170 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_0130 on replicon NC_009636
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009636  Smed_0130  ApaG  100 
 
 		 130 aa  269  9e-72  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.431164 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0179  ApaG  78.46 
 
 		 130 aa  223  7e-58  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.386018  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0189  ApaG  78.46 
 
 		 130 aa  223  9e-58  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.57181  normal  0.332972 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0543  ApaG  77.69 
 
 		 130 aa  221  2e-57  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0397  ApaG  65.38 
 
 		 130 aa  183  7e-46  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0304  ApaG  62.31 
 
 		 130 aa  176  1e-43  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0380419  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0317  ApaG  62.31 
 
 		 141 aa  175  2e-43  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0072  ApaG  60 
 
 		 144 aa  169  1e-41  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0408  ApaG  58.46 
 
 		 130 aa  160  4.0000000000000004e-39  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.833726  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1039  ApaG domain-containing protein  53.08 
 
 		 130 aa  157  4e-38  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0898  ApaG  55.38 
 
 		 140 aa  155  1e-37  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0787  ApaG  54.62 
 
 		 145 aa  153  7e-37  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.539898  normal  0.0936673 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5255  ApaG  54.62 
 
 		 130 aa  152  1e-36  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.178875  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1015  ApaG domain protein  52.31 
 
 		 130 aa  151  2.9999999999999998e-36  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000524176 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0470  ApaG  52.31 
 
 		 130 aa  149  2e-35  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.327059 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4913  ApaG  53.85 
 
 		 140 aa  148  3e-35  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.468217 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0764  ApaG  54.2 
 
 		 131 aa  147  6e-35  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0925231  hitchhiker  0.00575768 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0438  ApaG  50.77 
 
 		 130 aa  145  3e-34  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.500146  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0402  ApaG  50.77 
 
 		 130 aa  144  4.0000000000000006e-34  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.104997  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0370  ApaG  50.77 
 
 		 130 aa  144  4.0000000000000006e-34  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.292548  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6540  ApaG  49.23 
 
 		 130 aa  141  4e-33  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.560513 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2312  ApaG  48.46 
 
 		 130 aa  140  8e-33  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.661489  normal  0.04269 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7451  ApaG  47.69 
 
 		 130 aa  137  7e-32  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.953585  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0736  ApaG  50.82 
 
 		 123 aa  136  7.999999999999999e-32  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0223  ApaG  48.85 
 
 		 172 aa  133  8e-31  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0135  ApaG  48.85 
 
 		 237 aa  132  9.999999999999999e-31  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.903636  normal  0.829835 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2661  ApaG  52.59 
 
 		 157 aa  129  9e-30  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  decreased coverage  0.00116294  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_1033  ApaG  50.41 
 
 		 134 aa  129  2.0000000000000002e-29  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0829  ApaG  50.41 
 
 		 134 aa  128  3e-29  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  decreased coverage  0.00542439  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1660  ApaG  46.92 
 
 		 154 aa  128  3e-29  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.453905  normal  0.120686 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2722  ApaG domain protein  50.83 
 
 		 129 aa  126  1.0000000000000001e-28  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3640  ApaG  47.97 
 
 		 126 aa  125  2.0000000000000002e-28  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2231  ApaG  50.41 
 
 		 127 aa  125  2.0000000000000002e-28  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.340232  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1237  ApaG  47.15 
 
 		 158 aa  124  3e-28  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0904  ApaG  47.15 
 
 		 126 aa  124  4.0000000000000003e-28  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.764534  normal  0.43881 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3116  ApaG  47.15 
 
 		 126 aa  124  5e-28  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0491  ApaG  47.97 
 
 		 130 aa  124  5e-28  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.735069  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD1141  ApaG  47.15 
 
 		 133 aa  123  8.000000000000001e-28  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3210  ApaG  47.15 
 
 		 126 aa  123  9e-28  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.664218  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1346  ApaG  51.69 
 
 		 142 aa  122  2e-27  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.637296  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1982  ApaG domain protein  48.39 
 
 		 130 aa  121  3e-27  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.78252  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1078  ApaG  47.15 
 
 		 126 aa  121  3e-27  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.804618  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0976  ApaG  47.15 
 
 		 126 aa  121  4e-27  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.13666  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3314  ApaG  47.15 
 
 		 126 aa  121  4e-27  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1045  ApaG  47.15 
 
 		 126 aa  121  4e-27  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.102627  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0420  ApaG domain protein  47.9 
 
 		 211 aa  120  5e-27  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.416529 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0988  ApaG  47.15 
 
 		 126 aa  120  6e-27  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.233116  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2889  ApaG  44.17 
 
 		 126 aa  119  9.999999999999999e-27  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.203189  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0493  ApaG  47.37 
 
 		 131 aa  119  9.999999999999999e-27  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2372  ApaG  47.62 
 
 		 127 aa  118  1.9999999999999998e-26  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0601  ApaG  46.55 
 
 		 125 aa  119  1.9999999999999998e-26  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3636  ApaG  45.69 
 
 		 125 aa  119  1.9999999999999998e-26  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0667  ApaG  47.69 
 
 		 135 aa  117  4.9999999999999996e-26  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0437  ApaG  45.69 
 
 		 136 aa  117  4.9999999999999996e-26  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.30268 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1197  ApaG  50 
 
 		 134 aa  117  7e-26  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3484  ApaG  47.86 
 
 		 127 aa  116  9e-26  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.526547  normal  0.166283 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0562  ApaG  46.55 
 
 		 125 aa  116  9.999999999999999e-26  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3413  ApaG  46.09 
 
 		 127 aa  116  9.999999999999999e-26  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.329551  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0222  ApaG  48.7 
 
 		 128 aa  115  1.9999999999999998e-25  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.954602  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1013  ApaG  46.72 
 
 		 126 aa  115  1.9999999999999998e-25  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.156243  hitchhiker  0.00045551 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0878  ApaG  45.16 
 
 		 126 aa  115  1.9999999999999998e-25  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0723  ApaG  47.41 
 
 		 125 aa  115  1.9999999999999998e-25  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.854022 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00054  hypothetical protein  46.55 
 
 		 125 aa  114  3e-25  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.641296  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3549  ApaG domain protein  46.55 
 
 		 125 aa  114  3e-25  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3605  ApaG  46.55 
 
 		 125 aa  114  3e-25  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00118033 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0044  ApaG  46.55 
 
 		 125 aa  114  3e-25  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.271562  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04646  ApaG  47.54 
 
 		 127 aa  115  3e-25  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0854079  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00053  hypothetical protein  46.55 
 
 		 125 aa  114  3e-25  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.456951  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3574  ApaG  45.76 
 
 		 125 aa  114  3e-25  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0056  ApaG  46.55 
 
 		 125 aa  114  3e-25  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0915002  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0054  ApaG  46.55 
 
 		 125 aa  114  3e-25  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.496379 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3445  ApaG  45.76 
 
 		 125 aa  114  3e-25  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.310149  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0056  ApaG  46.55 
 
 		 125 aa  114  3e-25  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0054  ApaG  46.55 
 
 		 125 aa  114  3e-25  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00391573  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2820  ApaG  47.46 
 
 		 128 aa  114  5e-25  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.841755 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0861  ApaG  45.08 
 
 		 126 aa  114  5e-25  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2660  ApaG  44.72 
 
 		 139 aa  114  6e-25  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3833  ApaG  43.97 
 
 		 125 aa  114  6e-25  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0400  ApaG  42.5 
 
 		 126 aa  114  6.9999999999999995e-25  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0098  ApaG  45.69 
 
 		 125 aa  113  6.9999999999999995e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.267128  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0094  ApaG  45.69 
 
 		 125 aa  113  6.9999999999999995e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.237472  normal  0.301698 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0100  ApaG  45.69 
 
 		 125 aa  113  6.9999999999999995e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.819852  normal  0.574462 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0531  ApaG  45.67 
 
 		 130 aa  113  6.9999999999999995e-25  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0095  ApaG  45.69 
 
 		 125 aa  113  6.9999999999999995e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0093  ApaG  45.69 
 
 		 125 aa  113  6.9999999999999995e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.574173 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0599  ApaG  45.69 
 
 		 125 aa  113  6.9999999999999995e-25  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.121399  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0434  ApaG  42.5 
 
 		 126 aa  114  6.9999999999999995e-25  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.292503  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1353  ApaG  46.4 
 
 		 127 aa  113  6.9999999999999995e-25  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.214186  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1289  ApaG  46.4 
 
 		 127 aa  113  6.9999999999999995e-25  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0773  ApaG  45.76 
 
 		 125 aa  113  6.9999999999999995e-25  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0328045  normal  0.124499 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2860  ApaG  49.57 
 
 		 126 aa  113  7.999999999999999e-25  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00242464  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3080  ApaG  45.38 
 
 		 126 aa  113  8.999999999999998e-25  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0431  ApaG  42.5 
 
 		 126 aa  113  8.999999999999998e-25  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.425394  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3661  ApaG  45.69 
 
 		 142 aa  112  1.0000000000000001e-24  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0338  ApaG domain protein  47.06 
 
 		 127 aa  113  1.0000000000000001e-24  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0349  ApaG  45.83 
 
 		 135 aa  113  1.0000000000000001e-24  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.093684  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0963  ApaG  45.53 
 
 		 126 aa  112  1.0000000000000001e-24  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46840  ApaG  46.67 
 
 		 126 aa  112  2.0000000000000002e-24  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0721  ApaG  47.41 
 
 		 156 aa  112  2.0000000000000002e-24  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2359  ApaG domain protein  44.35 
 
 		 127 aa  111  3e-24  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.342277  hitchhiker  0.000000000770969 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>