25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sked_07030 on replicon NC_013521
Organism: Sanguibacter keddieii DSM 10542



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013521  Sked_07030  arabinose efflux permease family protein  100 
 
 		 416 aa  795    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1823  major facilitator transporter  29.65 
 
 		 464 aa  116  7.999999999999999e-25  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  decreased coverage  0.000162964  normal  0.991228 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1814  major facilitator transporter  27.64 
 
 		 456 aa  113  5e-24  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.347664  hitchhiker  0.0000156838 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0322  major facilitator superfamily MFS_1  32.43 
 
 		 422 aa  86.7  6e-16  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.503046  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1442  major facilitator superfamily MFS_1  28.12 
 
 		 437 aa  77  0.0000000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0693  major facilitator transporter  26.47 
 
 		 409 aa  65.1  0.000000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1568  major facilitator transporter  26.47 
 
 		 409 aa  65.1  0.000000003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15060  major facilitator superfamily MFS_1  24.48 
 
 		 390 aa  58.5  0.0000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.139374  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0869  major facilitator transporter  26.74 
 
 		 445 aa  55.8  0.000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.422831  normal  0.558623 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2349  major facilitator transporter  27.92 
 
 		 399 aa  54.3  0.000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2156  major facilitator transporter  21.35 
 
 		 409 aa  51.6  0.00003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0631  major facilitator superfamily MFS_1  30.88 
 
 		 402 aa  49.7  0.0001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0094  major facilitator transporter  21.52 
 
 		 406 aa  48.9  0.0001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.0031083  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0062  hypothetical protein  22.34 
 
 		 440 aa  49.7  0.0001  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3300  major facilitator superfamily MFS_1  29.47 
 
 		 451 aa  48.9  0.0002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.924206  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2112  major facilitator superfamily permease  29.34 
 
 		 405 aa  47  0.0006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.954954  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2006  major facilitator transporter  24.94 
 
 		 419 aa  47  0.0007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0185  hypothetical protein  26.07 
 
 		 406 aa  45.8  0.001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0894  major facilitator superfamily MFS_1  27.08 
 
 		 403 aa  45.4  0.002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0910  major facilitator superfamily MFS_1  20.85 
 
 		 390 aa  45.1  0.003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.447265  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1915  major facilitator superfamily permease  24.19 
 
 		 389 aa  45.1  0.003  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.488655  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0744  major facilitator transporter  30.67 
 
 		 408 aa  45.1  0.003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.871557 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0249  major facilitator transporter  26.01 
 
 		 399 aa  44.7  0.003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.621086  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0263  major facilitator superfamily MFS_1  35.24 
 
 		 367 aa  43.9  0.005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.680002  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3821  major facilitator superfamily transporter  31.33 
 
 		 400 aa  43.1  0.01  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.181358  normal  0.71225 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>