More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sked_05880 on replicon NC_013521
Organism: Sanguibacter keddieii DSM 10542



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013521  Sked_05880  CBS domain-containing protein  100 
 
 
478 aa  941    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.927545 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2949  protein of unknown function DUF21  69.93 
 
 
469 aa  571  1e-161  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0445  protein of unknown function DUF21  67.63 
 
 
451 aa  550  1e-155  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0534885  normal  0.0812429 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2793  protein of unknown function DUF21  67.95 
 
 
464 aa  539  9.999999999999999e-153  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0318  protein of unknown function DUF21  57.49 
 
 
496 aa  524  1e-147  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  unclonable  0.00000000206585  hitchhiker  0.00828276 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3490  hypothetical protein  61.63 
 
 
458 aa  514  1e-144  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3477  hypothetical protein  61.63 
 
 
458 aa  514  1e-144  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3540  hypothetical protein  61.63 
 
 
458 aa  514  1e-144  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.228644  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3115  hypothetical protein  61.95 
 
 
456 aa  510  1e-143  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3860  hypothetical protein  60.18 
 
 
453 aa  499  1e-140  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.188072  normal  0.0935065 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2683  CBS domain-containing protein  63.27 
 
 
455 aa  497  1e-139  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.522065  normal  0.368276 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0412  protein of unknown function DUF21  64.08 
 
 
459 aa  494  9.999999999999999e-139  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.29322  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1685  CBS  58.24 
 
 
462 aa  468  1.0000000000000001e-131  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1941  protein of unknown function DUF21  58.69 
 
 
460 aa  465  1e-129  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.164047  normal  0.0989418 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0015  protein of unknown function DUF21  60.76 
 
 
450 aa  451  1e-125  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.309554  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3861  protein of unknown function DUF21  64.06 
 
 
460 aa  444  1e-123  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00340007  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1368  hypothetical protein  50.34 
 
 
452 aa  381  1e-104  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000999119 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1409  hypothetical protein  50.44 
 
 
452 aa  378  1e-103  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.464754 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0047  hypothetical protein  46.95 
 
 
520 aa  363  4e-99  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0119  protein of unknown function DUF21  49.77 
 
 
486 aa  334  2e-90  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.458192  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4665  protein of unknown function DUF21  45.05 
 
 
441 aa  322  9.999999999999999e-87  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6909  hypothetical protein  44.42 
 
 
451 aa  314  1.9999999999999998e-84  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.97846  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24020  CBS domain-containing protein  43.56 
 
 
451 aa  311  2e-83  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.94366 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5779  protein of unknown function DUF21  45.24 
 
 
468 aa  298  1e-79  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5344  protein of unknown function DUF21  40.49 
 
 
444 aa  262  1e-68  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.308769  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2814  hypothetical protein  39.05 
 
 
471 aa  256  5e-67  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2841  hypothetical protein  39.05 
 
 
470 aa  256  5e-67  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.245306  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2858  hypothetical protein  39.05 
 
 
471 aa  256  5e-67  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.860129  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22510  CBS domain-containing protein  37.1 
 
 
438 aa  254  3e-66  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0516538  normal  0.801852 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6404  hypothetical protein  38.43 
 
 
452 aa  252  1e-65  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2999  hypothetical protein  38.93 
 
 
503 aa  251  3e-65  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.280207  normal  0.727721 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1722  protein of unknown function DUF21  38.94 
 
 
460 aa  250  4e-65  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.564871  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2764  protein of unknown function DUF21  38.26 
 
 
461 aa  249  7e-65  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.357691  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3094  hypothetical protein  37.69 
 
 
451 aa  244  3e-63  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.292492  normal  0.43311 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2317  protein of unknown function DUF21  38.29 
 
 
450 aa  243  3.9999999999999997e-63  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3364  hypothetical protein  36.41 
 
 
457 aa  238  1e-61  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11870  hypothetical protein  38.59 
 
 
455 aa  238  2e-61  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0136182  normal  0.440152 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31520  CBS domain-containing protein  36.95 
 
 
455 aa  236  5.0000000000000005e-61  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2962  protein of unknown function DUF21  38.59 
 
 
486 aa  234  2.0000000000000002e-60  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.387429  hitchhiker  0.00195258 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0914  hypothetical protein  38.52 
 
 
474 aa  229  8e-59  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.447806  normal  0.0678288 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2720  hypothetical protein  39.85 
 
 
451 aa  229  1e-58  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1954  hypothetical protein  35.44 
 
 
574 aa  224  2e-57  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0113455  normal  0.562335 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5679  protein of unknown function DUF21  38.18 
 
 
450 aa  221  1.9999999999999999e-56  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.372603  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2371  protein of unknown function DUF21  36.02 
 
 
490 aa  221  1.9999999999999999e-56  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.304604 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0508  protein of unknown function DUF21  38.78 
 
 
451 aa  218  2e-55  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3544  protein of unknown function DUF21  32.85 
 
 
446 aa  206  5e-52  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3277  protein of unknown function DUF21  32.43 
 
 
437 aa  204  3e-51  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000233033  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09590  CBS domain-containing protein  34.88 
 
 
443 aa  202  9.999999999999999e-51  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.328849 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1222  protein of unknown function DUF21  38.18 
 
 
439 aa  202  1.9999999999999998e-50  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.250523  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1285  hypothetical protein  30.47 
 
 
446 aa  199  1.0000000000000001e-49  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0324547  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0063  protein of unknown function DUF21  36.39 
 
 
452 aa  196  6e-49  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4622  protein of unknown function DUF21  33.92 
 
 
430 aa  196  9e-49  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_07750  CBS domain-containing protein  37.31 
 
 
438 aa  193  6e-48  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3662  hypothetical protein  36.05 
 
 
453 aa  192  1e-47  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1126  protein of unknown function DUF21  30.08 
 
 
428 aa  192  1e-47  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.93664  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1588  protein of unknown function DUF21  32.83 
 
 
443 aa  191  2e-47  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1763  hypothetical protein  31.14 
 
 
446 aa  191  2e-47  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2484  protein of unknown function DUF21  34.65 
 
 
442 aa  189  7e-47  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3259  CBS domain protein  29.74 
 
 
435 aa  189  8e-47  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.698294 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2378  protein of unknown function DUF21  35.37 
 
 
443 aa  189  1e-46  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000393714 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2092  CBS domain protein  28.97 
 
 
435 aa  185  1.0000000000000001e-45  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1875  hemolysin-like protein  28.97 
 
 
435 aa  185  1.0000000000000001e-45  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0753435  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1866  hemolysin-like protein  28.97 
 
 
435 aa  185  1.0000000000000001e-45  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.621127  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2160  CBS domain protein  28.97 
 
 
435 aa  185  1.0000000000000001e-45  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00238227  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2296  protein of unknown function DUF21  32.23 
 
 
433 aa  185  2.0000000000000003e-45  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.23749  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2050  CBS domain protein  29.23 
 
 
435 aa  184  3e-45  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.202921  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4066  protein of unknown function DUF21  30.37 
 
 
438 aa  184  3e-45  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.659836  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1913  CBS domain-containing protein  28.72 
 
 
435 aa  184  4.0000000000000006e-45  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.378516  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2059  CBS domain-containing protein  28.72 
 
 
435 aa  184  4.0000000000000006e-45  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0676  CBS domain-containing protein  30.03 
 
 
432 aa  183  6e-45  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0735  CBS domain protein  30.03 
 
 
432 aa  182  1e-44  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1910  hypothetical protein  29.44 
 
 
435 aa  181  2e-44  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1383  transport protein  30.37 
 
 
434 aa  180  4e-44  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.283032  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0664  CBS domain protein  29.52 
 
 
432 aa  181  4e-44  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.7650000000000002e-36 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2128  CBS domain-containing protein  29.44 
 
 
435 aa  180  4.999999999999999e-44  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.695041  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2179  protein of unknown function DUF21  31.28 
 
 
431 aa  180  4.999999999999999e-44  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0760  protein of unknown function DUF21  31.93 
 
 
437 aa  179  1e-43  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.332278 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0519  hypothetical protein  29.52 
 
 
432 aa  179  1e-43  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0519  hypothetical protein  29.52 
 
 
432 aa  179  1e-43  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1234  protein of unknown function DUF21  35.16 
 
 
453 aa  179  1e-43  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.981961  normal  0.106715 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0921  protein of unknown function DUF21  32.49 
 
 
443 aa  178  2e-43  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1889  protein of unknown function DUF21  32.99 
 
 
464 aa  177  3e-43  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.483019  normal  0.437772 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0521  protein of unknown function DUF21  29.83 
 
 
448 aa  177  3e-43  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2102  protein of unknown function DUF21  30.64 
 
 
468 aa  177  4e-43  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.573488  normal  0.797611 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0646  magnesium and cobalt efflux protein CorC  29.01 
 
 
432 aa  177  4e-43  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0238417  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0522  hypothetical protein  29.52 
 
 
432 aa  177  4e-43  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3095  hypothetical protein  28.57 
 
 
440 aa  177  5e-43  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0877278  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0455  conserved hypothetical protein, putative efflux protein (DUF21 domain protein)  29.31 
 
 
456 aa  176  6e-43  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.844865  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2206  hypothetical protein  29.06 
 
 
437 aa  175  1.9999999999999998e-42  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.287876  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1072  hypothetical protein  33.16 
 
 
442 aa  175  1.9999999999999998e-42  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.638225  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4692  magnesium and cobalt efflux protein CorC  29.12 
 
 
425 aa  174  2.9999999999999996e-42  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.200662  hitchhiker  0.0000000000000291685 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0525  hypothetical protein  29.85 
 
 
441 aa  174  3.9999999999999995e-42  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.806161  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0926  protein of unknown function DUF21  32.84 
 
 
441 aa  172  9e-42  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.731568 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0575  CBS domain-containing protein  30.52 
 
 
361 aa  172  1e-41  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0608  CBS domain-containing protein  30.52 
 
 
361 aa  172  1e-41  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3172  CBS domain-containing protein  27.82 
 
 
442 aa  172  2e-41  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.903732  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3066  hypothetical protein  28.07 
 
 
442 aa  171  2e-41  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.928407  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0644  magnesium and cobalt efflux protein CorC  28.26 
 
 
442 aa  171  2e-41  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3396  CBS domain protein  28.07 
 
 
442 aa  171  2e-41  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3391  CBS domain protein  27.82 
 
 
442 aa  172  2e-41  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>