243 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_0654 on replicon NC_009636
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009636  Smed_0654  diacylglycerol kinase catalytic region  100 
 
 
308 aa  626  1e-178  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.537224 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0950  diacylglycerol kinase catalytic region  61.62 
 
 
314 aa  384  1e-106  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1099  diacylglycerol kinase catalytic region  61.95 
 
 
314 aa  384  1e-105  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.255025 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1401  hypothetical protein  53.21 
 
 
284 aa  298  8e-80  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3102  diacylglycerol kinase, catalytic region  34.34 
 
 
302 aa  186  4e-46  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3900  diacylglycerol kinase catalytic region  30.43 
 
 
303 aa  107  2e-22  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.377313  normal  0.188998 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0472  diacylglycerol kinase catalytic region  28.25 
 
 
294 aa  106  5e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4888  diacylglycerol kinase catalytic region  32.43 
 
 
299 aa  102  6e-21  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.667474  normal  0.952267 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4424  diacylglycerol kinase catalytic region  32.43 
 
 
299 aa  102  1e-20  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0721369  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2406  diacylglycerol kinase catalytic region  28.19 
 
 
307 aa  94  3e-18  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.45203  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2227  diacylglycerol kinase catalytic region  30.08 
 
 
312 aa  87.8  2e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0252  putative lipid kinase  28.75 
 
 
293 aa  85.9  7e-16  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4934  diacylglycerol kinase catalytic region  35.82 
 
 
299 aa  85.9  9e-16  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.212819  normal  0.157048 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5358  putative lipid kinase  30.8 
 
 
317 aa  84.7  0.000000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.593577  hitchhiker  0.00311469 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0081  putative lipid kinase  28.7 
 
 
310 aa  84.3  0.000000000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.158248 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1486  putative lipid kinase  31.53 
 
 
302 aa  84  0.000000000000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2791  putative lipid kinase  30.43 
 
 
326 aa  83.6  0.000000000000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0686435  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1607  diacylglycerol kinase catalytic region  27.05 
 
 
302 aa  82.4  0.000000000000008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1582  diacylglycerol kinase catalytic region  27.05 
 
 
302 aa  82.4  0.000000000000008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3759  putative lipid kinase  35.26 
 
 
299 aa  81.6  0.00000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG1348  hypothetical protein  26.56 
 
 
293 aa  79.3  0.00000000000007  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2853  hypothetical protein  35.29 
 
 
335 aa  78.6  0.0000000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2074  putative lipid kinase  29.29 
 
 
298 aa  75.9  0.0000000000007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1943  putative lipid kinase  30.19 
 
 
313 aa  75.9  0.0000000000009  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.282737  normal  0.0158542 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3848  diacylglycerol kinase catalytic region  26.29 
 
 
291 aa  75.5  0.000000000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  unclonable  0.0000041794  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4745  diacylglycerol kinase catalytic region  26.76 
 
 
321 aa  74.7  0.000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2179  putative lipid kinase  27.16 
 
 
304 aa  74.3  0.000000000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.786183 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3289  diacylglycerol kinase, catalytic region  23.24 
 
 
355 aa  74.7  0.000000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.169628  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1590  diacylglycerol kinase catalytic region  27.82 
 
 
301 aa  74.3  0.000000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.49251 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4941  putative lipid kinase  30.54 
 
 
305 aa  74.3  0.000000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.454886  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0958  diacylglycerol kinase, catalytic region  28.44 
 
 
306 aa  73.6  0.000000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.035729 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0338  hypothetical protein  28.44 
 
 
305 aa  73.2  0.000000000005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.132835  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1982  diacylglycerol kinase, catalytic region  27.98 
 
 
305 aa  72.8  0.000000000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.65141  normal  0.423928 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1835  diacylglycerol kinase catalytic region  34.64 
 
 
310 aa  72.4  0.000000000009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00166325  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1023  putative lipid kinase  31.94 
 
 
291 aa  71.6  0.00000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0947788 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1361  diacylglycerol kinase catalytic region  26.8 
 
 
321 aa  72  0.00000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  8.758230000000001e-18 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1455  hypothetical protein  29.21 
 
 
326 aa  70.9  0.00000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.435019  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1118  diacylglycerol kinase, catalytic region  29.02 
 
 
320 aa  70.9  0.00000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.867073  decreased coverage  0.00200137 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3421  diacylglycerol kinase catalytic region  31.78 
 
 
311 aa  71.6  0.00000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.561701  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2552  putative lipid kinase  31.84 
 
 
305 aa  70.9  0.00000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.010432  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2852  diacylglycerol kinase catalytic region  27.78 
 
 
321 aa  70.5  0.00000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.156551  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1672  putative lipid kinase  29.95 
 
 
308 aa  70.1  0.00000000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1846  putative lipid kinase  31.52 
 
 
309 aa  70.1  0.00000000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.452741 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0227  putative lipid kinase  24.48 
 
 
328 aa  69.3  0.00000000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.535184 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1567  putative lipid kinase  31.52 
 
 
309 aa  68.9  0.0000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.315667 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4111  putative lipid kinase  30.99 
 
 
317 aa  68.6  0.0000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.135746 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2544  diacylglycerol kinase, catalytic region  27.22 
 
 
323 aa  68.9  0.0000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.502154 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6348  diacylglycerol kinase, catalytic region  31.95 
 
 
312 aa  68.2  0.0000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.522329  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1920  hypothetical protein  24.2 
 
 
287 aa  67.8  0.0000000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2359  diacylglycerol kinase  26.78 
 
 
343 aa  67.8  0.0000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1713  hypothetical protein  31.54 
 
 
312 aa  67.8  0.0000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0604892  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3942  diacylglycerol kinase catalytic region  26.09 
 
 
291 aa  67.8  0.0000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3254  diacylglycerol kinase catalytic region  39.08 
 
 
300 aa  67.8  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01350  conserved protein of unknown function BmrU  28.16 
 
 
323 aa  67.4  0.0000000003  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.956318  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2943  putative lipid kinase  33.33 
 
 
319 aa  67.4  0.0000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1900  diacylglycerol kinase family lipid kinase  24.12 
 
 
304 aa  67  0.0000000004  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0696483  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2392  diacylglycerol kinase catalytic region  29.63 
 
 
293 aa  67  0.0000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2183  hypothetical protein  24.83 
 
 
318 aa  66.6  0.0000000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.681145  normal  0.126845 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3059  phosphoesterase, PA-phosphatase related  27.92 
 
 
533 aa  66.2  0.0000000007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1952  putative lipid kinase  26.17 
 
 
315 aa  66.2  0.0000000007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.669604  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1986  putative lipid kinase  26.17 
 
 
315 aa  66.2  0.0000000007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.520999  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2141  diacylglycerol kinase catalytic region  30.99 
 
 
311 aa  65.9  0.0000000008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.241813  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1398  diacylglycerol kinase catalytic region  43.53 
 
 
310 aa  65.5  0.000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.175601  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0403  diacylglycerol kinase catalytic region  25.97 
 
 
292 aa  65.5  0.000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.749946  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2867  diacylglycerol kinase catalytic region  29.17 
 
 
343 aa  65.5  0.000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1933  hypothetical protein  26.56 
 
 
226 aa  64.7  0.000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1610  diacylglycerol kinase catalytic region  29.32 
 
 
287 aa  64.3  0.000000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0827  methylglyoxal synthase  31.91 
 
 
435 aa  64.3  0.000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3052  diacylglycerol kinase, catalytic region  27.92 
 
 
274 aa  63.9  0.000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.397807  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4093  diacylglycerol kinase catalytic region  26.84 
 
 
296 aa  63.2  0.000000006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.444037  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3156  diacylglycerol kinase catalytic region  33.61 
 
 
291 aa  62.8  0.000000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.324114  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1436  putative lipid kinase  26.96 
 
 
316 aa  62.8  0.000000008  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1249  phosphoesterase PA-phosphatase related protein  28.46 
 
 
489 aa  62.8  0.000000008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.195733  normal  0.362635 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0413  sphingosine kinase and DAGKc-like kinase  24.26 
 
 
296 aa  62  0.00000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0417163  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0619  hypothetical protein  26.79 
 
 
300 aa  61.6  0.00000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2734  hypothetical protein  30.83 
 
 
312 aa  61.6  0.00000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.27085  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2381  diacylglycerol kinase, catalytic region  27.08 
 
 
326 aa  60.8  0.00000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0491577  normal  0.812615 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3825  diacylglycerol kinase catalytic region  41.67 
 
 
335 aa  60.8  0.00000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.61177  normal  0.232851 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3490  diacylglycerol kinase, catalytic region  40.86 
 
 
372 aa  60.5  0.00000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.504885 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0173  phosphoesterase, PA-phosphatase related  29.27 
 
 
506 aa  59.7  0.00000007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.373591  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4164  diacylglycerol kinase catalytic region  25 
 
 
292 aa  59.3  0.00000008  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  hitchhiker  0.00574485  hitchhiker  0.00000041756 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0352  putative lipid kinase  22.14 
 
 
301 aa  58.5  0.0000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1224  putative lipid kinase  24.48 
 
 
307 aa  58.9  0.0000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0294  putative lipid kinase  22.14 
 
 
301 aa  58.9  0.0000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0396  putative lipid kinase  22.14 
 
 
301 aa  58.5  0.0000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1439  putative lipid kinase  26.75 
 
 
337 aa  58.9  0.0000001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0300  putative lipid kinase  23.05 
 
 
301 aa  58.9  0.0000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0308  putative lipid kinase  22.14 
 
 
301 aa  58.2  0.0000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0291  putative lipid kinase  22.14 
 
 
301 aa  58.2  0.0000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0323  putative lipid kinase  22.14 
 
 
301 aa  58.2  0.0000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1885  phosphoesterase PA-phosphatase related  32.52 
 
 
471 aa  58.2  0.0000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.000885175  normal  0.0968816 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0355  putative lipid kinase  22.14 
 
 
301 aa  58.2  0.0000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3667  putative lipid kinase  34.53 
 
 
314 aa  58.2  0.0000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4652  diacylglycerol kinase catalytic region  28.28 
 
 
300 aa  58.2  0.0000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0715  diacylglycerol kinase catalytic region  26.12 
 
 
336 aa  58.2  0.0000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0335  putative lipid kinase  25.22 
 
 
308 aa  58.2  0.0000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.000000000603525  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3598  putative lipid kinase  35.25 
 
 
297 aa  57.8  0.0000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.361147  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1562  diacylglycerol kinase catalytic region  27.13 
 
 
297 aa  57.8  0.0000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4772  putative lipid kinase  27.17 
 
 
323 aa  57.4  0.0000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2771  diacylglycerol kinase  27.51 
 
 
296 aa  57.4  0.0000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.148668  normal  0.641937 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>