49 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_5779 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_5779  ribosomal protein L29  100 
 
 		 64 aa  128  3e-29  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.450157  normal  0.411312 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4351  ribosomal protein L29  60.32 
 
 		 64 aa  81.3  0.000000000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.000000000139605  normal  0.11712 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3154  50S ribosomal protein L29  58.06 
 
 		 62 aa  77.4  0.00000000000006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.621454 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0610  ribosomal protein L29  50 
 
 		 69 aa  66.6  0.0000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.389405  normal  0.580538 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0189  50S ribosomal protein L29  50 
 
 		 62 aa  63.5  0.000000001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.277303 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1623  ribosomal protein L29  55.56 
 
 		 68 aa  62.8  0.000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0389  50S ribosomal protein L29  48.28 
 
 		 63 aa  58.5  0.00000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1516  ribosomal protein L29  45.61 
 
 		 69 aa  52.4  0.000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.380444  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0850  ribosomal protein L29  42.19 
 
 		 71 aa  52  0.000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05755  50S ribosomal protein L29  41.38 
 
 		 67 aa  51.6  0.000004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5187  50S ribosomal protein L29  45.45 
 
 		 66 aa  50.1  0.00001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.000000000115107  unclonable  8.22707e-26 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0139  50S ribosomal protein L29  45.45 
 
 		 66 aa  50.1  0.00001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000056255  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0149  50S ribosomal protein L29  45.45 
 
 		 66 aa  50.1  0.00001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000000829957  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0130  50S ribosomal protein L29  45.45 
 
 		 66 aa  50.1  0.00001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  1.72927e-62 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0118  50S ribosomal protein L29  45.45 
 
 		 74 aa  50.1  0.00001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000370217  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0113  50S ribosomal protein L29  45.45 
 
 		 66 aa  50.1  0.00001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000000302541  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0112  50S ribosomal protein L29  45.45 
 
 		 66 aa  50.1  0.00001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000000225905  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0118  50S ribosomal protein L29  45.45 
 
 		 66 aa  50.1  0.00001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000549386  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0114  50S ribosomal protein L29  45.45 
 
 		 74 aa  50.1  0.00001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  1.02215e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0118  50S ribosomal protein L29  45.45 
 
 		 66 aa  50.1  0.00001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000392079  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0112  50S ribosomal protein L29  45.45 
 
 		 74 aa  50.1  0.00001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000108927  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2703  ribosomal protein L29  45.61 
 
 		 65 aa  49.3  0.00002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.859678  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2911  50S ribosomal protein L29  40.35 
 
 		 67 aa  48.1  0.00003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0233  50S ribosomal protein L29  38.6 
 
 		 67 aa  47  0.00009  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2056  50S ribosomal protein L29  40.35 
 
 		 68 aa  46.2  0.0001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.000676986  normal  0.393938 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01250  ribosomal protein L29  38.18 
 
 		 71 aa  46.6  0.0001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.774041  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2288  50S ribosomal protein L29  40.35 
 
 		 68 aa  45.4  0.0002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  unclonable  0.0000000110804  hitchhiker  0.00284339 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1155  50S ribosomal protein L29  37.93 
 
 		 63 aa  45.8  0.0002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  unclonable  0.00000000143802  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1757  50S ribosomal protein L29  36.36 
 
 		 61 aa  45.1  0.0004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.171638  normal  0.386752 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0223  50S ribosomal protein L29  38.18 
 
 		 65 aa  43.9  0.0008  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000355433  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1859  50S ribosomal protein L29  34.38 
 
 		 74 aa  43.9  0.0008  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0881422  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2452  50S ribosomal protein L29  34.55 
 
 		 67 aa  43.1  0.001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.206737 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0294  50S ribosomal protein L29  33.33 
 
 		 69 aa  42.7  0.002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00154259  normal  0.0637097 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0299  50S ribosomal protein L29  35 
 
 		 69 aa  41.6  0.003  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  unclonable  6.39149e-29 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1737  50S ribosomal protein L29  36.36 
 
 		 72 aa  42  0.003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000000140424  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2170  ribosomal protein L29  33.33 
 
 		 64 aa  42  0.003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.37818  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0119  50S ribosomal protein L29  40 
 
 		 68 aa  41.6  0.004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.217136  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2415  50S ribosomal protein L29  36.84 
 
 		 68 aa  41.2  0.004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00000251007  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0115  50S ribosomal protein L29  40 
 
 		 66 aa  41.6  0.004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1340  50S ribosomal protein L29  36.36 
 
 		 66 aa  41.6  0.004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.282614  normal  0.101292 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1848  50S ribosomal protein L29  38.18 
 
 		 66 aa  41.2  0.005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.15271  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0430  50S ribosomal protein L29  38.6 
 
 		 67 aa  40.4  0.007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000570253  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1823  50S ribosomal protein L29  38.18 
 
 		 69 aa  40.4  0.008  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.340193  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09920  LSU ribosomal protein L29P  33.33 
 
 		 64 aa  40.4  0.008  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0238741  hitchhiker  0.0000015632 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0875  50S ribosomal protein L29  36.84 
 
 		 69 aa  40.4  0.008  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00116598  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2269  50S ribosomal protein L29  38.18 
 
 		 69 aa  40.4  0.008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.000389369  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2310  50S ribosomal protein L29  38.18 
 
 		 69 aa  40.4  0.008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000372663  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3659  50S ribosomal protein L29  32.79 
 
 		 69 aa  40  0.01  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000000152137  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0994  50S ribosomal protein L29  38.18 
 
 		 66 aa  40  0.01  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0283422 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>