More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smal_1521 on replicon NC_011071
Organism: Stenotrophomonas maltophilia R551-3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010717  PXO_00687  glucose-6-phosphate isomerase  81.51 
 
 		 504 aa  837    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.145124  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0200  glucose-6-phosphate isomerase  73.2 
 
 		 502 aa  726    Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.525891  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1521  glucose-6-phosphate isomerase  100 
 
 		 504 aa  1013    Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.353929  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0176  glucose-6-phosphate isomerase  73 
 
 		 502 aa  726    Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0819  glucose-6-phosphate isomerase  41.95 
 
 		 539 aa  420  1e-116  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0612  glucose-6-phosphate isomerase  43.76 
 
 		 548 aa  419  1e-116  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.000038742  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2119  Glucose-6-phosphate isomerase  48.37 
 
 		 552 aa  419  1e-116  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0430441 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0903  glucose-6-phosphate isomerase  42.99 
 
 		 549 aa  418  9.999999999999999e-116  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.144639  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1140  glucose-6-phosphate isomerase  41.91 
 
 		 547 aa  415  9.999999999999999e-116  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.279922  normal  0.256164 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1339  glucose-6-phosphate isomerase  42.99 
 
 		 548 aa  412  1e-114  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0803183  unclonable  0.00000158602 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1357  glucose-6-phosphate isomerase  46.08 
 
 		 540 aa  410  1e-113  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0553854  normal  0.605631 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2063  glucose-6-phosphate isomerase  42.91 
 
 		 560 aa  412  1e-113  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.210638  normal  0.260784 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0975  glucose-6-phosphate isomerase  42.09 
 
 		 549 aa  410  1e-113  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.307999  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2986  Glucose-6-phosphate isomerase  44.77 
 
 		 541 aa  408  1.0000000000000001e-112  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2367  glucose phosphate isomerase  43.04 
 
 		 548 aa  405  1.0000000000000001e-112  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000694926  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5218  glucose-6-phosphate isomerase  44.93 
 
 		 556 aa  406  1.0000000000000001e-112  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.454549 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6162  glucose-6-phosphate isomerase  45.44 
 
 		 556 aa  407  1.0000000000000001e-112  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1917  glucose-6-phosphate isomerase  45.44 
 
 		 556 aa  407  1.0000000000000001e-112  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0173524  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3148  glucose-6-phosphate isomerase  41.59 
 
 		 545 aa  405  1.0000000000000001e-112  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000357068  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0871  Glucose-6-phosphate isomerase  43.44 
 
 		 548 aa  406  1.0000000000000001e-112  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.881777  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1940  glucose-6-phosphate isomerase  45.44 
 
 		 540 aa  408  1.0000000000000001e-112  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.478064  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0481  Glucose-6-phosphate isomerase  42 
 
 		 552 aa  404  1e-111  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.734703 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1449  glucose-6-phosphate isomerase  46.35 
 
 		 540 aa  405  1e-111  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.446361  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03322  glucose-6-phosphate isomerase  42.34 
 
 		 549 aa  402  1e-111  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.345026  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2466  glucose-6-phosphate isomerase  46.35 
 
 		 540 aa  404  1e-111  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3363  glucose-6-phosphate isomerase  46.35 
 
 		 540 aa  405  1e-111  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.383524  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2347  glucose-6-phosphate isomerase  46.35 
 
 		 540 aa  404  1e-111  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.11339  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2494  Glucose-6-phosphate isomerase  43.44 
 
 		 551 aa  405  1e-111  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2132  glucose-6-phosphate isomerase  46.55 
 
 		 615 aa  404  1e-111  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.163418  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2308  glucose-6-phosphate isomerase  46.15 
 
 		 540 aa  404  1e-111  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.764178  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1942  glucose-6-phosphate isomerase  46.35 
 
 		 540 aa  405  1e-111  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1835  glucose-6-phosphate isomerase  44.93 
 
 		 540 aa  404  1e-111  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.312318 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1905  glucose-6-phosphate isomerase  44.93 
 
 		 556 aa  404  1e-111  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.139815  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0995  Glucose-6-phosphate isomerase  42.54 
 
 		 547 aa  405  1e-111  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1215  glucose-6-phosphate isomerase  46.35 
 
 		 540 aa  405  1e-111  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1019  glucose-6-phosphate isomerase  45.1 
 
 		 540 aa  403  1e-111  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.500907  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1048  glucose-6-phosphate isomerase  40.65 
 
 		 545 aa  399  9.999999999999999e-111  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.000131328  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4813  glucose-6-phosphate isomerase  42.99 
 
 		 554 aa  401  9.999999999999999e-111  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.167391  normal  0.0252012 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0373  glucose-6-phosphate isomerase  41.53 
 
 		 548 aa  401  9.999999999999999e-111  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1043  glucose-6-phosphate isomerase  41.51 
 
 		 545 aa  400  9.999999999999999e-111  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00018254  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2785  glucose-6-phosphate isomerase  41.65 
 
 		 550 aa  399  9.999999999999999e-111  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0501561  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1914  glucose-6-phosphate isomerase  45.69 
 
 		 540 aa  402  9.999999999999999e-111  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.572285  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0302  glucose-6-phosphate isomerase  41.53 
 
 		 548 aa  401  9.999999999999999e-111  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  unclonable  1.19722e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3918  glucose-6-phosphate isomerase  41.53 
 
 		 548 aa  401  9.999999999999999e-111  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.588557  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2968  glucose-6-phosphate isomerase  41.21 
 
 		 545 aa  401  9.999999999999999e-111  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.00000175964  normal  0.301061 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3050  glucose-6-phosphate isomerase  41.02 
 
 		 545 aa  399  9.999999999999999e-111  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0740985  normal  0.178291 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3591  glucose-6-phosphate isomerase  41.33 
 
 		 550 aa  399  9.999999999999999e-111  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.183253 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1095  glucose-6-phosphate isomerase  41.4 
 
 		 559 aa  400  9.999999999999999e-111  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.0000244755  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1073  glucose-6-phosphate isomerase  40.67 
 
 		 545 aa  399  9.999999999999999e-111  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0280  Glucose-6-phosphate isomerase  39.93 
 
 		 548 aa  395  1e-109  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0655697  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05125  glucose-6-phosphate isomerase  40 
 
 		 545 aa  395  1e-109  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3547  glucose-6-phosphate isomerase  42.08 
 
 		 545 aa  397  1e-109  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1161  glucose-6-phosphate isomerase  41.14 
 
 		 552 aa  397  1e-109  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.149944  normal  0.283638 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1006  glucose-6-phosphate isomerase  41.97 
 
 		 547 aa  397  1e-109  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.777587  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0932  glucose-6-phosphate isomerase  45.49 
 
 		 548 aa  397  1e-109  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0922928  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1515  glucose-6-phosphate isomerase  42 
 
 		 562 aa  396  1e-109  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.447812  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3246  glucose-6-phosphate isomerase  41.31 
 
 		 545 aa  397  1e-109  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000866912  decreased coverage  0.000837728 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0938  glucose-6-phosphate isomerase  40.22 
 
 		 549 aa  398  1e-109  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1144  glucose-6-phosphate isomerase  41.31 
 
 		 545 aa  398  1e-109  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0343286  normal  0.608954 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1110  glucose-6-phosphate isomerase  41.31 
 
 		 545 aa  398  1e-109  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00275432  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3594  glucose-6-phosphate isomerase  41.47 
 
 		 554 aa  394  1e-108  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1247  glucose-6-phosphate isomerase  41.46 
 
 		 546 aa  395  1e-108  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.237953  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0373  glucose-6-phosphate isomerase  41.25 
 
 		 549 aa  395  1e-108  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.92303  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1279  glucose-6-phosphate isomerase  40.91 
 
 		 545 aa  392  1e-108  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000145573  normal  0.0332252 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2287  glucose-6-phosphate isomerase  45.1 
 
 		 540 aa  392  1e-108  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.384563  normal  0.236333 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5449  glucose-6-phosphate isomerase  41.29 
 
 		 554 aa  390  1e-107  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0732  glucose-6-phosphate isomerase  42.72 
 
 		 554 aa  389  1e-107  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.309434  hitchhiker  0.0000815529 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002341  glucose-6-phosphate isomerase  39.74 
 
 		 550 aa  390  1e-107  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4700  glucose-6-phosphate isomerase  42.83 
 
 		 554 aa  389  1e-107  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0570543  hitchhiker  0.00570528 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1231  Glucose-6-phosphate isomerase  39.29 
 
 		 549 aa  389  1e-107  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.89106  hitchhiker  0.000628963 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62620  glucose-6-phosphate isomerase  41.1 
 
 		 554 aa  390  1e-107  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00012  glucose-6-phosphate isomerase  39.41 
 
 		 550 aa  389  1e-107  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0665  glucose-6-phosphate isomerase  42.37 
 
 		 553 aa  389  1e-107  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.796598  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2735  glucose-6-phosphate isomerase  41.6 
 
 		 547 aa  389  1e-107  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.076508 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0463  glucose-6-phosphate isomerase  41.51 
 
 		 550 aa  388  1e-106  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4566  glucose-6-phosphate isomerase  42.53 
 
 		 554 aa  385  1e-106  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.489818  normal  0.0824899 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1808  glucose-6-phosphate isomerase  42.53 
 
 		 554 aa  387  1e-106  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.339602 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0735  glucose-6-phosphate isomerase  39.22 
 
 		 547 aa  388  1e-106  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0581  glucose-6-phosphate isomerase  43.22 
 
 		 526 aa  387  1e-106  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5494  Glucose-6-phosphate isomerase  38.72 
 
 		 550 aa  385  1e-106  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0138523 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1088  glucose-6-phosphate isomerase  41.67 
 
 		 545 aa  388  1e-106  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.000310593  normal  0.0429778 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2947  glucose-6-phosphate isomerase  43.41 
 
 		 547 aa  387  1e-106  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1325  glucose-6-phosphate isomerase  41.57 
 
 		 531 aa  385  1e-106  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0252663  normal  0.710455 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0472  glucose-6-phosphate isomerase  39.24 
 
 		 567 aa  388  1e-106  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2901  glucose-6-phosphate isomerase  39.36 
 
 		 545 aa  386  1e-106  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3768  glucose-6-phosphate isomerase  41.47 
 
 		 549 aa  387  1e-106  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.510592  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1935  glucose-6-phosphate isomerase  43.19 
 
 		 547 aa  387  1e-106  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4477  glucose-6-phosphate isomerase  40.6 
 
 		 548 aa  389  1e-106  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3946  glucose-6-phosphate isomerase  41.47 
 
 		 549 aa  387  1e-106  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00605304  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1859  Glucose-6-phosphate isomerase  44.7 
 
 		 549 aa  387  1e-106  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.77335 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4701  glucose-6-phosphate isomerase  42.53 
 
 		 554 aa  385  1e-105  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00101931 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42740  glucose-6-phosphate isomerase  41.02 
 
 		 554 aa  384  1e-105  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.967363  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0285  glucose-6-phosphate isomerase  43.33 
 
 		 549 aa  384  1e-105  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.542029  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0299  glucose-6-phosphate isomerase  43.33 
 
 		 549 aa  384  1e-105  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.921042  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0369  glucose-6-phosphate isomerase  43.41 
 
 		 549 aa  384  1e-105  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0143  glucose-6-phosphate isomerase  41.04 
 
 		 541 aa  382  1e-105  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_16630  glucose-6-phosphate isomerase  41.21 
 
 		 554 aa  385  1e-105  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0118  glucose-6-phosphate isomerase  40.49 
 
 		 555 aa  384  1e-105  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1879  glucose-6-phosphate isomerase  43.45 
 
 		 541 aa  385  1e-105  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.10773  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4018  glucose-6-phosphate isomerase  39.11 
 
 		 548 aa  384  1e-105  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.732321 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>