40 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smal_1420 on replicon NC_011071
Organism: Stenotrophomonas maltophilia R551-3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011071  Smal_1420  hypothetical protein  100 
 
 		 170 aa  348  3e-95  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3561  hypothetical protein  58.9 
 
 		 185 aa  213  9e-55  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.248722  normal  0.0187655 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1747  hypothetical protein  55.56 
 
 		 177 aa  204  6e-52  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.497705  normal  0.12531 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7516  hypothetical protein  57.14 
 
 		 181 aa  197  7.999999999999999e-50  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1883  hypothetical protein  51.25 
 
 		 163 aa  179  2e-44  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.288724  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1531  hypothetical protein  50.97 
 
 		 163 aa  178  4e-44  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.348224  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1180  hypothetical protein  51.59 
 
 		 161 aa  171  2.9999999999999996e-42  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.214399 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3180  hypothetical protein  48.52 
 
 		 164 aa  171  2.9999999999999996e-42  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.942907  normal  0.672833 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2771  hypothetical protein  42.58 
 
 		 158 aa  136  2e-31  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00380494 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3355  cell division protein ZipA  45.45 
 
 		 172 aa  132  1.9999999999999998e-30  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1008  cell division protein ZipA  45.45 
 
 		 170 aa  132  3e-30  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0986  cell division protein ZipA  46.05 
 
 		 172 aa  131  3.9999999999999996e-30  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1020  cell division protein ZipA  45.39 
 
 		 188 aa  127  6e-29  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.594259  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3271  cell division protein ZipA  41.88 
 
 		 184 aa  125  3e-28  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1847  cell division protein ZipA  40.65 
 
 		 165 aa  123  2e-27  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.630805  normal  0.844154 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3212  cell division protein ZipA  36.13 
 
 		 164 aa  104  6e-22  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4505  hypothetical protein  54.44 
 
 		 93 aa  102  2e-21  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5693  hypothetical protein  55.88 
 
 		 112 aa  74.7  0.0000000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.201068  normal  0.494471 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06028  hypothetical protein  26.45 
 
 		 159 aa  71.2  0.000000000006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4301  hypothetical protein  28.66 
 
 		 169 aa  67  0.0000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2628  hypothetical protein  27.92 
 
 		 517 aa  55.1  0.0000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1431  hypothetical protein  29.19 
 
 		 527 aa  53.5  0.000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.882787  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2379  hypothetical protein  29.93 
 
 		 509 aa  53.5  0.000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0203614  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0177  hypothetical protein  24.68 
 
 		 172 aa  51.6  0.000005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4373  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  29.03 
 
 		 368 aa  51.6  0.000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.742659  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0914  kinase-like protein  25.61 
 
 		 200 aa  49.3  0.00003  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0184467  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2332  hypothetical protein  26.83 
 
 		 179 aa  48.1  0.00006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.440053  normal  0.950066 
 
 
-
 
NC_002936  DET1031  hypothetical protein  26.06 
 
 		 182 aa  47.8  0.00008  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0138831  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1681  hypothetical protein  28.08 
 
 		 166 aa  47  0.0001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1588  aminoglycoside phosphotransferase  29.38 
 
 		 518 aa  46.2  0.0002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.062948 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_902  hypothetical protein  24.48 
 
 		 200 aa  46.2  0.0002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00277515  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3317  aminoglycoside phosphotransferase  30.82 
 
 		 586 aa  45.8  0.0003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.479259  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2657  hypothetical protein  27.95 
 
 		 519 aa  45.1  0.0004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000160126  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1232  hypothetical protein  26.75 
 
 		 525 aa  43.5  0.001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.100547 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1463  tRNA delta(2)-isopentenylpyrophosphate transferase  26.29 
 
 		 312 aa  43.5  0.002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.320326  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2646  uncharacterized protein-like protein  29.38 
 
 		 518 aa  42.4  0.003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00596928  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0792  hypothetical protein  36.62 
 
 		 528 aa  42.4  0.003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.346746 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1873  hypothetical protein  28.48 
 
 		 521 aa  42  0.004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  1.00595e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2047  hypothetical protein  25.45 
 
 		 520 aa  42  0.004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00434824  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2137  hypothetical protein  30.61 
 
 		 134 aa  42  0.005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>