51 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shewmr4_1326 on replicon NC_008321
Organism: Shewanella sp. MR-4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008321  Shewmr4_1326  hypothetical protein  100 
 
 		 364 aa  743    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0103885  hitchhiker  0.00525591 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0344  hypothetical protein  33.24 
 
 		 370 aa  167  2.9999999999999998e-40  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  hitchhiker  0.00179291  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0755  hypothetical protein  27.07 
 
 		 696 aa  66.6  0.0000000006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.137164  normal  0.184305 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0929  a-glycosyltransferase  25.64 
 
 		 397 aa  63.5  0.000000006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.0122739 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0832  hypothetical protein  28.69 
 
 		 673 aa  63.2  0.000000007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.169962 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0792  hypothetical protein  28.69 
 
 		 673 aa  62.4  0.00000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.114506  normal  0.0948415 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1214  glycosyl transferase group 1  29.92 
 
 		 632 aa  61.2  0.00000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.440668  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0157  glycosyltransferase-like protein  26.8 
 
 		 402 aa  61.6  0.00000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4535  glycosyl transferase family protein  24.07 
 
 		 760 aa  59.7  0.00000008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0741652  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2352  hypothetical protein  24.66 
 
 		 420 aa  58.2  0.0000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2185  glycosyl transferase group 1  23.93 
 
 		 437 aa  58.5  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2599  glycosyl transferase group 1  23 
 
 		 956 aa  55.5  0.000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2482  group 1 glycosyl transferase  29.08 
 
 		 399 aa  55.8  0.000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0288582  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3527  glycosyl transferase group 1  23.16 
 
 		 433 aa  55.1  0.000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000428003  normal  0.043147 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0512  glycosyl transferase group 1  26.26 
 
 		 274 aa  55.1  0.000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0405  glycosyl transferase group 1  21.68 
 
 		 400 aa  54.3  0.000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.302496 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0568  glycosyl transferase group 1  22.38 
 
 		 394 aa  54.3  0.000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01296  glycosyltransferase  27.43 
 
 		 354 aa  54.7  0.000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.983218  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3252  glycosyl transferase group 1  25.7 
 
 		 409 aa  53.1  0.000008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0297  glycosyl transferase group 1  24.21 
 
 		 407 aa  52.4  0.00001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.855131  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2405  glycosyl transferase, group 1  24.06 
 
 		 406 aa  52.4  0.00001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0300  glycosyl transferase group 1  26.62 
 
 		 399 aa  52  0.00002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0300  glycosyl transferase group 1  26.62 
 
 		 399 aa  52  0.00002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0636  glycosyl transferase group 1  20.21 
 
 		 389 aa  51.2  0.00003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0521552  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3977  glycosyl transferase, group 1  23.93 
 
 		 412 aa  50.1  0.00006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.696397 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4281  glycosyl transferase group 1  26.43 
 
 		 418 aa  49.7  0.00007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0930783  normal  0.115686 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0332  glycosyl transferase group 1  25.97 
 
 		 400 aa  49.7  0.00008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_35650  hypothetical protein  21.77 
 
 		 402 aa  49.3  0.00009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.793748  hitchhiker  0.00000000053006 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3105  glycosyl transferases group 1  26.09 
 
 		 399 aa  48.9  0.0001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.147313  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1178  glycosyl transferase, group 1  23.66 
 
 		 376 aa  48.9  0.0001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3594  glycosyl transferase, group 1  24.64 
 
 		 421 aa  49.3  0.0001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0454071 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0146  glycosyl transferase, group 1  24.46 
 
 		 402 aa  48.5  0.0002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0724066 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0824  glycosyl transferase group 1  19.15 
 
 		 407 aa  48.1  0.0003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3169  glycosyl transferase, group 1  23.08 
 
 		 456 aa  47.8  0.0003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0934  glycosyl transferase group 1  20.47 
 
 		 443 aa  47.8  0.0003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00889269 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0023  glycosyl transferase family 2  24.12 
 
 		 703 aa  47.4  0.0004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2668  hypothetical protein  19.69 
 
 		 399 aa  47  0.0005  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.441319  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0590  glycosyl transferase group 1  23.67 
 
 		 414 aa  46.6  0.0006  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1248  putative mannosyltransferase WbyJ  25.77 
 
 		 380 aa  46.6  0.0007  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000000203407  decreased coverage  7.99612e-16 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3044  putative mannosyltransferase WbyJ  25.77 
 
 		 380 aa  46.6  0.0007  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.681162  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2500  glycosyl transferase group 1  28.57 
 
 		 403 aa  46.2  0.0008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.295677 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0408  glycosyl transferase group 1  23.73 
 
 		 410 aa  46.2  0.0008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3003  hypothetical protein  20.41 
 
 		 402 aa  45.8  0.001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.157248  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0520  glycosyl transferase group 1  21.31 
 
 		 499 aa  45.1  0.002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.22361  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2350  glycosyl transferase, group 1  20.79 
 
 		 422 aa  44.3  0.003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.234853  normal  0.935785 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1515  glycosyl transferase, group 1  20.83 
 
 		 417 aa  43.9  0.005  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0777934  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3218  glycosyl transferase family protein  23.17 
 
 		 902 aa  43.5  0.005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0552261  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3796  glycosyl transferase, group 1  25.15 
 
 		 387 aa  43.5  0.006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3802  glycosyl transferase, group 1  28.04 
 
 		 1348 aa  43.5  0.006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1075  hypothetical protein  25.98 
 
 		 411 aa  43.1  0.007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.610333  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0351  glycosyl transferase family protein  22.01 
 
 		 994 aa  42.7  0.01  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.792541  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>