68 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_2283 on replicon NC_009636
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009636  Smed_2283  metallophosphoesterase  100 
 
 		 300 aa  617  1e-176  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.802251  normal  0.228009 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3064  metallophosphoesterase  70 
 
 		 302 aa  439  9.999999999999999e-123  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0283144  normal  0.562041 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2800  metallophosphoesterase  68.67 
 
 		 302 aa  428  1e-119  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.223154  normal  0.033229 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3243  hypothetical protein  67.01 
 
 		 302 aa  412  1e-114  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1601  metallophosphoesterase  55.75 
 
 		 303 aa  319  3.9999999999999996e-86  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1512  hypothetical protein  56.1 
 
 		 303 aa  311  5.999999999999999e-84  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1564  hypothetical protein  55.75 
 
 		 300 aa  308  6.999999999999999e-83  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2187  metallophosphoesterase  51.16 
 
 		 307 aa  287  1e-76  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1012  Ser/Thr protein phosphatase family protein  44.78 
 
 		 294 aa  277  1e-73  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.329286  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1367  metallophosphoesterase  42.12 
 
 		 301 aa  229  4e-59  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1382  metallophosphoesterase  43.32 
 
 		 298 aa  226  4e-58  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.555745 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4196  metallophosphoesterase  42.39 
 
 		 292 aa  218  1e-55  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.600971 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2634  metallophosphoesterase  40.71 
 
 		 301 aa  213  2.9999999999999995e-54  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.614521 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4050  metallophosphoesterase  40.22 
 
 		 292 aa  209  5e-53  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.163562 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2257  putative metallo-phosphoesterase  38.95 
 
 		 297 aa  208  9e-53  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.118894  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2266  metallophosphoesterase  39.86 
 
 		 300 aa  203  2e-51  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3261  metallophosphoesterase  40.58 
 
 		 318 aa  203  3e-51  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3442  metallophosphoesterase  39.06 
 
 		 306 aa  203  3e-51  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.673317  normal  0.817537 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2745  metallophosphoesterase  41.79 
 
 		 332 aa  196  3e-49  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.384672  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2972  metallophosphoesterase  42.28 
 
 		 331 aa  191  1e-47  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.992281 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3198  metallophosphoesterase  42.45 
 
 		 315 aa  191  1e-47  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.333603 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0892  metallophosphoesterase  40.8 
 
 		 307 aa  189  5.999999999999999e-47  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0278946 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3154  metallophosphoesterase  40.93 
 
 		 316 aa  186  3e-46  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4875  metallophosphoesterase  39.57 
 
 		 293 aa  186  3e-46  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.246916  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6827  metallophosphoesterase  40.75 
 
 		 298 aa  182  8.000000000000001e-45  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7562  metallophosphoesterase  41.78 
 
 		 298 aa  178  1e-43  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.790874  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1681  metallophosphoesterase  37.23 
 
 		 307 aa  160  3e-38  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.162395  normal  0.567303 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3063  metallophosphoesterase  35.77 
 
 		 307 aa  156  3e-37  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.312394 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3418  metallophosphoesterase  39.33 
 
 		 307 aa  152  7e-36  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5676  metallophosphoesterase  34.22 
 
 		 326 aa  126  4.0000000000000003e-28  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0494432 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0989  metallophosphoesterase  32.73 
 
 		 307 aa  123  3e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1046  metallophosphoesterase  31.64 
 
 		 307 aa  111  2.0000000000000002e-23  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.541115  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1050  metallophosphoesterase  31.27 
 
 		 309 aa  111  2.0000000000000002e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2234  metallophosphoesterase  29.37 
 
 		 304 aa  70.9  0.00000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0912391  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0134  metallophosphoesterase  26.57 
 
 		 311 aa  67.8  0.0000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2144  metallophosphoesterase  30.22 
 
 		 268 aa  67  0.0000000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0336658  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1705  metallophosphoesterase  29.91 
 
 		 268 aa  65.9  0.0000000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0337  phospodiesterase  25.97 
 
 		 273 aa  62.4  0.00000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.669687  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1981  metallophosphoesterase  25.65 
 
 		 273 aa  60.8  0.00000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.400129 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1861  metallophosphoesterase  25.34 
 
 		 288 aa  57.8  0.0000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0744481  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0083  metallophosphoesterase  26.92 
 
 		 286 aa  55.8  0.0000008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0874822 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1362  metallophosphoesterase  27.14 
 
 		 266 aa  54.3  0.000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.7574e-16 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0616  metallophosphoesterase  23.69 
 
 		 286 aa  54.3  0.000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.875554  normal  0.440649 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1395  metallophosphoesterase  24.27 
 
 		 273 aa  53.1  0.000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.540293  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0221  metallophosphoesterase  24.83 
 
 		 278 aa  52  0.00001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.510985 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2100  metallophosphoesterase  29.08 
 
 		 223 aa  51.2  0.00002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0873153 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1785  hypothetical protein  24.2 
 
 		 286 aa  51.2  0.00002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0135  icc-related protein  22.94 
 
 		 290 aa  50.4  0.00003  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.280285  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4158  metallophosphoesterase  23.71 
 
 		 364 aa  50.8  0.00003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1594  hypothetical protein  23.19 
 
 		 287 aa  50.1  0.00005  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.351293 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0959  metallophosphoesterase  24.6 
 
 		 270 aa  48.9  0.0001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.0590877 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0118  metallophosphoesterase  26.48 
 
 		 312 aa  48.1  0.0002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.267876  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3153  metallophosphoesterase  26.4 
 
 		 1831 aa  48.1  0.0002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.479673  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2851  metallophosphoesterase  25.25 
 
 		 266 aa  48.1  0.0002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0131922  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0723  metallophosphoesterase  24.82 
 
 		 291 aa  46.6  0.0004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2182  putative DNA repair exonuclease  23.4 
 
 		 274 aa  46.6  0.0005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.16009  normal  0.125121 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0555  metallophosphoesterase  21.89 
 
 		 290 aa  46.6  0.0006  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.744788 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2244  metallophosphoesterase  24.54 
 
 		 282 aa  46.2  0.0007  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1233  3,5-cyclic-nucleotide phosphodiesterase  20.83 
 
 		 230 aa  45.8  0.0009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0344  purple acid phosphatase  25.62 
 
 		 489 aa  45.1  0.001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.0457353 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0595  metallophosphoesterase  22.43 
 
 		 288 aa  44.7  0.002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2865  metallophosphoesterase  27.55 
 
 		 235 aa  45.1  0.002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0711307  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3321  metallophosphoesterase  24.2 
 
 		 282 aa  44.7  0.002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3290  metallophosphoesterase  25.89 
 
 		 289 aa  43.1  0.006  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4868  metallophosphoesterase  30.1 
 
 		 391 aa  42.7  0.007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4782  metallophosphoesterase  30.1 
 
 		 391 aa  42.7  0.007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.358179  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5168  metallophosphoesterase  30.1 
 
 		 398 aa  42.7  0.008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.950044  normal  0.0894329 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1658  metallophosphoesterase  21.85 
 
 		 274 aa  42.4  0.009  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.11586  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>