31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_0374 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_0374  periplasmic ATP/GTP-binding protein  100 
 
 		 288 aa  583  1.0000000000000001e-165  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3578  ATP/GTP-binding  42.35 
 
 		 308 aa  206  5e-52  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.723443  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2979  ATP/GTP-binding  43.06 
 
 		 277 aa  205  8e-52  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0296682  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3843  NHL repeat containing protein  40.7 
 
 		 282 aa  189  5e-47  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1927  ATP/GTP-binding  41.09 
 
 		 275 aa  186  3e-46  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0980  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  36.82 
 
 		 445 aa  167  2e-40  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0105637 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2273  hypothetical protein  35.84 
 
 		 294 aa  161  1e-38  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0453  periplasmic ATP/GTP-binding protein  36.11 
 
 		 273 aa  161  2e-38  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.879062  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2945  hypothetical protein  27.5 
 
 		 288 aa  114  1.0000000000000001e-24  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1011  periplasmic ATP/GTP-binding protein  31.52 
 
 		 296 aa  91.7  1e-17  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000134126  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0535  NHL repeat-containing protein  31.15 
 
 		 642 aa  92  1e-17  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  unclonable  0.0000000386483  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0124  conserved hypothetical protein, probable ATP/GTP-binding protein  32.95 
 
 		 278 aa  87  4e-16  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.305705  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2648  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  28.2 
 
 		 330 aa  86.7  4e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0707367  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2603  SMP-30/gluconolaconase/LRE-like region  28.89 
 
 		 331 aa  73.2  0.000000000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.776475  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1185  hypothetical protein  31.67 
 
 		 283 aa  73.2  0.000000000005  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.561185  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1062  hypothetical protein  31.25 
 
 		 283 aa  73.2  0.000000000005  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.930441  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1036  hypothetical protein  30.35 
 
 		 288 aa  69.3  0.00000000007  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.582749  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0892  hypothetical protein  30.35 
 
 		 288 aa  69.3  0.00000000007  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.237155 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0841  hypothetical protein  31.8 
 
 		 244 aa  63.9  0.000000003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0066  putative ATP/GTP-binding protein  25.43 
 
 		 304 aa  49.3  0.00008  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.268496 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0275  hypothetical protein  24.38 
 
 		 502 aa  49.3  0.00008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.152973  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0355  NHL repeat-containing protein  25.78 
 
 		 1030 aa  47.8  0.0002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.64892  normal  0.0641589 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3024  TPR repeat-containing protein  32.33 
 
 		 1230 aa  47  0.0004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.446617  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1858  serine/threonine-protein kinase  27.33 
 
 		 274 aa  45.4  0.001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.129879 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5916  NHL repeat-containing protein  30.65 
 
 		 379 aa  44.7  0.002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.205268  normal  0.0756085 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3524  hypothetical protein  40.82 
 
 		 413 aa  43.1  0.005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.661679  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3592  hypothetical protein  40.82 
 
 		 413 aa  43.1  0.005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.203962  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0370  Fibronectin type III domain protein  34.52 
 
 		 841 aa  42.7  0.006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.800383  normal  0.932394 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2854  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  24.82 
 
 		 1292 aa  42.4  0.009  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0274394  normal  0.093276 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1786  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  24.48 
 
 		 526 aa  42.4  0.009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.222131 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1244  strictosidine synthase  24.89 
 
 		 337 aa  42.4  0.01  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.205985  normal  0.761623 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>