42 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shewmr7_0570 on replicon NC_008322
Organism: Shewanella sp. MR-7



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008577  Shewana3_3553  putative nonspecific acid phosphatase precursor  96.02 
 
 		 327 aa  638    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0570  putative nonspecific acid phosphatase precursor  100 
 
 		 327 aa  679    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3383  putative nonspecific acid phosphatase precursor  98.17 
 
 		 327 aa  669    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.937467 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5769  NapD-like protein  59.24 
 
 		 337 aa  379  1e-104  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3052  nonspecific acid phosphatase  55.66 
 
 		 336 aa  374  1e-102  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1238  NapD-like protein  58.6 
 
 		 337 aa  370  1e-101  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.596763  normal  0.131697 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003596  putative nonspecific acid phosphatase precursor  53.44 
 
 		 333 aa  366  1e-100  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6905  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  58.88 
 
 		 336 aa  365  1e-100  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.380175 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2981  NapD-like protein  56.07 
 
 		 340 aa  362  4e-99  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0598995  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3412  NapD-like protein  53.05 
 
 		 336 aa  358  5e-98  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.536677 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2938  NapD-like protein  55.35 
 
 		 360 aa  358  9e-98  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0900  NapD-like protein  54.66 
 
 		 341 aa  356  3.9999999999999996e-97  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3792  nonspecific acid phosphatase precursor  54.87 
 
 		 334 aa  352  5e-96  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8071  NapD-like protein  53.61 
 
 		 346 aa  352  5.9999999999999994e-96  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1196  NapD-like protein  55.16 
 
 		 346 aa  349  3e-95  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4528  nonspecific acid phosphatase precursor napD-like protein  54.85 
 
 		 358 aa  344  1e-93  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0141528  normal  0.0226415 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1241  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  50.31 
 
 		 333 aa  333  3e-90  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5134  nonspecific acid phosphatase precursor  54.72 
 
 		 337 aa  333  3e-90  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.261937  normal  0.117341 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3120  NapD-like protein  52.46 
 
 		 354 aa  332  4e-90  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2894  putative nonspecific acid phosphatase precursor  52.17 
 
 		 364 aa  328  5.0000000000000004e-89  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.851127  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2133  putative nonspecific acid phosphatase, NapD-like  51.66 
 
 		 352 aa  326  3e-88  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00991818 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3112  nonspecific acid phosphatase  49.84 
 
 		 318 aa  320  3e-86  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.880914  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3847  nonspecific acid phosphatase precursor  44.38 
 
 		 355 aa  304  1.0000000000000001e-81  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5556  putative nonspecific acid phosphatase, NapD-like protein  47.99 
 
 		 354 aa  304  2.0000000000000002e-81  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.61312  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0090  nonspecific acid phosphatase precursor  48.15 
 
 		 358 aa  302  5.000000000000001e-81  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.800809 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6682  putative nonspecific acid phosphatase, NapD-like protein  47.16 
 
 		 365 aa  301  8.000000000000001e-81  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2251  nonspecific acid phosphatase precursor  45.34 
 
 		 339 aa  298  8e-80  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1878  hypothetical protein  47.35 
 
 		 325 aa  281  1e-74  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.324693  normal  0.526559 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1203  hypothetical protein  40.3 
 
 		 340 aa  239  5.999999999999999e-62  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.376258 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3086  nonspecific acid phosphatase precursor  42.44 
 
 		 305 aa  235  7e-61  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.376229  normal  0.0718813 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1143  hypothetical protein  38.61 
 
 		 338 aa  214  1.9999999999999998e-54  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4114  putative nonspecific acid phosphatase precursor  36.89 
 
 		 302 aa  199  3.9999999999999996e-50  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0702959  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4189  putative nonspecific acid phosphatase precursor  36.89 
 
 		 302 aa  199  3.9999999999999996e-50  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4638  putative nonspecific acid phosphatase precursor  37.86 
 
 		 297 aa  199  5e-50  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  decreased coverage  0.00694651  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4345  putative nonspecific acid phosphatase precursor  36.57 
 
 		 302 aa  197  2.0000000000000003e-49  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.966913  normal  0.149502 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2824  NapD-like protein  35.2 
 
 		 376 aa  194  3e-48  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.201083  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0764  hydrolase  37.82 
 
 		 307 aa  191  1e-47  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.168912  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3491  NapD-like protein  33.02 
 
 		 320 aa  191  1e-47  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1367  acid phosphatase  33.94 
 
 		 325 aa  188  9e-47  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000940717  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1525  putative nonspecific acid phosphatase  34.06 
 
 		 322 aa  185  8e-46  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0728936  normal  0.904277 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0425  hypothetical protein  30.84 
 
 		 336 aa  142  9.999999999999999e-33  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.17147  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2649  haloacid dehalogenase-like hydrolase  27.78 
 
 		 238 aa  53.1  0.000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>