More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sked_20280 on replicon NC_013521
Organism: Sanguibacter keddieii DSM 10542



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013521  Sked_20280  Zn-dependent oxidoreductase, NADPH:quinone reductase  100 
 
 
315 aa  611  9.999999999999999e-175  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.157116 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1141  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  46.67 
 
 
312 aa  230  3e-59  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6716  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  46.69 
 
 
324 aa  196  3e-49  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.177246  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1508  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  43.3 
 
 
341 aa  185  7e-46  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2892  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  34.33 
 
 
317 aa  128  1.0000000000000001e-28  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7910  alcohol dehydrogenase GroES domain protein  34.29 
 
 
302 aa  123  3e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.989573  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2797  zinc-binding alcohol dehydrogenase  33.73 
 
 
317 aa  122  8e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0771012  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30440  Zn-dependent oxidoreductase, NADPH:quinone reductase  31.82 
 
 
307 aa  122  8e-27  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.051943  normal  0.176939 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3480  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  32.92 
 
 
307 aa  122  9.999999999999999e-27  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.135738  normal  0.315176 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9339  alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  41.8 
 
 
311 aa  122  9.999999999999999e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.130562  normal  0.653712 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2779  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain-containing protein  32.76 
 
 
342 aa  121  1.9999999999999998e-26  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.322077  normal  0.949472 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1237  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  34.05 
 
 
308 aa  120  3e-26  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.309237  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2213  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  33.44 
 
 
310 aa  119  4.9999999999999996e-26  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2124  alcohol dehydrogenase  32.28 
 
 
335 aa  118  9.999999999999999e-26  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.185459  normal  0.116252 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6496  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  31.86 
 
 
305 aa  116  3.9999999999999997e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4105  zinc-binding alcohol dehydrogenase  32.48 
 
 
304 aa  116  6e-25  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4572  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  33.03 
 
 
310 aa  115  6.9999999999999995e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.581889 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1905  Alcohol dehydrogenase GroES domain-containing protein  34.48 
 
 
297 aa  115  1.0000000000000001e-24  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.248602  normal  0.163683 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5739  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  32.48 
 
 
308 aa  114  2.0000000000000002e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.382073  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5331  zinc-binding alcohol dehydrogenase  37.39 
 
 
324 aa  114  2.0000000000000002e-24  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1679  alcohol dehydrogenase  32 
 
 
318 aa  114  2.0000000000000002e-24  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5420  alcohol dehydrogenase  37.39 
 
 
324 aa  114  2.0000000000000002e-24  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1484  alcohol dehydrogenase  32.63 
 
 
322 aa  114  3e-24  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1998  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  32 
 
 
318 aa  113  3e-24  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.751932  normal 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7371  zinc-binding oxidoreductase  31.37 
 
 
304 aa  113  4.0000000000000004e-24  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.321039  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2242  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  30.15 
 
 
314 aa  113  4.0000000000000004e-24  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0066  alcohol dehydrogenase  33.96 
 
 
309 aa  113  4.0000000000000004e-24  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1683  NADPH:quinone reductase  29.97 
 
 
308 aa  113  5e-24  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.169179 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2543  alcohol dehydrogenase  28.26 
 
 
308 aa  112  9e-24  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00549026  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4346  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  32.3 
 
 
306 aa  112  9e-24  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0220735  normal  0.953349 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5892  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  31.46 
 
 
310 aa  110  2.0000000000000002e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.338671 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1742  Alcohol dehydrogenase GroES domain-containing protein  33.73 
 
 
314 aa  110  3e-23  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2235  alcohol dehydrogenase  30.54 
 
 
330 aa  110  4.0000000000000004e-23  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1910  zinc-binding alcohol dehydrogenase  30.7 
 
 
324 aa  109  5e-23  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2563  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  32.2 
 
 
311 aa  109  5e-23  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.111047  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1067  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  32.62 
 
 
309 aa  108  8.000000000000001e-23  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4637  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  33.66 
 
 
309 aa  108  8.000000000000001e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5659  alcohol dehydrogenase  31.45 
 
 
329 aa  108  1e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.591767 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2217  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  35.33 
 
 
310 aa  108  1e-22  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0739832  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3723  zinc-binding alcohol dehydrogenase  31.45 
 
 
329 aa  108  1e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.250647  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2982  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  32.13 
 
 
328 aa  108  1e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4645  alcohol dehydrogenase  31.45 
 
 
329 aa  108  1e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4770  alcohol dehydrogenase  34.82 
 
 
305 aa  108  1e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1981  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain-containing protein  32.07 
 
 
328 aa  108  2e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0747083  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5710  alcohol dehydrogenase  36.49 
 
 
324 aa  108  2e-22  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2871  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  30.66 
 
 
342 aa  107  2e-22  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.872591 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3068  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  31.33 
 
 
326 aa  107  3e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0181294  normal  0.830882 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0091  alcohol dehydrogenase  32.84 
 
 
330 aa  107  3e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1020  quinone oxidoreductase  28.05 
 
 
315 aa  107  3e-22  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.740068  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2916  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  30.75 
 
 
318 aa  107  4e-22  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.0952253 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0422  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  34.4 
 
 
334 aa  106  6e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0483327  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2376  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  32.85 
 
 
322 aa  105  7e-22  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.487886  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2075  alcohol dehydrogenase  30.42 
 
 
322 aa  105  7e-22  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1228  alcohol dehydrogenase  29.77 
 
 
327 aa  105  8e-22  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3468  alcohol dehydrogenase  29.52 
 
 
328 aa  105  8e-22  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.92927  normal  0.411159 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3358  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  29.78 
 
 
308 aa  105  1e-21  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5388  alcohol dehydrogenase  29.73 
 
 
326 aa  105  1e-21  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.497485 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0930  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  28.31 
 
 
324 aa  105  1e-21  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3113  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  33.63 
 
 
334 aa  104  2e-21  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.485506  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0899  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  31.34 
 
 
326 aa  104  2e-21  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0707  zinc-binding alcohol dehydrogenase  30.79 
 
 
324 aa  103  3e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0261  NAD(P)H quinone oxidoreductase PIG3 family  30.45 
 
 
324 aa  104  3e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1821  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  34.67 
 
 
322 aa  103  4e-21  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00168562  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3232  alcohol dehydrogenase  28.44 
 
 
331 aa  103  5e-21  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3137  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  29.27 
 
 
310 aa  102  6e-21  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.532617  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0886  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain-containing protein  30.3 
 
 
315 aa  102  6e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.436987 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5628  alcohol dehydrogenase  33.54 
 
 
308 aa  102  9e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3438  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  32.83 
 
 
321 aa  102  1e-20  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.661509  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3894  alcohol dehydrogenase  37.81 
 
 
312 aa  100  2e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00052515  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5178  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  32.92 
 
 
326 aa  101  2e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0108  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  27.52 
 
 
639 aa  101  2e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3403  Alcohol dehydrogenase GroES domain-containing protein  32.62 
 
 
310 aa  100  2e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.046263  normal  0.0678818 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3171  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  33.33 
 
 
293 aa  101  2e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2517  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  31.72 
 
 
321 aa  101  2e-20  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0419474  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0095  alcohol dehydrogenase  30.21 
 
 
324 aa  101  2e-20  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.414698 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2310  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain-containing protein  32.61 
 
 
310 aa  100  2e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2910  zinc-binding alcohol dehydrogenase  27.69 
 
 
320 aa  101  2e-20  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0554671 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0384  NADPH-quinone reductase  31.9 
 
 
339 aa  100  3e-20  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0562  zinc-binding alcohol dehydrogenase  30.94 
 
 
326 aa  100  3e-20  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.6978  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3308  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  31.94 
 
 
321 aa  100  4e-20  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000692795  normal  0.0484159 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0404  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  30.5 
 
 
324 aa  100  4e-20  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0179654  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0924  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  31.04 
 
 
326 aa  100  4e-20  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.284125 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7251  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  32.19 
 
 
300 aa  100  4e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0961  alcohol dehydrogenase  31.64 
 
 
326 aa  99.8  5e-20  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00699995 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2740  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  29.82 
 
 
328 aa  99.8  5e-20  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.42219  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2967  alcohol dehydrogenase  27.27 
 
 
313 aa  99.8  5e-20  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1429  zinc-binding alcohol dehydrogenase  32.16 
 
 
331 aa  99  9e-20  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11482  quinone reductase qor (NADPH:quinone reductase) (zeta-crystallin protein)  30.97 
 
 
328 aa  99  1e-19  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000201943  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2644  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  26.81 
 
 
329 aa  98.6  1e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.165353 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4299  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  38.5 
 
 
311 aa  99  1e-19  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.58232 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1494  alcohol dehydrogenase  29.52 
 
 
321 aa  98.6  1e-19  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.275992  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1547  zinc-binding alcohol dehydrogenase  32.58 
 
 
339 aa  98.2  2e-19  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.135035  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1621  quinone oxidoreductase putative PIG3  30.54 
 
 
336 aa  97.8  2e-19  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.463823  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1490  zinc-binding alcohol dehydrogenase  25.97 
 
 
333 aa  98.2  2e-19  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.020741  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0289  putative NADPH-quinone oxidoreductase, Zn containing  29.41 
 
 
349 aa  98.2  2e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1526  Alcohol dehydrogenase GroES domain-containing protein  30.75 
 
 
313 aa  97.8  2e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.97459 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0078  putative Zinc-binding dehydrogenase  34.93 
 
 
317 aa  97.8  2e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.212844  decreased coverage  0.000689131 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0243  putative quinone oxidoreductase (NADPH) and Zn-dependent alcohol dehydrogenase  30.5 
 
 
324 aa  97.8  2e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0942  zinc-binding alcohol dehydrogenase  29.29 
 
 
324 aa  97.8  2e-19  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0332655  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2092  quinone oxidoreductase putative PIG3  28.57 
 
 
332 aa  97.4  2e-19  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.187867  hitchhiker  0.000106437 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>