290 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shewmr7_2629 on replicon NC_008322
Organism: Shewanella sp. MR-7



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008322  Shewmr7_2629  hypothetical protein  100 
 
 		 295 aa  576  1.0000000000000001e-163  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2562  hypothetical protein  98.64 
 
 		 302 aa  570  1.0000000000000001e-162  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2736  hypothetical protein  97.29 
 
 		 295 aa  551  1e-156  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2820  protein of unknown function DUF6 transmembrane  83.05 
 
 		 295 aa  481  1e-135  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.139235  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1531  hypothetical protein  83.05 
 
 		 295 aa  481  1e-135  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00178723  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1564  hypothetical protein  82.71 
 
 		 295 aa  479  1e-134  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.709521 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1406  hypothetical protein  71.43 
 
 		 312 aa  408  1e-113  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0365604  normal  0.0466705 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1696  hypothetical protein  71.38 
 
 		 298 aa  406  1.0000000000000001e-112  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.591039 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1682  hypothetical protein  65.54 
 
 		 299 aa  389  1e-107  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0349  protein of unknown function DUF6 transmembrane  50.9 
 
 		 294 aa  267  2e-70  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.19753  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3750  hypothetical protein  51.59 
 
 		 307 aa  253  4.0000000000000004e-66  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0979614  normal  0.188727 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3221  hypothetical protein  50.89 
 
 		 307 aa  251  8.000000000000001e-66  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.575238  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2881  hypothetical protein  46.42 
 
 		 336 aa  244  9.999999999999999e-64  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0923868  hitchhiker  0.00000000000229015 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4892  hypothetical protein  50.92 
 
 		 307 aa  244  9.999999999999999e-64  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.131621  hitchhiker  0.000211269 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3674  hypothetical protein  52.31 
 
 		 307 aa  241  7e-63  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.393093 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4511  hypothetical protein  52.31 
 
 		 309 aa  241  7.999999999999999e-63  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.2378  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3853  hypothetical protein  52.31 
 
 		 309 aa  241  7.999999999999999e-63  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0266  hypothetical protein  45.8 
 
 		 310 aa  240  2e-62  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000402657 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1290  hypothetical protein  48.76 
 
 		 323 aa  239  5.999999999999999e-62  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17660  hypothetical protein  48.79 
 
 		 308 aa  237  2e-61  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1536  hypothetical protein  49.82 
 
 		 297 aa  236  5.0000000000000005e-61  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2243  hypothetical protein  50.92 
 
 		 307 aa  235  6e-61  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0582742 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0586  hypothetical protein  50.55 
 
 		 307 aa  234  2.0000000000000002e-60  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0483784  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3690  protein of unknown function DUF6 transmembrane  46.07 
 
 		 296 aa  233  2.0000000000000002e-60  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.0058387  hitchhiker  0.0000000000902258 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1322  hypothetical protein  45.23 
 
 		 293 aa  233  4.0000000000000004e-60  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.908663 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1470  hypothetical protein  50.55 
 
 		 323 aa  233  4.0000000000000004e-60  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.635983  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0290  hypothetical protein  50.55 
 
 		 306 aa  232  5e-60  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0875  hypothetical protein  50.55 
 
 		 306 aa  232  5e-60  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1667  hypothetical protein  50.55 
 
 		 306 aa  232  5e-60  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2573  multidrug ABC transporter permease  50.55 
 
 		 306 aa  232  5e-60  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2437  hypothetical protein  50.55 
 
 		 306 aa  232  5e-60  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.11208  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0322  hypothetical protein  50.55 
 
 		 306 aa  232  5e-60  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.698998  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2332  protein of unknown function DUF6 transmembrane  47.69 
 
 		 291 aa  221  9.999999999999999e-57  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.364061  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2556  protein of unknown function DUF6 transmembrane  44.1 
 
 		 302 aa  184  2.0000000000000003e-45  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0782604  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1457  hypothetical protein  36.81 
 
 		 303 aa  176  4e-43  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.550804  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1507  hypothetical protein  36.11 
 
 		 303 aa  172  3.9999999999999995e-42  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1320  hypothetical protein  38.14 
 
 		 301 aa  167  2.9999999999999998e-40  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00383072  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1658  transporter, EamA family  37.41 
 
 		 303 aa  165  1.0000000000000001e-39  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1763  transporter, EamA family  37.41 
 
 		 303 aa  164  2.0000000000000002e-39  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1506  EamA family protein  37.41 
 
 		 303 aa  163  3e-39  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.116622  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1468  drug/metabolite exporter family protein  37.41 
 
 		 303 aa  163  3e-39  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.855355  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1622  eama family protein  37.41 
 
 		 303 aa  163  3e-39  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2742  protein of unknown function DUF6 transmembrane  39.11 
 
 		 296 aa  163  3e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.651085  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3002  protein of unknown function DUF6 transmembrane  42.61 
 
 		 287 aa  163  4.0000000000000004e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0425845  normal  0.73102 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1690  transporter, EamA family  37.41 
 
 		 303 aa  162  5.0000000000000005e-39  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2141  hypothetical protein  41.26 
 
 		 320 aa  162  5.0000000000000005e-39  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.648455  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1713  EamA family protein  36.84 
 
 		 303 aa  161  1e-38  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.461189  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1478  drug/metabolite exporter family protein  37.06 
 
 		 303 aa  161  1e-38  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.187087  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0401  protein of unknown function DUF6 transmembrane  36.73 
 
 		 300 aa  159  4e-38  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.217733  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1510  hypothetical protein  36.14 
 
 		 301 aa  159  4e-38  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3687  transporter, EamA family  35.79 
 
 		 301 aa  156  3e-37  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1658  hypothetical protein  36.33 
 
 		 300 aa  155  9e-37  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2237  hypothetical protein  39.04 
 
 		 300 aa  151  1e-35  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.274588  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0094  membrane protein  34.12 
 
 		 322 aa  148  1.0000000000000001e-34  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0274  threonine/homoserine efflux transporter  40 
 
 		 267 aa  142  8e-33  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  hitchhiker  0.00467202  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1260  protein of unknown function DUF6 transmembrane  33.22 
 
 		 312 aa  140  1.9999999999999998e-32  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000194009  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4151  hypothetical protein  33.22 
 
 		 299 aa  138  1e-31  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0720  protein of unknown function DUF6 transmembrane  34.01 
 
 		 289 aa  136  5e-31  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.000349572  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1134  hypothetical protein  34.41 
 
 		 319 aa  135  6.0000000000000005e-31  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.159672  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05950  permease of the drug/metabolite transporter (DMT) superfamily  36.14 
 
 		 293 aa  134  3e-30  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0417  protein of unknown function DUF6 transmembrane  31.67 
 
 		 292 aa  130  2.0000000000000002e-29  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3154  permease  39.15 
 
 		 296 aa  129  4.0000000000000003e-29  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0835  hypothetical protein  27.55 
 
 		 295 aa  128  1.0000000000000001e-28  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0960  drug/metabolite transporter family permease  39.22 
 
 		 296 aa  126  5e-28  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000594198  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1712  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.07 
 
 		 290 aa  125  1e-27  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0726  hypothetical protein  34.01 
 
 		 298 aa  124  1e-27  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00203734  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2142  protein of unknown function DUF6 transmembrane  32.78 
 
 		 308 aa  120  1.9999999999999998e-26  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0350  protein of unknown function DUF6 transmembrane  31.21 
 
 		 290 aa  120  3e-26  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2894  hypothetical protein  34.93 
 
 		 288 aa  119  7e-26  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.240372 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2288  protein of unknown function DUF6 transmembrane  34.84 
 
 		 302 aa  119  7.999999999999999e-26  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000440436 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0201  protein of unknown function DUF6 transmembrane  32.38 
 
 		 283 aa  118  9e-26  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.0000909393  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1939  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30 
 
 		 343 aa  118  9.999999999999999e-26  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0893718  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3023  protein of unknown function DUF6 transmembrane  33.45 
 
 		 312 aa  117  1.9999999999999998e-25  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.66818  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0986  transporter, Drug/Metabolite Exporter family  28.23 
 
 		 295 aa  115  6e-25  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0024  protein of unknown function DUF6 transmembrane  32.03 
 
 		 297 aa  115  7.999999999999999e-25  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1031  hypothetical protein  28.57 
 
 		 307 aa  114  2.0000000000000002e-24  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2039  protein of unknown function DUF6 transmembrane  31.65 
 
 		 301 aa  114  3e-24  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000102698  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1125  hypothetical protein  31.75 
 
 		 294 aa  111  2.0000000000000002e-23  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1112  hypothetical protein  31.76 
 
 		 288 aa  110  3e-23  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3544  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.63 
 
 		 293 aa  107  2e-22  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.340303  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1018  hypothetical protein  31.38 
 
 		 288 aa  107  2e-22  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.735408  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2297  hypothetical protein  34.72 
 
 		 286 aa  106  6e-22  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2471  hypothetical protein  32.44 
 
 		 360 aa  105  7e-22  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0181629  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3212  transporter, Drug/Metabolite Exporter family  28.42 
 
 		 289 aa  105  9e-22  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3301  hypothetical protein  28.07 
 
 		 296 aa  104  2e-21  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  decreased coverage  0.00885964  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2929  DMT family permease  27.33 
 
 		 298 aa  103  3e-21  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0171282  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0128  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.72 
 
 		 301 aa  102  8e-21  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1929  protein of unknown function DUF6 transmembrane  36.65 
 
 		 252 aa  102  9e-21  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00124524  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3407  hypothetical protein  32.61 
 
 		 292 aa  101  2e-20  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.263015  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1123  hypothetical protein  29.93 
 
 		 277 aa  99.8  5e-20  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1311  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.41 
 
 		 302 aa  99  8e-20  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.0220544 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05469  hypothetical protein  28.32 
 
 		 292 aa  99  8e-20  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5197  hypothetical protein  33.45 
 
 		 288 aa  97.1  3e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5662  hypothetical protein  33.45 
 
 		 288 aa  97.1  3e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.318352 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1308  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.49 
 
 		 308 aa  96.7  4e-19  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.461902  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1817  hypothetical protein  31.97 
 
 		 305 aa  94.4  2e-18  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0149863  hitchhiker  0.000661803 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0313  hypothetical protein  31.79 
 
 		 317 aa  94.7  2e-18  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00423345 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4403  hypothetical protein  29.3 
 
 		 305 aa  94.4  2e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0375849  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1619  integral membrane protein  25.48 
 
 		 290 aa  94  3e-18  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.971889  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0545  hypothetical protein  30.07 
 
 		 308 aa  93.6  4e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>