30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shewana3_4340 on replicon NC_008573
Organism: Shewanella sp. ANA-3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008573  Shewana3_4340  hypothetical protein  100 
 
 		 158 aa  320  5e-87  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3776  hypothetical protein  67.09 
 
 		 158 aa  235  2e-61  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0031  hypothetical protein  67.09 
 
 		 158 aa  235  2e-61  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4124  hypothetical protein  67.09 
 
 		 158 aa  235  2e-61  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2454  hypothetical protein  49.67 
 
 		 167 aa  169  1e-41  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0355  hypothetical protein  45.7 
 
 		 156 aa  149  1e-35  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.84622  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1071  hypothetical protein  45.7 
 
 		 156 aa  149  1e-35  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1231  hypothetical protein  45.7 
 
 		 156 aa  149  1e-35  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.538059  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1649  hypothetical protein  45.7 
 
 		 156 aa  149  1e-35  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1738  phenylalanyl-tRNA synthetase beta subunit  45.7 
 
 		 156 aa  149  1e-35  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0064  hypothetical protein  45.7 
 
 		 156 aa  149  1e-35  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.64841  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4776  hypothetical protein  43.04 
 
 		 156 aa  149  2e-35  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0192522  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1180  hypothetical protein  46.2 
 
 		 156 aa  149  2e-35  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.345398  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0229  hypothetical protein  45.7 
 
 		 156 aa  149  2e-35  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0392  phenylalanyl-tRNA synthetase beta subunit  39.87 
 
 		 155 aa  136  1e-31  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000096  phenylalanyl-tRNA synthetase beta subunit  42.45 
 
 		 144 aa  134  7.000000000000001e-31  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.482372  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1958  hypothetical protein  36.71 
 
 		 162 aa  134  7.000000000000001e-31  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0107464  normal  0.0222962 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0592  hypothetical protein  44.08 
 
 		 159 aa  130  6.999999999999999e-30  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.65438  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05161  hypothetical protein  37.5 
 
 		 163 aa  125  3e-28  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4264  hypothetical protein  32.43 
 
 		 178 aa  49.3  0.00002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.238276  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3791  hypothetical protein  27.27 
 
 		 204 aa  47  0.0001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0179686  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1456  hypothetical protein  26.43 
 
 		 334 aa  45.4  0.0003  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0408  secreted protein  35.35 
 
 		 160 aa  45.1  0.0004  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.121912 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0122  hypothetical protein  33.33 
 
 		 192 aa  44.3  0.0008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.151218  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1934  hypothetical protein  32 
 
 		 157 aa  43.1  0.001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1961  hypothetical protein  32 
 
 		 157 aa  43.1  0.001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.238175  normal  0.426422 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4076  putative secreted protein  30.07 
 
 		 142 aa  43.1  0.001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.215347 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2510  Electron transfer DM13  34.78 
 
 		 162 aa  42.7  0.002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0416881 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4171  hypothetical protein  29.17 
 
 		 227 aa  40.8  0.008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00186556 
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5513  secreted protein  32.43 
 
 		 167 aa  40.4  0.01  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  normal  0.390859 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>