More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_5570 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013730  Slin_5570  ribosomal protein S10  100 
 
 
101 aa  204  3e-52  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.966668  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4342  30S ribosomal protein S10  88.12 
 
 
101 aa  185  2e-46  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0589307  normal  0.109776 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3163  30S ribosomal protein S10  85.15 
 
 
101 aa  183  7e-46  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.547346 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05710  30S ribosomal protein S10  85.15 
 
 
101 aa  179  8.000000000000001e-45  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.751469  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0398  30S ribosomal protein S10  83.17 
 
 
101 aa  180  8.000000000000001e-45  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0598  ribosomal protein S10  85.15 
 
 
101 aa  178  2e-44  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.945265  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1614  ribosomal protein S10  81 
 
 
101 aa  174  5e-43  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1146  30S ribosomal protein S10  82.83 
 
 
103 aa  171  1.9999999999999998e-42  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.00144145  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1939  30S ribosomal protein S10  80.2 
 
 
101 aa  167  5e-41  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0124  30S ribosomal protein S10  78 
 
 
101 aa  166  9e-41  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0841  ribosomal protein S10  73 
 
 
102 aa  160  8.000000000000001e-39  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0421  30S ribosomal protein S10  69 
 
 
102 aa  151  2.9999999999999998e-36  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000238297  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2461  30S ribosomal protein S10  64.65 
 
 
102 aa  147  6e-35  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.043315 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0224  ribosomal protein S10  64.65 
 
 
102 aa  145  2.0000000000000003e-34  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0285  ribosomal protein S10  64 
 
 
102 aa  145  2.0000000000000003e-34  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0119984  hitchhiker  0.00531479 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0193  SSU ribosomal protein S10P  64.65 
 
 
103 aa  145  3e-34  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000113928  normal  0.060255 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0214  ribosomal protein S10  64 
 
 
102 aa  144  4.0000000000000006e-34  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000114911  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01160  ribosomal protein S10  64.65 
 
 
103 aa  142  1e-33  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000349687  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2334  ribosomal protein S10  62.63 
 
 
103 aa  142  2e-33  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.000000521962  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2712  ribosomal protein S10  60.61 
 
 
102 aa  140  5e-33  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.00000160608  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1525  ribosomal protein S10  60.61 
 
 
102 aa  140  6e-33  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.651999  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0866  30S ribosomal protein S10  64.65 
 
 
102 aa  140  8e-33  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.0000000000610931  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2065  30S ribosomal protein S10  66 
 
 
103 aa  138  1.9999999999999998e-32  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00000262077  normal  0.381336 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0420  SSU ribosomal protein S10P  64 
 
 
103 aa  138  1.9999999999999998e-32  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.00124832  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0757  30S ribosomal protein S10  63.64 
 
 
103 aa  139  1.9999999999999998e-32  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000000515165  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2902  30S ribosomal protein S10  62.63 
 
 
103 aa  138  1.9999999999999998e-32  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000000000945352  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1484  30S ribosomal protein S10  63.64 
 
 
102 aa  139  1.9999999999999998e-32  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.0000000000000272811  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0179  30S ribosomal protein S10  64 
 
 
103 aa  137  4.999999999999999e-32  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.000562136  normal  0.948551 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0290  30S ribosomal protein S10  61 
 
 
102 aa  137  4.999999999999999e-32  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000153979  unclonable  7.221610000000001e-29 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1852  30S ribosomal protein S10  65.31 
 
 
103 aa  137  6e-32  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.00631354  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2230  30S ribosomal protein S10  65 
 
 
103 aa  137  6e-32  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00000010339  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0288  30S ribosomal protein S10  64 
 
 
103 aa  137  7e-32  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.42125  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3865  30S ribosomal protein S10  61.62 
 
 
103 aa  136  7.999999999999999e-32  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2424  30S ribosomal protein S10  65.31 
 
 
103 aa  136  7.999999999999999e-32  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.0052526  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2951  30S ribosomal protein S10  62 
 
 
103 aa  135  1e-31  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  decreased coverage  0.00000133875  hitchhiker  0.000000722255 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3298  30S ribosomal protein S10  62 
 
 
103 aa  135  1e-31  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  hitchhiker  0.0000231204  hitchhiker  0.000170279 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3020  30S ribosomal protein S10  62 
 
 
104 aa  135  1e-31  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.000044729  hitchhiker  0.00550197 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3181  30S ribosomal protein S10  62 
 
 
102 aa  135  1e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.00000486821  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0404  30S ribosomal protein S10  62 
 
 
102 aa  135  1e-31  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.00000000016581  normal  0.139805 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0766  30S ribosomal protein S10  64 
 
 
102 aa  135  1e-31  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.300244  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3323  30S ribosomal protein S10  62 
 
 
102 aa  135  1e-31  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.434875  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1599  30S ribosomal protein S10  61.62 
 
 
106 aa  135  2e-31  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0707  30S ribosomal protein S10  61.62 
 
 
105 aa  135  2e-31  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.282417  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1163  ribosomal protein S10  60 
 
 
102 aa  135  2e-31  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  unclonable  0.000000000940072  hitchhiker  0.000000509949 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0104  30S ribosomal protein S10  61.62 
 
 
102 aa  134  3.0000000000000003e-31  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.0000000227261  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0318  30S ribosomal protein S10  60 
 
 
103 aa  134  3.0000000000000003e-31  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  1.1858999999999998e-21  hitchhiker  0.0000342143 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5196  30S ribosomal protein S10  61.62 
 
 
102 aa  134  3.0000000000000003e-31  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.000000000324324  unclonable  1.19812e-25 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0319  30S ribosomal protein S10  60.61 
 
 
106 aa  134  3.0000000000000003e-31  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0717692  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0278  30S ribosomal protein S10  61 
 
 
102 aa  134  3.0000000000000003e-31  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0000000078248  unclonable  0.0000000940306 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2170  ribosomal protein S10  62 
 
 
103 aa  134  4e-31  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  hitchhiker  0.00128539  normal  0.372781 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0183  30S ribosomal protein S10  63.27 
 
 
103 aa  134  4e-31  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000000140291  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4318  30S ribosomal protein S10  63.27 
 
 
103 aa  134  4e-31  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000000242072  unclonable  0.0000000000477389 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0468  30S ribosomal protein S10  62 
 
 
103 aa  134  4e-31  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.000000173961  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4691  30S ribosomal protein S10  63.27 
 
 
103 aa  134  4e-31  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.00000000838307  unclonable  0.0000000216996 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0230  30S ribosomal protein S10  64.29 
 
 
103 aa  134  5e-31  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0105  30S ribosomal protein S10  60.61 
 
 
102 aa  134  5e-31  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  unclonable  8.602740000000001e-23  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0103  30S ribosomal protein S10  60.61 
 
 
102 aa  134  5e-31  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.0000000000000504345  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0140  30S ribosomal protein S10  60.61 
 
 
102 aa  134  5e-31  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.000000000306915  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0121  30S ribosomal protein S10  60.61 
 
 
102 aa  134  5e-31  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  2.5859e-62 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0130  30S ribosomal protein S10  60.61 
 
 
102 aa  134  5e-31  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.00000826776  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00444  30S ribosomal protein S10  63 
 
 
103 aa  134  5e-31  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0405184  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0103  30S ribosomal protein S10  60.61 
 
 
102 aa  134  5e-31  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000000302631  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2715  30S ribosomal protein S10  62.63 
 
 
102 aa  134  5e-31  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  unclonable  0.000000000442606  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2400  30S ribosomal protein S10  62.63 
 
 
102 aa  134  5e-31  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.0000000028025  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0198  30S ribosomal protein S10  64.29 
 
 
103 aa  134  5e-31  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000200655  unclonable  0.0000000000157318 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0193  30S ribosomal protein S10  64.29 
 
 
103 aa  134  5e-31  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.00000424599  decreased coverage  0.00027939 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0157  30S ribosomal protein S10  64.29 
 
 
103 aa  134  5e-31  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.00000000255753  decreased coverage  0.0000448668 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0195  30S ribosomal protein S10  60.78 
 
 
102 aa  134  5e-31  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.00451174  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0198  30S ribosomal protein S10  64.29 
 
 
103 aa  134  5e-31  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.00000000267319  hitchhiker  0.0000000013297 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2373  30S ribosomal protein S10  63.64 
 
 
103 aa  134  6.0000000000000005e-31  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.837203  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1746  30S ribosomal protein S10  59 
 
 
106 aa  134  6.0000000000000005e-31  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000231589  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0477  30S ribosomal protein S10  60.61 
 
 
105 aa  133  6.0000000000000005e-31  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0395283  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3444  30S ribosomal protein S10  61.62 
 
 
103 aa  133  6.0000000000000005e-31  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  decreased coverage  0.000018475  normal  0.343621 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0195  30S ribosomal protein S10  63.27 
 
 
103 aa  133  7.000000000000001e-31  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.000000000000645818  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4171  30S ribosomal protein S10  63.27 
 
 
103 aa  133  7.000000000000001e-31  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000000385608  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3760  30S ribosomal protein S10  63.27 
 
 
103 aa  133  7.000000000000001e-31  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000000001631  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0337  30S ribosomal protein S10  61.62 
 
 
103 aa  133  7.000000000000001e-31  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  hitchhiker  0.0012954  decreased coverage  0.000295628 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0390  30S ribosomal protein S10  61.62 
 
 
103 aa  133  7.000000000000001e-31  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000705562  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0272  30S ribosomal protein S10  61.62 
 
 
103 aa  133  7.000000000000001e-31  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  unclonable  0.0000000000156586  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0199  30S ribosomal protein S10  63.27 
 
 
103 aa  133  7.000000000000001e-31  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.0000000181945  unclonable  0.00000889639 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0277  30S ribosomal protein S10  61.62 
 
 
103 aa  133  7.000000000000001e-31  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  decreased coverage  0.0000127009  decreased coverage  0.000000000926134 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4057  30S ribosomal protein S10  63.27 
 
 
103 aa  133  7.000000000000001e-31  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.00000000379961  hitchhiker  0.000000000138432 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_16871  30S ribosomal protein S10  59.6 
 
 
106 aa  133  9e-31  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1073  30S ribosomal protein S10  59.6 
 
 
106 aa  133  9e-31  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2023  30S ribosomal protein S10  59.6 
 
 
106 aa  133  9e-31  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.532021  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_19481  30S ribosomal protein S10  59.6 
 
 
106 aa  133  9e-31  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0109  30S ribosomal protein S10  59.6 
 
 
102 aa  132  9.999999999999999e-31  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.000000000000428723  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_16981  30S ribosomal protein S10  59.6 
 
 
106 aa  132  9.999999999999999e-31  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0109  30S ribosomal protein S10  59.6 
 
 
102 aa  132  9.999999999999999e-31  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.000000000000209715  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3796  30S ribosomal protein S10  61.62 
 
 
104 aa  133  9.999999999999999e-31  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.00000453996  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0959  30S ribosomal protein S10  63.27 
 
 
103 aa  133  9.999999999999999e-31  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000233604  unclonable  0.00000000572443 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0859  30S ribosomal protein S10  62 
 
 
109 aa  132  9.999999999999999e-31  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.591238  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0147  ribosomal protein S10  63.27 
 
 
103 aa  132  9.999999999999999e-31  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.0000000000495355  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0212  30S ribosomal protein S10  63.27 
 
 
103 aa  132  9.999999999999999e-31  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.000000000277123  unclonable  0.00000693674 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_17101  30S ribosomal protein S10  59.6 
 
 
106 aa  132  9.999999999999999e-31  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3747  30S ribosomal protein S10  60 
 
 
103 aa  132  1.9999999999999998e-30  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.0000000016598  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0663  30S ribosomal protein S10  59.6 
 
 
105 aa  132  1.9999999999999998e-30  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.11245  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1286  30S ribosomal protein S10  59.6 
 
 
105 aa  132  1.9999999999999998e-30  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00174582  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0326  30S ribosomal protein S10  60 
 
 
103 aa  132  1.9999999999999998e-30  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00113902  normal  0.0302801 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3710  ribosomal protein S10  62.24 
 
 
103 aa  132  1.9999999999999998e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  decreased coverage  0.000120586  normal  0.692874 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>