14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sked_23130 on replicon NC_013521
Organism: Sanguibacter keddieii DSM 10542



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013521  Sked_23130  hypothetical protein  100 
 
 		 664 aa  1305    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.0979095 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2986  hypothetical protein  41.65 
 
 		 647 aa  339  8e-92  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4207  Tetratricopeptide TPR_4  30.53 
 
 		 882 aa  145  3e-33  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.024812  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0268  hypothetical protein  30.47 
 
 		 1015 aa  136  1.9999999999999998e-30  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.564116 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0694  Tetratricopeptide TPR_4  31.92 
 
 		 1162 aa  128  3e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1830  hypothetical protein  32.16 
 
 		 368 aa  102  2e-20  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5467  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  28.99 
 
 		 943 aa  92.4  3e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0381  tetratricopeptide TPR_4  26.8 
 
 		 359 aa  84.7  0.000000000000005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2462  hypothetical protein  29.56 
 
 		 942 aa  76.6  0.000000000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.0374837 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0494  hypothetical protein  27.32 
 
 		 735 aa  68.2  0.0000000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4022  hypothetical protein  28.45 
 
 		 750 aa  61.2  0.00000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.000110855  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0963  hypothetical protein  25 
 
 		 331 aa  52  0.00003  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.028158  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1391  hypothetical protein  26.84 
 
 		 544 aa  48.1  0.0005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.706287 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1780  hypothetical protein  21.07 
 
 		 363 aa  47.4  0.001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>