
 		 357 aa  87.8  3e-16  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.000000093282  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1224  peptidase M24  25.2 
 
 		 355 aa  87  5e-16  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3295  peptidase M24  25.53 
 
 		 365 aa  86.7  7e-16  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.745544  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0663  peptidase M24  29.06 
 
 		 348 aa  86.3  8e-16  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.782539  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0248  peptidase M24  27.54 
 
 		 366 aa  86.3  8e-16  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2035  peptidase M24  26.74 
 
 		 347 aa  85.9  0.000000000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.232424  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0706  proline dipeptidase  27.02 
 
 		 361 aa  85.9  0.000000000000001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.050337  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1813  proline dipeptidase  28.26 
 
 		 362 aa  85.9  0.000000000000001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.136171  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_622  Xaa-Pro aminopeptidase  28.45 
 
 		 362 aa  85.1  0.000000000000002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1087  peptidase M24  30.34 
 
 		 348 aa  85.1  0.000000000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.338834 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1094  proline dipeptidase  24.59 
 
 		 353 aa  84.3  0.000000000000003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1358  peptidase M24  27.31 
 
 		 347 aa  84.3  0.000000000000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0476908  normal  0.192427 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6520  peptidase M24  28.19 
 
 		 380 aa  84.7  0.000000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.180886 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0650  peptidase M24  25.58 
 
 		 363 aa  84.7  0.000000000000003  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4452  peptidase M24  26.91 
 
 		 373 aa  84.3  0.000000000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0539466  hitchhiker  0.000000869693 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4051  peptidase M24  27.49 
 
 		 353 aa  84.3  0.000000000000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1324  aminopeptidase P  25.33 
 
 		 364 aa  84  0.000000000000004  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.152178  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1137  peptidase M24  33.99 
 
 		 359 aa  83.2  0.000000000000007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00850541 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1454  putative Xaa-Pro aminopeptidase  22.74 
 
 		 360 aa  83.2  0.000000000000008  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.156054  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1271  proline dipeptidase  23.03 
 
 		 351 aa  82  0.00000000000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4748  proline dipeptidase  23.81 
 
 		 365 aa  82.8  0.00000000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06140  peptidase M24  22.94 
 
 		 356 aa  82.4  0.00000000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4725  peptidase M24  29.56 
 
 		 361 aa  82.4  0.00000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.28239  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2517  peptidase M24  31.15 
 
 		 380 aa  82.4  0.00000000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.60769  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3437  peptidase M24  27.33 
 
 		 376 aa  82.4  0.00000000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4271  proline dipeptidase  27.09 
 
 		 353 aa  81.6  0.00000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4102  proline dipeptidase  27.09 
 
 		 353 aa  81.6  0.00000000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0184718  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4508  proline dipeptidase  23.54 
 
 		 365 aa  82  0.00000000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4328  X-Pro dipeptidase  27.09 
 
 		 353 aa  81.6  0.00000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3940  proline dipeptidase, Xaa-Pro dipeptidase  27.09 
 
 		 353 aa  81.6  0.00000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4344  Xaa-Pro dipeptidase (proline dipeptidase)  23.54 
 
 		 365 aa  81.6  0.00000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4742  X-Pro dipeptidase  23.54 
 
 		 365 aa  81.6  0.00000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.928976  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3951  proline dipeptidase, Xaa-Pro dipeptidase  27.09 
 
 		 353 aa  82  0.00000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00282404  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4355  Xaa-Pro dipeptidase (proline dipeptidase)  23.54 
 
 		 365 aa  82  0.00000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4730  X-Pro dipeptidase  23.54 
 
 		 365 aa  81.3  0.00000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1659  peptidase M24  26.34 
 
 		 369 aa  82  0.00000000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4723  X-Pro dipeptidase  23.54 
 
 		 365 aa  81.6  0.00000000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4422  proline dipeptidase  27.09 
 
 		 353 aa  81.6  0.00000000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4861  proline dipeptidase  23.54 
 
 		 365 aa  82  0.00000000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2323  peptidase M24  26.87 
 
 		 384 aa  81.6  0.00000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00153369  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2480  peptidase M24  31.15 
 
 		 380 aa  81.6  0.00000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.191193  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4308  X-Pro dipeptidase  27.09 
 
 		 353 aa  81.6  0.00000000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4218  X-Pro dipeptidase  27.09 
 
 		 353 aa  81.6  0.00000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0984  peptidase M24  26.51 
 
 		 390 aa  81.6  0.00000000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2525  peptidase M24  31.15 
 
 		 380 aa  81.6  0.00000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.186196  normal  0.708169 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0514  X-Pro dipeptidase  23.54 
 
 		 365 aa  81.6  0.00000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0926  X-Pro dipeptidase  27.09 
 
 		 353 aa  81.6  0.00000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4443  peptidase M24  23.22 
 
 		 365 aa  81.3  0.00000000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.190507  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2591  peptidase M24  29.44 
 
 		 362 aa  80.1  0.00000000000006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.653697  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2048  peptidase M24  28.94 
 
 		 371 aa  80.1  0.00000000000006  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.402173  normal  0.837706 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6121  peptidase M24  30.32 
 
 		 448 aa  79.7  0.00000000000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.164804  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1321  peptidase M24  27.18 
 
 		 398 aa  80.1  0.00000000000007  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2892  peptidase M24  27.09 
 
 		 353 aa  80.1  0.00000000000007  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0628939  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2340  peptidase M24  25.06 
 
 		 353 aa  79.7  0.00000000000008  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2546  peptidase M24  28.29 
 
 		 388 aa  79.3  0.0000000000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.874302  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0715  M24 family metallopeptidase  25.32 
 
 		 362 aa  79  0.0000000000001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.775303  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3098  peptidase M24  27.62 
 
 		 376 aa  78.6  0.0000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.101719  normal  0.240373 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2656  peptidase M24  24.17 
 
 		 356 aa  78.6  0.0000000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000248617 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1798  peptidase M24  23.82 
 
 		 351 aa  77.8  0.0000000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1764  peptidase M24  23.82 
 
 		 351 aa  77.8  0.0000000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0903  peptidase M24  26.32 
 
 		 359 aa  77.8  0.0000000000003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0118243  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2374  peptidase M24  26.62 
 
 		 376 aa  77.8  0.0000000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.429708  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0719  aminopeptidase P  25.74 
 
 		 352 aa  77.8  0.0000000000003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.00721866  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0435  proline dipeptidase  25.4 
 
 		 368 aa  77.8  0.0000000000003  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000870779  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0881  peptidase M24  25.91 
 
 		 359 aa  77.8  0.0000000000003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000469831  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0452  peptidase M24  24.73 
 
 		 361 aa  77.4  0.0000000000004  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3217  peptidase M24  29.92 
 
 		 353 aa  77.4  0.0000000000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12124  dipeptidase pepE  27.27 
 
 		 375 aa  77.4  0.0000000000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0941811  normal  0.718937 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0843  peptidase M24  28.86 
 
 		 409 aa  77.4  0.0000000000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2091  peptidase M24  26.09 
 
 		 376 aa  77.4  0.0000000000004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4628  peptidase M24  27.65 
 
 		 367 aa  77.4  0.0000000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.160287  hitchhiker  0.00355982 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2024  peptidase M24  26.89 
 
 		 359 aa  76.6  0.0000000000006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.711973  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3303  peptidase M24  25.13 
 
 		 418 aa  77  0.0000000000006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1621  peptidase M24  24.28 
 
 		 353 aa  76.6  0.0000000000008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0238018  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1588  peptidase M24  24.28 
 
 		 353 aa  76.6  0.0000000000008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0608501  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5355  proline dipeptidase  24.63 
 
 		 381 aa  76.3  0.0000000000009  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.541955  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3953  peptidase M24  29.76 
 
 		 378 aa  75.5  0.000000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.381963  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2407  peptidase M24  28.34 
 
 		 402 aa  76.3  0.000000000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.145734  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1893  peptidase M24  24.29 
 
 		 372 aa  75.9  0.000000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0574  Mername-AA019 peptidase  25.34 
 
 		 369 aa  75.5  0.000000000001  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0922  peptidase M24  24.02 
 
 		 405 aa  75.9  0.000000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.565676  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21880  Xaa-Pro aminopeptidase  31.9 
 
 		 382 aa  75.1  0.000000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.122866  normal  0.121364 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1560  peptidase M24  24.32 
 
 		 356 aa  75.5  0.000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0956578  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2238  peptidase M24  27.5 
 
 		 384 aa  75.5  0.000000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.286205  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3120  peptidase M24  26.43 
 
 		 380 aa  74.7  0.000000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>