65 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shewmr4_1453 on replicon NC_008321
Organism: Shewanella sp. MR-4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008321  Shewmr4_1453  siderophore biosynthesis protein, putative  100 
 
 		 227 aa  473  1e-132  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1519  siderophore biosynthesis protein, putative  92.07 
 
 		 224 aa  408  1e-113  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.554005 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1509  siderophore biosynthesis protein, putative  88.11 
 
 		 221 aa  389  1e-107  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3031  siderophore biosynthesis protein, putative  74.15 
 
 		 206 aa  321  6e-87  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2810  hypothetical protein  60.68 
 
 		 221 aa  267  1e-70  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.218147 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2731  hypothetical protein  61.06 
 
 		 216 aa  264  8.999999999999999e-70  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0416274  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1655  siderophore biosynthesis protein, putative  58.37 
 
 		 221 aa  264  1e-69  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000687205 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2709  hypothetical protein  60.48 
 
 		 236 aa  262  3e-69  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2412  siderophore biosynthesis protein, putative  55.88 
 
 		 229 aa  254  6e-67  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0136  siderophore biosynthesis protein  42.13 
 
 		 819 aa  160  2e-38  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1072  Siderophore biosynthesis protein, conserved region  36.75 
 
 		 209 aa  129  4.0000000000000003e-29  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0309618  normal  0.770006 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3461  IucA/IucC  35.96 
 
 		 189 aa  122  7e-27  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2446  hypothetical protein  36.47 
 
 		 192 aa  121  8e-27  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1053  IucA/IucC  37.09 
 
 		 842 aa  120  1.9999999999999998e-26  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2545  putative siderophore biosynthetic enzyme  36.47 
 
 		 192 aa  119  3e-26  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0287  aceytltranferase  36.36 
 
 		 187 aa  112  4.0000000000000004e-24  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2738  hypothetical protein  35.09 
 
 		 188 aa  109  4.0000000000000004e-23  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.482702  normal  0.175564 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2549  hypothetical protein  34.34 
 
 		 188 aa  106  3e-22  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.432912 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0514  aceytltranferase  34.55 
 
 		 196 aa  105  6e-22  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4293  hypothetical protein  33.53 
 
 		 183 aa  97.4  2e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.49385  hitchhiker  0.000790517 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0198  IucA/IucC family protein  35.84 
 
 		 209 aa  96.7  3e-19  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.0130557 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0591  siderophore biosynthesis protein  27.6 
 
 		 810 aa  90.9  1e-17  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.124028  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3273  putative acetyltransferase  30.18 
 
 		 203 aa  82.4  0.000000000000005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3457  IucA/IucC  28.83 
 
 		 207 aa  75.9  0.0000000000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1801  IucA/IucC family protein  27.05 
 
 		 799 aa  74.7  0.000000000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  hitchhiker  0.0000155987  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2594  hypothetical protein  30.18 
 
 		 187 aa  74.3  0.000000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.184474  normal  0.69464 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1799  hypothetical protein  31.01 
 
 		 223 aa  70.9  0.00000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  hitchhiker  0.000000012554  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2439  hypothetical protein  28.99 
 
 		 187 aa  69.3  0.00000000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.397369  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2839  hypothetical protein  25.51 
 
 		 447 aa  68.6  0.00000000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00269793  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2836  hypothetical protein  29.24 
 
 		 192 aa  68.2  0.0000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.513936  normal  0.134808 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3172  IucA/IucC family protein  27.61 
 
 		 818 aa  68.2  0.0000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2746  hypothetical protein  26.88 
 
 		 191 aa  66.6  0.0000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.126222  hitchhiker  0.000868803 
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3332  siderophore biosynthesis protein (malonyl-CoA decarboxylase)  28.14 
 
 		 209 aa  65.5  0.0000000006  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1809  GCN5-related N-acetyltransferase  26.95 
 
 		 194 aa  65.1  0.0000000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.548795 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2557  hypothetical protein  25.31 
 
 		 184 aa  61.2  0.00000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.463676  normal  0.298043 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0274  siderophore biosynthesis protein IucB (N6-hydroxylysine acetyl transferase)  27.21 
 
 		 303 aa  59.3  0.00000005  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.173921  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4633  N(6)-hydroxylysine O-acetyltransferase, aerobactin biosynthetic  26.39 
 
 		 315 aa  58.9  0.00000006  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3181  aerobactin siderophore biosynthesis protein IucB  26.39 
 
 		 315 aa  58.9  0.00000006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0948  Siderophore biosynthesis protein, conserved region  26.9 
 
 		 315 aa  57.8  0.0000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.633043  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1824  hypothetical protein  26.7 
 
 		 364 aa  55.8  0.0000006  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4748  hypothetical protein  27.95 
 
 		 400 aa  53.5  0.000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.586037 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0216  Siderophore biosynthesis protein, conserved region  23.95 
 
 		 225 aa  53.9  0.000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0409  hypothetical protein  25.29 
 
 		 195 aa  51.6  0.00001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.141827  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2833  IucA/IucC  21.51 
 
 		 813 aa  50.8  0.00002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.76703  normal  0.213309 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5061  hypothetical protein  26.55 
 
 		 354 aa  48.5  0.00009  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00103312 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3942  hypothetical protein  25.37 
 
 		 337 aa  48.1  0.0001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.291769  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3564  siderophore biosynthesis protein  24.81 
 
 		 337 aa  47.4  0.0002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4412  hypothetical protein  25.87 
 
 		 222 aa  47  0.0002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.479008 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1682  hypothetical protein  26.25 
 
 		 339 aa  47.4  0.0002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3256  hypothetical protein  23.35 
 
 		 357 aa  47  0.0002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3811  siderophore biosynthesis protein  24.39 
 
 		 337 aa  47  0.0003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2826  PvdYII  24.39 
 
 		 337 aa  46.6  0.0003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4245  siderophore biosynthesis protein, putative  24.24 
 
 		 205 aa  45.8  0.0005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25460  hypothetical protein  26.47 
 
 		 352 aa  44.3  0.001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0921  aerobactin siderophore biosynthesis protein IucB  24.79 
 
 		 316 aa  44.7  0.001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.62624  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2862  hypothetical protein  22.29 
 
 		 328 aa  44.3  0.002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.276239  normal  0.0557452 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06234  siderophore biosynthesis acetylase AceI, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G03400)  24.2 
 
 		 443 aa  43.9  0.002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0685832  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11377  hypothetical protein  26.26 
 
 		 210 aa  43.9  0.002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.512198 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00608  conserved hypothetical protein  22.44 
 
 		 443 aa  43.1  0.004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0785  putative siderophore biosynthesis protein IucB  26.23 
 
 		 316 aa  42.7  0.004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0191  aerobactin siderophore biosynthesis protein IucB  26.23 
 
 		 316 aa  42.7  0.004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000449097 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0713  aerobactin siderophore biosynthesis protein IucB  26.23 
 
 		 316 aa  42.7  0.004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4035  hypothetical protein  24 
 
 		 316 aa  42.4  0.007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.610793  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1564  hypothetical protein  24.29 
 
 		 338 aa  42  0.008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.31691  normal  0.229802 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1543  hypothetical protein  24.29 
 
 		 338 aa  41.6  0.009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.362175  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>