114 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_0255 on replicon NC_009636
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009636  Smed_0255  flagellar basal body rod protein FlgB  100 
 
 		 126 aa  261  3e-69  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0349  flagellar basal body rod protein FlgB  58.02 
 
 		 130 aa  157  4e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0740426 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0317  flagellar basal body rod protein FlgB  58.02 
 
 		 130 aa  156  9e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.763946  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0151  flagellar basal body rod protein FlgB  56.56 
 
 		 126 aa  137  7e-32  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4212  flagellar basal body rod protein FlgB  55.74 
 
 		 126 aa  135  2e-31  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0135  flagellar basal body rod protein FlgB  55.74 
 
 		 126 aa  134  3.0000000000000003e-31  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0263191  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0298  flagellar basal body rod protein FlgB  52.8 
 
 		 135 aa  132  1.9999999999999998e-30  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1144  flagellar basal body rod protein FlgB  51.97 
 
 		 128 aa  130  3.9999999999999996e-30  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0735  flagellar basal body rod protein FlgB  49.61 
 
 		 130 aa  128  3e-29  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3673  flagellar basal body rod protein FlgB  50.39 
 
 		 127 aa  123  7e-28  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00533118 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1692  flagellar basal body rod protein FlgB  48.8 
 
 		 128 aa  123  8.000000000000001e-28  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.315615  normal  0.0176326 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0024  flagellar basal body rod protein FlgB  44.88 
 
 		 126 aa  119  1.9999999999999998e-26  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1094  flagellar basal body rod protein FlgB  44 
 
 		 125 aa  117  4.9999999999999996e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.376721 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0596  flagellar basal body rod protein FlgB  45.08 
 
 		 129 aa  116  7.999999999999999e-26  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.244257 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0618  flagellar basal body rod protein FlgB  45.08 
 
 		 129 aa  116  9.999999999999999e-26  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0896138  normal  0.0941281 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0629  flagellar basal body rod protein FlgB  45.08 
 
 		 129 aa  116  9.999999999999999e-26  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.148561 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3656  flagellar basal body rod protein FlgB  41.6 
 
 		 126 aa  107  7.000000000000001e-23  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.306825  normal  0.434285 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2992  flagellar basal body rod protein FlgB  33.33 
 
 		 127 aa  66.2  0.0000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1331  flagellar basal body rod protein FlgB  34.17 
 
 		 127 aa  65.5  0.0000000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.754656  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3437  putative flagellar basal-body rod protein FlgB  40.62 
 
 		 139 aa  63.9  0.0000000007  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2110  flagellar basal body rod protein FlgB  31.09 
 
 		 129 aa  62.4  0.000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.132503 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2235  flagellar basal body rod protein FlgB  36.89 
 
 		 133 aa  61.6  0.000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5155  flagellar basal body rod protein FlgB  34.78 
 
 		 133 aa  60.5  0.000000008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.18507  normal  0.0554322 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2600  flagellar basal body rod protein FlgB  31.67 
 
 		 127 aa  59.7  0.00000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000530741 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2570  flagellar basal-body rod protein FlgB  29.51 
 
 		 142 aa  60.1  0.00000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.15376 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4524  flagellar basal body rod protein  45.07 
 
 		 119 aa  60.1  0.00000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.996777  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2826  flagellar basal-body rod protein FlgB  30 
 
 		 152 aa  56.6  0.0000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5497  flagellar basal body rod protein FlgB  33.61 
 
 		 135 aa  55.8  0.0000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0469396  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2831  flagellar basal body rod protein FlgB  30 
 
 		 138 aa  55.5  0.0000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0664971  normal  0.159517 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5538  flagellar basal body rod protein FlgB  31.82 
 
 		 134 aa  56.2  0.0000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.407776  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2965  flagellar basal body rod protein FlgB  30.28 
 
 		 129 aa  55.1  0.0000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.157354 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4198  flagellar basal body rod protein FlgB  37.37 
 
 		 117 aa  54.3  0.0000005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2411  flagellar basal-body rod protein FlgB  33.94 
 
 		 132 aa  54.3  0.0000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2608  flagellar basal body rod protein FlgB  29.66 
 
 		 138 aa  53.9  0.0000007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0696754  normal  0.269497 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2638  flagellar basal body rod protein FlgB  30 
 
 		 138 aa  52.8  0.000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.164325  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1366  flagellar basal body rod protein FlgB  32.2 
 
 		 139 aa  52  0.000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2924  flagellar basal-body rod protein FlgB  40.24 
 
 		 134 aa  52.4  0.000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0926  flagellar basal-body rod protein FlgB  41.03 
 
 		 136 aa  50.4  0.000009  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2318  flagellar basal body rod protein FlgB  35.92 
 
 		 132 aa  49.3  0.00002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.361668 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3087  flagellar basal body rod protein FlgB  33.33 
 
 		 132 aa  48.9  0.00002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1118  flagellar basal-body rod protein FlgB  35.85 
 
 		 134 aa  49.3  0.00002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1132  flagellar basal body rod protein FlgB  29.69 
 
 		 135 aa  48.5  0.00003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3714  flagellar basal-body rod protein FlgB  29.45 
 
 		 151 aa  48.9  0.00003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.202019 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1597  flagellar basal body rod protein FlgB  33.96 
 
 		 132 aa  48.5  0.00003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4791  flagellar basal-body rod protein FlgB  29.45 
 
 		 151 aa  48.9  0.00003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.301769 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0685  flagellar basal-body rod protein FlgB  37.93 
 
 		 134 aa  48.5  0.00003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1587  flagellar basal body rod protein FlgB  41.38 
 
 		 138 aa  48.1  0.00004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1637  flagellar basal-body rod protein FlgB  35.59 
 
 		 133 aa  47.8  0.00005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1392  flagellar basal body rod protein FlgB  33.33 
 
 		 135 aa  47.8  0.00005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.154079  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0693  flagellar basal body rod protein FlgB  40.58 
 
 		 144 aa  47.8  0.00006  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1161  flagellar basal body rod protein FlgB  33.66 
 
 		 132 aa  47.4  0.00007  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1693  flagellar basal body rod protein FlgB  30 
 
 		 136 aa  47.4  0.00008  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.235256  normal  0.633905 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1345  flagellar basal body rod protein FlgB  32.04 
 
 		 132 aa  47  0.00009  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2000  flagellar basal body rod protein FlgB  32.94 
 
 		 129 aa  47  0.00009  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1212  flagellar basal-body rod protein FlgB  33.01 
 
 		 139 aa  46.2  0.0001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.856418  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1303  flagellar basal body rod protein FlgB  34.29 
 
 		 132 aa  47  0.0001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3583  flagellar basal-body rod protein FlgB  46.15 
 
 		 130 aa  47  0.0001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0676749  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3247  flagellar basal body rod protein FlgB  27.59 
 
 		 126 aa  46.6  0.0001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.896474  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4411  flagellar basal body rod protein FlgB  30.3 
 
 		 135 aa  46.6  0.0001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.420287  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2176  flagellar basal-body rod protein FlgB  29.59 
 
 		 133 aa  46.6  0.0001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.873568  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2378  flagellar basal-body rod protein FlgB  41.03 
 
 		 131 aa  45.8  0.0002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1102  flagellar basal body rod protein FlgB  44.64 
 
 		 132 aa  46.2  0.0002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1719  flagellar basal-body rod protein FlgB  38.27 
 
 		 128 aa  45.4  0.0002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1768  flagellar basal-body rod protein FlgB  32.29 
 
 		 132 aa  45.8  0.0002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.144654  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0342  flagellar basal-body rod protein FlgB  41.79 
 
 		 165 aa  45.4  0.0003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.395119  normal  0.980929 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0083  flagellar proximal rod protein FlgB  38.27 
 
 		 128 aa  45.1  0.0003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1517  flagellar basal body rod protein FlgB  32.38 
 
 		 136 aa  45.1  0.0003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0183705  normal  0.774595 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0058  flagellar basal body rod protein FlgB  31.86 
 
 		 144 aa  45.1  0.0003  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.372308  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0846  hypothetical protein  29.17 
 
 		 138 aa  44.7  0.0004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1674  flagellar basal-body rod protein FlgB  34.38 
 
 		 144 aa  45.1  0.0004  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3777  flagellar basal body rod protein FlgB  33 
 
 		 145 aa  44.7  0.0005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0109555  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1340  flagellar basal body rod protein FlgB  33.96 
 
 		 132 aa  44.3  0.0005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4199  flagellar basal-body rod protein FlgB  36.28 
 
 		 136 aa  44.7  0.0005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2134  flagellar basal body protein-like protein  30.25 
 
 		 126 aa  44.3  0.0006  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5625  flagellar basal body rod protein FlgB  29.57 
 
 		 135 aa  43.9  0.0008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0365  flagellar basal body rod protein FlgB  45 
 
 		 143 aa  43.9  0.0008  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1386  flagellar basal-body rod protein FlgB  33.33 
 
 		 134 aa  43.9  0.0008  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0749  flagellar basal-body rod protein FlgB  47.06 
 
 		 135 aa  43.5  0.0009  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1217  flagellar basal-body rod protein FlgB  43.4 
 
 		 130 aa  43.5  0.0009  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.284991  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1259  flagellar basal body rod protein FlgB  31.13 
 
 		 135 aa  43.5  0.001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1329  flagellar basal body rod protein FlgB  31.13 
 
 		 135 aa  43.5  0.001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0427  flagellar basal-body rod protein FlgB  31.07 
 
 		 144 aa  43.5  0.001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.707859  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3026  flagellar basal body rod protein FlgB  40.48 
 
 		 136 aa  43.1  0.001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1321  flagellar basal-body rod protein FlgB  35.79 
 
 		 134 aa  42.4  0.002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0706  flagellar basal body rod protein FlgB  40.35 
 
 		 146 aa  42.7  0.002  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1108  flagellar basal body rod protein FlgB  28.26 
 
 		 130 aa  42.4  0.002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00049744  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6371  flagellar basal body rod protein FlgB  31.87 
 
 		 162 aa  42  0.003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.232984  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2213  GTP-binding protein LepA  44.23 
 
 		 134 aa  42  0.003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6142  flagellar basal body protein FlgB  41.25 
 
 		 140 aa  42  0.003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.887047  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1672  flagellar basal-body rod protein FlgB  33.75 
 
 		 130 aa  42  0.003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.653515  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2734  flagellar basal-body rod protein FlgB  34.78 
 
 		 134 aa  42  0.003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000288784 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1576  flagellar basal body rod protein FlgB  39.29 
 
 		 137 aa  41.6  0.004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1868  flagellar basal body rod protein FlgB  36.78 
 
 		 138 aa  41.2  0.005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0893  flagellar basal-body rod protein FlgB  38.96 
 
 		 134 aa  41.2  0.005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0266  flagellar basal-body rod protein FlgB  30.95 
 
 		 137 aa  41.2  0.005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1684  flagellar basal-body rod protein FlgB  27.55 
 
 		 133 aa  41.2  0.005  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.151611  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2598  flagellar basal body rod protein FlgB  36.78 
 
 		 138 aa  41.2  0.005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.171228  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1819  flagellar basal body rod protein FlgB  35.71 
 
 		 135 aa  41.2  0.005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3250  flagellar basal body rod protein FlgB  75 
 
 		 134 aa  40.8  0.006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3714  flagellar basal-body rod protein FlgB  44.68 
 
 		 150 aa  40.8  0.006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>