30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_5684 on replicon NC_009621
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009621  Smed_5684  glycosyl transferase group 1  100 
 
 		 386 aa  800    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.164534  normal  1 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5609  glycosyl transferase group 1  62.08 
 
 		 388 aa  483  1e-135  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000732254 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0148  glycoside hydrolase family protein  23.64 
 
 		 444 aa  73.2  0.000000000007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.864478  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01300  hypothetical protein  25.64 
 
 		 434 aa  56.6  0.0000006  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0351  glycosyl transferase group 1  22.62 
 
 		 374 aa  50.4  0.00005  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.652004 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2547  glycosyl transferase group 1  31.82 
 
 		 414 aa  50.1  0.00007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.148819 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0440  glycosyl transferase, group 1  28.47 
 
 		 403 aa  49.7  0.00008  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.438778  normal  0.0102055 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1108  glycosyl transferase group 1  29.88 
 
 		 357 aa  49.3  0.0001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0280638  normal  0.0326528 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1090  glycosyl transferase, group 1  28.32 
 
 		 375 aa  48.1  0.0002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.638047  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1251  GalNAc alpha-1,4-transferase  28.71 
 
 		 354 aa  48.5  0.0002  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0839  glycosyl transferase group 1  27.18 
 
 		 395 aa  47  0.0005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0770239  normal  0.045052 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2305  glycosyl transferase, group 1  25 
 
 		 402 aa  46.2  0.0009  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2415  glycosyl transferase family protein  29.73 
 
 		 374 aa  46.2  0.001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1912  galactosyltransferase  22.48 
 
 		 389 aa  46.2  0.001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1755  hypothetical protein  25.14 
 
 		 358 aa  45.1  0.002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0199  glycosyl transferase group 1  29.25 
 
 		 394 aa  45.1  0.002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  hitchhiker  0.00799925  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1413  glycosyl transferase, group 1  29.25 
 
 		 377 aa  45.1  0.002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.71517 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0454  nitric oxide reductase large subunit  29.13 
 
 		 347 aa  44.7  0.003  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0224888  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0486  glycosyl transferase group 1  27.81 
 
 		 345 aa  44.7  0.003  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.062734  hitchhiker  0.000000303722 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1530  glycosyltransferase  26.05 
 
 		 366 aa  44.7  0.003  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000442427  normal  0.18466 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2695  glycosyl transferase, group 1  33.96 
 
 		 378 aa  44.3  0.004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.811647  normal  0.485445 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0638  glycosyl transferase group 1  22.94 
 
 		 381 aa  43.9  0.005  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.650689 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_02000  glycosyltransferase  28 
 
 		 452 aa  43.9  0.005  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0842  glycosyl transferase, group 1  24.43 
 
 		 393 aa  43.5  0.006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.075779  hitchhiker  0.00456148 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2660  glycosyl transferase, group 1  33.02 
 
 		 389 aa  43.5  0.007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.138584 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0758  glycosyl transferase group 1  28.44 
 
 		 371 aa  43.1  0.008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.11154 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3880  glycosyl transferase group 1  35.9 
 
 		 455 aa  43.1  0.008  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0778  glycosyl transferase, group 1  29.36 
 
 		 393 aa  42.7  0.009  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.272091  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13013  wlae protein  22.96 
 
 		 321 aa  42.7  0.009  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.632268  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1112  glycosyl transferase, group 1 family protein  33.04 
 
 		 366 aa  42.7  0.01  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>