24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smal_0557 on replicon NC_011071
Organism: Stenotrophomonas maltophilia R551-3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011071  Smal_0557  hypothetical protein  100 
 
 		 284 aa  558  1e-158  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.17155  normal  0.0555578 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02687  hypothetical protein  63.84 
 
 		 279 aa  328  7e-89  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.475562  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2178  glycosyl transferase family protein  27.51 
 
 		 1256 aa  106  5e-22  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0057  methyltransferase FkbM family  21.38 
 
 		 723 aa  71.2  0.00000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1318  glycosyl transferase family protein  27.06 
 
 		 1314 aa  66.2  0.0000000006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.581884  normal  0.368047 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0632  glycosyl transferase family protein  26.64 
 
 		 1312 aa  65.1  0.000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.900451 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3797  hypothetical protein  25 
 
 		 1444 aa  64.3  0.000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6257  glycosyl transferase family protein  26.51 
 
 		 987 aa  60.8  0.00000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0286803  normal  0.0257469 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0549  glycosyl transferase family protein  26.87 
 
 		 818 aa  60.8  0.00000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0567321  normal  1 
 
 
-
 
NC_007641  Rru_B0044  glycosyl transferase family protein  29.2 
 
 		 746 aa  60.1  0.00000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4142  glycosyl transferase family protein  28.1 
 
 		 1287 aa  60.1  0.00000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000068759 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1063  glycosyl transferase family protein  25.73 
 
 		 818 aa  59.7  0.00000006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3992  glycosyl transferase family 2  26.61 
 
 		 1317 aa  57.8  0.0000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.33593  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2218  glycosyl transferase family protein  26.95 
 
 		 1035 aa  57  0.0000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.966726 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2627  glycosyl transferase family protein  24.6 
 
 		 1185 aa  56.6  0.0000005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.112993  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0930  glycosyl transferase family protein  26.87 
 
 		 827 aa  56.2  0.0000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0478435 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2175  glycosyl transferase family 2  25.87 
 
 		 995 aa  56.2  0.0000006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1793  glycosyl transferase, group 2 family protein  25.82 
 
 		 862 aa  55.8  0.0000007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.101573 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2886  glycosyl transferase family 2  27.93 
 
 		 1008 aa  55.1  0.000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0431865 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2494  glycosyl transferase family 2  25.26 
 
 		 1059 aa  55.1  0.000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6296  glycosyl transferase family 2  24.72 
 
 		 814 aa  53.9  0.000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1402  glycosyl transferase family protein  25 
 
 		 852 aa  53.5  0.000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1836  methyltransferase FkbM family  28.47 
 
 		 1673 aa  52.8  0.000007  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2807  glycosyl transferase family protein  24.12 
 
 		 419 aa  47.4  0.0003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>