30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sked_36310 on replicon NC_013521
Organism: Sanguibacter keddieii DSM 10542



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013521  Sked_36310  hypothetical protein  100 
 
 		 427 aa  794    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.740551  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1452  protein of unknown function DUF1624  35.8 
 
 		 411 aa  155  2e-36  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000000000000779401 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_18000  hypothetical protein  36.24 
 
 		 405 aa  140  3e-32  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.514365  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0644  hypothetical protein  32.08 
 
 		 412 aa  122  9.999999999999999e-27  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.353612  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1450  hypothetical protein  32.44 
 
 		 411 aa  121  3e-26  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.763514  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1481  hypothetical protein  35.07 
 
 		 378 aa  120  3.9999999999999996e-26  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.526682  normal  0.162192 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3181  hypothetical protein  35.99 
 
 		 371 aa  115  2.0000000000000002e-24  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20080  predicted membrane protein  33.53 
 
 		 450 aa  102  1e-20  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.0149559 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3252  hypothetical protein  32.38 
 
 		 432 aa  99  2e-19  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2675  hypothetical protein  31.2 
 
 		 434 aa  97.4  4e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.397563 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1542  hypothetical protein  30.32 
 
 		 445 aa  95.1  2e-18  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.170969  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_09280  hypothetical protein  34.64 
 
 		 313 aa  94.7  3e-18  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3077  hypothetical protein  34.91 
 
 		 404 aa  92  2e-17  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1560  hypothetical protein  31.15 
 
 		 382 aa  91.7  3e-17  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.214975  normal  0.807756 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2673  hypothetical protein  28.41 
 
 		 434 aa  91.3  3e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.277255 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2244  hypothetical protein  31.74 
 
 		 450 aa  84  0.000000000000005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0858  hypothetical protein  30.34 
 
 		 394 aa  79.7  0.0000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.581256  normal  0.122318 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3325  hypothetical protein  38.21 
 
 		 402 aa  79.3  0.0000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0514676  normal  0.538152 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0333  hypothetical protein  29.62 
 
 		 538 aa  78.6  0.0000000000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.115307 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4532  transport protein  30.31 
 
 		 354 aa  77.4  0.0000000000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3869  hypothetical protein  28.72 
 
 		 385 aa  75.5  0.000000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0435346  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2368  hypothetical protein  29.33 
 
 		 402 aa  65.5  0.000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_07140  predicted membrane protein  31.48 
 
 		 423 aa  59.7  0.0000001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.125251  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06780  hypothetical protein  35.14 
 
 		 412 aa  58.9  0.0000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0991  hypothetical protein  30 
 
 		 362 aa  57.8  0.0000004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2015  hypothetical protein  24.41 
 
 		 361 aa  57  0.0000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0652327  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1197  hypothetical protein  27.64 
 
 		 386 aa  55.1  0.000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.673489  normal  0.324523 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2187  hypothetical protein  26.34 
 
 		 361 aa  53.5  0.000007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.490446  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1720  transport protein  27.38 
 
 		 344 aa  52.8  0.00001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0017  hypothetical protein  24.34 
 
 		 374 aa  44.7  0.003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>