46 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sked_13110 on replicon NC_013521
Organism: Sanguibacter keddieii DSM 10542



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013521  Sked_13110  iron-binding zinc finger protein, CDGSH type  100 
 
 		 104 aa  204  2e-52  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0466  Iron sulfur domain-containing, CDGSH-type  63.93 
 
 		 77 aa  83.2  0.000000000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.336392  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3589  zinc finger CDGSH-type domain-containing protein  61.02 
 
 		 84 aa  80.1  0.000000000000009  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.558971  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2069  Iron sulphur domain-containing, CDGSH-type  56.67 
 
 		 146 aa  72  0.000000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3395  Iron sulphur domain-containing, CDGSH-type  57.89 
 
 		 104 aa  67.8  0.00000000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.64895  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_18930  iron-binding zinc finger protein, CDGSH type  49.23 
 
 		 77 aa  56.6  0.0000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.606018  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0871  protein of unknown function DUF1271  47.37 
 
 		 599 aa  52.8  0.000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.207432  normal  0.190699 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4406  hypothetical protein  44.07 
 
 		 74 aa  53.1  0.000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00107323  normal  0.281597 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1683  Iron sulphur domain-containing, CDGSH-type  42.62 
 
 		 76 aa  52.4  0.000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.362742 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2912  hypothetical protein  42.62 
 
 		 75 aa  52.8  0.000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.213928  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1437  protein of unknown function DUF1271  52 
 
 		 147 aa  52  0.000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.781813  normal  0.13067 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2058  zinc finger CDGSH-type domain protein  53.7 
 
 		 246 aa  52  0.000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  unclonable  0.0000000110219  normal  0.493607 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1986  zinc finger CDGSH-type domain protein  42.62 
 
 		 90 aa  52  0.000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5202  Iron sulphur domain-containing, CDGSH-type  42.37 
 
 		 66 aa  51.2  0.000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3258  Zinc finger, CDGSH-type  44.44 
 
 		 86 aa  50.8  0.000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.167004  normal  0.337224 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5171  hypothetical protein  52 
 
 		 594 aa  50.4  0.000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0902166  hitchhiker  0.00324172 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2298  hypothetical protein  43.33 
 
 		 241 aa  50.1  0.00001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.561327 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2809  zinc finger CDGSH-type domain protein  41.67 
 
 		 74 aa  48.5  0.00003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3158  zinc finger CDGSH-type domain protein  41.67 
 
 		 74 aa  48.5  0.00003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000868245 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0516  hypothetical protein  38.98 
 
 		 211 aa  48.9  0.00003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0591  zinc finger CDGSH-type domain protein  55.1 
 
 		 229 aa  48.1  0.00004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3576  hypothetical protein  52.27 
 
 		 256 aa  47.8  0.00005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.327098  normal  0.196355 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0622  Iron sulfur domain-containing, CDGSH-type  41.27 
 
 		 68 aa  47.8  0.00006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.507556 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0145  zinc finger CDGSH-type domain-containing protein  38.98 
 
 		 236 aa  47  0.00009  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2798  zinc finger CDGSH-type domain-containing protein  45 
 
 		 70 aa  46.6  0.0001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.755848 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1178  protein of unknown function DUF1271  52.27 
 
 		 233 aa  46.2  0.0002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.25383  normal  0.606867 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3468  Iron sulfur domain-containing, CDGSH-type  41.18 
 
 		 71 aa  45.8  0.0002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2314  hypothetical protein  50 
 
 		 232 aa  46.2  0.0002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2450  zinc finger CDGSH-type domain protein  46.81 
 
 		 72 aa  45.1  0.0004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000296222  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1475  protein of unknown function DUF1271  47.73 
 
 		 233 aa  44.3  0.0005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.122746  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0865  protein of unknown function DUF1271  31.31 
 
 		 219 aa  44.3  0.0005  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000589964  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1281  protein of unknown function DUF1271  46.81 
 
 		 233 aa  43.1  0.001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.768741  normal  0.722249 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1270  hypothetical protein  44 
 
 		 215 aa  43.1  0.001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.7318  normal  0.397202 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1040  zinc finger CDGSH-type domain-containing protein  37.25 
 
 		 81 aa  43.1  0.001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11410  iron-binding zinc finger protein, CDGSH type  43.14 
 
 		 71 aa  43.1  0.001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2759  zinc finger CDGSH-type domain protein  32.79 
 
 		 65 aa  43.1  0.001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5219  zinc finger CDGSH-type domain-containing protein  37.25 
 
 		 75 aa  42.7  0.002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00747207 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4940  zinc finger CDGSH-type domain-containing protein  37.25 
 
 		 75 aa  42.7  0.002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.514942  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2272  hypothetical protein  35.38 
 
 		 211 aa  42.7  0.002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3359  zinc finger CDGSH-type domain protein  42.22 
 
 		 74 aa  42.4  0.002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.011447 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4296  Iron sulphur domain-containing, CDGSH-type  46.67 
 
 		 68 aa  42  0.003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0157597  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0355  Iron sulphur domain-containing, CDGSH-type  38.89 
 
 		 72 aa  41.6  0.003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6636  zinc finger CDGSH-type domain protein  42.22 
 
 		 59 aa  42  0.003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.101492 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2157  zinc finger CDGSH-type domain-containing protein  70.83 
 
 		 71 aa  41.6  0.004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0783  Iron sulfur domain-containing, CDGSH-type  39.29 
 
 		 76 aa  40.4  0.008  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.396298  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2426  zinc finger CDGSH-type domain protein  35.29 
 
 		 74 aa  40.4  0.008  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0623545  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>