25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_4848 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013730  Slin_4848  PglZ domain protein  100 
 
 
868 aa  1761    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.774489  normal  0.754921 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1607  hypothetical protein  28.59 
 
 
832 aa  221  3.9999999999999997e-56  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.181523 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2203  PglZ domain protein  34.26 
 
 
835 aa  217  8e-55  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.742987  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2284  alkaline phosphatase domain-containing protein  36.63 
 
 
866 aa  214  7.999999999999999e-54  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0564  alkaline phosphatase domain-containing protein  37.57 
 
 
838 aa  208  3e-52  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3730  hypothetical protein  33.55 
 
 
835 aa  207  9e-52  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0566651  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1676  PglZ domain protein  33.92 
 
 
832 aa  202  1.9999999999999998e-50  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.358895  hitchhiker  0.00067238 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0300  PglZ domain protein  31.87 
 
 
872 aa  200  1.0000000000000001e-49  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0340  hypothetical protein  32.66 
 
 
865 aa  199  2.0000000000000003e-49  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.808986  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1905  hypothetical protein  28.6 
 
 
873 aa  185  4.0000000000000006e-45  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1300  PglZ domain protein  29.75 
 
 
850 aa  182  2e-44  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0907867  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2489  hypothetical protein  31.82 
 
 
873 aa  179  3e-43  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5031  hypothetical protein  28.52 
 
 
868 aa  172  3e-41  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_02950  conserved hypothetical protein TIGR02687  30.12 
 
 
856 aa  148  5e-34  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2106  hypothetical protein  25.97 
 
 
865 aa  82.8  0.00000000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1125  PglZ domain protein  22.53 
 
 
856 aa  75.9  0.000000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1157  PglZ domain protein  26.24 
 
 
953 aa  70.9  0.0000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1236  PglZ domain protein  27.06 
 
 
1016 aa  57.8  0.0000009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_259  hypothetical protein  24.28 
 
 
841 aa  56.6  0.000002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0602  PglZ domain protein  26.73 
 
 
1016 aa  55.5  0.000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1918  PglZ domain protein  26.16 
 
 
730 aa  53.1  0.00002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3079  PglZ domain protein  25.43 
 
 
971 aa  49.3  0.0004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.237355  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1821  hypothetical protein  22.47 
 
 
679 aa  47.8  0.001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.0474438 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0998  hypothetical protein  24.15 
 
 
746 aa  47  0.002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4279  alkaline phosphatase domain-containing protein  26.45 
 
 
908 aa  46.2  0.003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>