26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shewmr7_1889 on replicon NC_008322
Organism: Shewanella sp. MR-7



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008322  Shewmr7_1889  hypothetical protein  100 
 
 		 139 aa  291  2e-78  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.344159 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2211  NERD domain-containing protein  89.21 
 
 		 353 aa  267  5e-71  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1130  NERD domain-containing protein  56 
 
 		 199 aa  91.3  4e-18  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.509839 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2522  DNA-binding NERD domain-containing protein  41.74 
 
 		 269 aa  89  2e-17  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2988  NERD domain-containing protein  40 
 
 		 262 aa  88.2  3e-17  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0707223  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0313  DNA topoisomerase I  39.68 
 
 		 260 aa  87.8  4e-17  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2012  NERD domain protein  49.35 
 
 		 230 aa  84.7  3e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4033  NERD domain-containing protein  44.94 
 
 		 256 aa  84.7  3e-16  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008765  Ajs_4233  NERD domain-containing protein  39.78 
 
 		 207 aa  80.1  0.000000000000009  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3613  NERD domain protein  41.57 
 
 		 228 aa  78.6  0.00000000000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.646238  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1610  hypothetical protein  44.44 
 
 		 387 aa  78.2  0.00000000000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00290154  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2416  DNA-binding protein  35.65 
 
 		 267 aa  78.2  0.00000000000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  hitchhiker  0.00817944  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0649  DNA topoisomerase I  31.58 
 
 		 267 aa  77.4  0.00000000000006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1847  DNA topoisomerase I  36.61 
 
 		 338 aa  74.7  0.0000000000004  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.791369 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1615  hypothetical protein  41.49 
 
 		 329 aa  73.2  0.000000000001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.269609  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1708  hypothetical protein  43.82 
 
 		 259 aa  72.8  0.000000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.352686  normal  0.0530118 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0751  NERD domain protein  43.21 
 
 		 355 aa  69.7  0.00000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.234498  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1607  NERD domain protein  37.21 
 
 		 211 aa  67.8  0.00000000005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007322  GBAA_pXO1_0003  hypothetical protein  63.41 
 
 		 212 aa  66.2  0.0000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0131  hypothetical protein  43.28 
 
 		 212 aa  62.4  0.000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0005  hypothetical protein  43.28 
 
 		 212 aa  62.4  0.000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3691  NERD domain-containing protein  37.08 
 
 		 259 aa  62  0.000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  hitchhiker  0.003996  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0004  hypothetical protein  54.55 
 
 		 212 aa  61.2  0.000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1309  NERD domain protein  30.07 
 
 		 262 aa  59.7  0.00000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1118  NERD domain protein  33.8 
 
 		 255 aa  45.4  0.0002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.2197  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1109  hypothetical protein  27.78 
 
 		 225 aa  40.4  0.009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>