52 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shewmr7_2575 on replicon NC_008322
Organism: Shewanella sp. MR-7



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009092  Shew_2520  outer membrane protein, putative  51.47 
 
 		 703 aa  738    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.383126  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1615  outer membrane protein, putative  79.61 
 
 		 716 aa  1216    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.208848  normal  0.197166 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2693  outer membrane protein, putative  56.73 
 
 		 706 aa  806    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1529  outer membrane protein, putative  56 
 
 		 711 aa  822    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1581  outer membrane protein, putative  79.89 
 
 		 716 aa  1219    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0408477  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1592  outer membrane protein, putative  80.17 
 
 		 716 aa  1222    Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000338536  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2762  outer membrane protein, putative  80.03 
 
 		 716 aa  1219    Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00885909  hitchhiker  0.000163865 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2673  outer membrane protein, putative  98.03 
 
 		 712 aa  1443    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.335311  normal  0.0727867 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2575  outer membrane protein, putative  100 
 
 		 712 aa  1467    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.382223  normal  0.0100753 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1781  outer membrane protein, putative  87.08 
 
 		 712 aa  1310    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2507  outer membrane protein, putative  98.74 
 
 		 712 aa  1454    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0767045  decreased coverage  0.000584641 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1212  outer membrane protein, putative  42.76 
 
 		 698 aa  585  1e-166  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2700  outer membrane protein precursor MtrB  38.87 
 
 		 699 aa  467  9.999999999999999e-131  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.140373  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2527  outer membrane protein precursor MtrB  37.48 
 
 		 699 aa  452  1.0000000000000001e-126  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1610  outer membrane protein precursor MtrB  36.63 
 
 		 695 aa  450  1e-125  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.170793 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1523  outer membrane protein precursor MtrB  37.43 
 
 		 703 aa  452  1e-125  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.415633  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1576  outer membrane protein precursor MtrB  36.63 
 
 		 695 aa  450  1e-125  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0247408  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2767  outer membrane protein precursor MtrB  36.63 
 
 		 695 aa  449  1e-125  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.38459  decreased coverage  0.0000000195366 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1587  outer membrane protein precursor MtrB  36.35 
 
 		 695 aa  447  1.0000000000000001e-124  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.14869  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3127  outer membrane protein precursor MtrB  37.48 
 
 		 698 aa  441  9.999999999999999e-123  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000335103 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2580  outer membrane protein precursor MtrB  37.36 
 
 		 695 aa  436  1e-121  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0892811  normal  0.0284758 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2512  outer membrane protein precursor MtrB  37.5 
 
 		 695 aa  439  1e-121  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.481344  hitchhiker  0.00380912 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2678  outer membrane protein precursor MtrB  37.36 
 
 		 695 aa  436  1e-121  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0120666 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1776  outer membrane protein precursor MtrB  35.98 
 
 		 697 aa  435  1e-120  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2639  outer membrane protein precursor MtrB  35.98 
 
 		 695 aa  428  1e-118  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.381518  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1206  outer membrane protein precursor MtrB  34.85 
 
 		 693 aa  407  1.0000000000000001e-112  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.00712734  normal  0.823248 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1476  outer membrane protein precursor MtrB  35.25 
 
 		 704 aa  392  1e-107  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0583388  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3129  outer membrane protein  33.38 
 
 		 668 aa  357  3.9999999999999996e-97  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0351  outer membrane protein  33.1 
 
 		 668 aa  346  1e-93  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.132929 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1428  outer membrane protein  30.1 
 
 		 662 aa  325  2e-87  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0228  outer membrane protein  29.94 
 
 		 669 aa  318  2e-85  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0626  outer membrane protein  29.81 
 
 		 662 aa  317  4e-85  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1403  outer membrane protein  29.66 
 
 		 668 aa  317  4e-85  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2924  outer membrane protein  30.54 
 
 		 672 aa  313  7.999999999999999e-84  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0267  outer membrane protein  29.5 
 
 		 667 aa  310  5e-83  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3676  outer membrane protein  29.5 
 
 		 667 aa  310  5.9999999999999995e-83  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3685  outer membrane protein  30.23 
 
 		 669 aa  309  1.0000000000000001e-82  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2229  outer membrane protein  29.5 
 
 		 667 aa  306  8.000000000000001e-82  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.00516967  hitchhiker  0.0011455 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0232  outer membrane protein  29.34 
 
 		 668 aa  306  1.0000000000000001e-81  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2819  outer membrane protein  29.44 
 
 		 674 aa  285  1.0000000000000001e-75  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.216315  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1306  outer membrane protein  28.17 
 
 		 672 aa  239  2e-61  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000179151 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2150  outer membrane protein  27.44 
 
 		 669 aa  212  2e-53  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0260254  normal  0.662224 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4359  outer membrane protein, putative  23.86 
 
 		 656 aa  139  1e-31  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003778  outer membrane protein  23.27 
 
 		 660 aa  136  9.999999999999999e-31  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2380  hypothetical protein  22.32 
 
 		 681 aa  125  4e-27  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.573716  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0360  hypothetical protein  23.22 
 
 		 565 aa  116  1.0000000000000001e-24  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0310928  hitchhiker  0.00101277 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3860  hypothetical protein  23.7 
 
 		 573 aa  110  1e-22  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00093801  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4081  hypothetical protein  22.82 
 
 		 706 aa  103  1e-20  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0596135  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2959  putative outer membrane protein precursor  21.49 
 
 		 830 aa  64.7  0.000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0398  hypothetical protein  20.21 
 
 		 807 aa  61.2  0.00000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.513046 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3627  hypothetical protein  21.17 
 
 		 835 aa  52.8  0.00002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0816  hypothetical protein  25.11 
 
 		 810 aa  48.5  0.0004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>