18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sked_05970 on replicon NC_013521
Organism: Sanguibacter keddieii DSM 10542



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013521  Sked_05970  hypothetical protein  100 
 
 		 416 aa  814    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.215933 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0645  hypothetical protein  25.56 
 
 		 396 aa  78.6  0.0000000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0031  ATPase  26.46 
 
 		 396 aa  77.8  0.0000000000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.42307  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0571  ATPase  26.38 
 
 		 461 aa  73.9  0.000000000005  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.195341  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0718  hypothetical protein  26.67 
 
 		 397 aa  70.9  0.00000000004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000890529 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0111  hypothetical protein  26 
 
 		 395 aa  66.2  0.000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  unclonable  0.0000000108585  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0190  ATPase  26.58 
 
 		 393 aa  58.9  0.0000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_01160  hypothetical protein  26.46 
 
 		 427 aa  58.2  0.0000003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4994  hypothetical protein  26.39 
 
 		 407 aa  53.9  0.000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2291  hypothetical protein  28.57 
 
 		 449 aa  53.1  0.00001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014159  Tpau_4293  hypothetical protein  27.29 
 
 		 457 aa  53.1  0.00001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0159  hypothetical protein  25.33 
 
 		 400 aa  50.8  0.00004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0115  ATPase  25.34 
 
 		 391 aa  49.3  0.0001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0503  hypothetical protein  23.79 
 
 		 362 aa  47.4  0.0004  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0143  ATPase  25.19 
 
 		 397 aa  47.4  0.0005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1415  hypothetical protein  21.76 
 
 		 195 aa  46.6  0.0007  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1552  hypothetical protein  27.97 
 
 		 199 aa  46.2  0.001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.465651  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1456  hypothetical protein  25.83 
 
 		 368 aa  45.4  0.002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>