17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_4982 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013730  Slin_4982  fatty acid desaturase  100 
 
 
343 aa  707    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000653889 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5868  fatty acid desaturase  55.87 
 
 
327 aa  377  1e-103  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0284  fatty acid desaturase  45.69 
 
 
387 aa  286  4e-76  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1351  fatty acid desaturase  44.06 
 
 
345 aa  269  4e-71  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.223038 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_54788  fatty acid desaturase (DSD1)  37.71 
 
 
371 aa  224  1e-57  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.282739 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04405  sphingolipid desaturase, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G06940)  38.02 
 
 
418 aa  203  3e-51  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.314247 
 
 
-
 
NC_006670  CNA06240  fatty acid desaturase, putative  37.76 
 
 
429 aa  202  7e-51  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011687  PHATRDRAFT_22677  dihydroderamide delta-4 desaturase  36.91 
 
 
321 aa  197  2.0000000000000003e-49  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.404878  n/a   
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_46383  predicted protein  35.87 
 
 
454 aa  53.1  0.000007  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.372126  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1774  fatty acid desaturase  24.73 
 
 
349 aa  47.4  0.0004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1495  Fatty acid desaturase  24.21 
 
 
346 aa  45.8  0.001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1748  putative fatty acid desaturase  23.59 
 
 
313 aa  44.7  0.002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.518351  normal  0.688058 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4259  fatty acid desaturase  24.54 
 
 
349 aa  44.7  0.002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.0841224 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3764  fatty acid desaturase  24.47 
 
 
351 aa  44.3  0.003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.393877  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4517  fatty acid desaturase, putative  38.89 
 
 
316 aa  43.9  0.004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.61204  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1693  Fatty acid desaturase  26.06 
 
 
306 aa  43.1  0.006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2182  fatty acid desaturase  23.08 
 
 
318 aa  42.7  0.01  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0979367  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>