14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_1768 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_5531  hypothetical protein  63.08 
 
 		 564 aa  679    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0122802  normal  0.901162 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1768  hypothetical protein  100 
 
 		 560 aa  1130    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.143004  normal  0.714644 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4223  hypothetical protein  48.36 
 
 		 542 aa  467  9.999999999999999e-131  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.355656  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0538  hypothetical protein  37.13 
 
 		 521 aa  298  2e-79  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3809  RagB/SusD domain protein  24.76 
 
 		 469 aa  52.4  0.00002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00323854  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6228  RagB/SusD domain protein  26.56 
 
 		 511 aa  48.5  0.0003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6287  RagB/SusD domain protein  31.97 
 
 		 531 aa  47.4  0.0007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.360151 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4010  RagB/SusD domain protein  25.71 
 
 		 480 aa  47  0.001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.19727  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4610  RagB/SusD domain protein  22.11 
 
 		 494 aa  44.7  0.004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0690802  normal  0.474781 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0667  RagB/SusD domain protein  26.17 
 
 		 463 aa  45.1  0.004  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0698299  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4497  RagB/SusD domain protein  31.51 
 
 		 531 aa  44.3  0.005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.515459 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0276  RagB/SusD domain protein  35.16 
 
 		 582 aa  44.7  0.005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.125375  normal  0.63958 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3391  RagB/SusD domain protein  37.33 
 
 		 507 aa  43.9  0.008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.540028  normal  0.274912 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6127  putative lipoprotein  35.14 
 
 		 437 aa  43.5  0.009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>