46 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shewana3_0328 on replicon NC_008577
Organism: Shewanella sp. ANA-3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008577  Shewana3_0328  thioester dehydrase family protein  100 
 
 		 179 aa  368  1e-101  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.96968 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3689  thioester dehydrase family protein  97.21 
 
 		 179 aa  358  3e-98  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0337  thioester dehydrase family protein  97.21 
 
 		 179 aa  358  3e-98  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4381  thioester dehydrase family protein  93.82 
 
 		 180 aa  341  2.9999999999999997e-93  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0327  thioester dehydrase family protein  80.5 
 
 		 178 aa  265  4e-70  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0334  thioester dehydrase family protein  79.5 
 
 		 177 aa  264  5.999999999999999e-70  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0329  thioester dehydrase family protein  79.25 
 
 		 178 aa  260  6.999999999999999e-69  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0433  thioester dehydrase family protein  78.26 
 
 		 177 aa  260  8.999999999999999e-69  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0337  Beta-hydroxyacyl-(acyl-carrier-protein) dehydratase FabA/FabZ  78.62 
 
 		 178 aa  259  2e-68  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.375611 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0339  Beta-hydroxyacyl-(acyl-carrier-protein) dehydratase, FabA/FabZ  63.95 
 
 		 163 aa  211  3.9999999999999995e-54  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4610  Beta-hydroxyacyl-(acyl-carrier-protein) dehydratase FabA/FabZ  64.38 
 
 		 167 aa  210  9e-54  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3524  Beta-hydroxyacyl-(acyl-carrier-protein) dehydratase, FabA/FabZ  60.95 
 
 		 197 aa  199  3e-50  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0312  beta-hydroxyacyl-(acyl-carrier-protein) dehydratase, FabA/FabZ  61.25 
 
 		 162 aa  194  4.0000000000000005e-49  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.416313  hitchhiker  0.00000341517 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3392  thioester dehydrase family protein  59.38 
 
 		 167 aa  187  5.999999999999999e-47  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3901  Beta-hydroxyacyl-(acyl-carrier-protein) dehydratase FabA/FabZ  62.11 
 
 		 158 aa  185  3e-46  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.101806  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5108  hypothetical protein  31.65 
 
 		 151 aa  102  2e-21  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3910  hypothetical protein  40.65 
 
 		 151 aa  102  3e-21  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0424  hypothetical protein  30.38 
 
 		 151 aa  99.8  2e-20  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0424  hypothetical protein  31.17 
 
 		 154 aa  99  3e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.682246  normal  0.307584 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3886  hypothetical protein  30.38 
 
 		 152 aa  94.7  6e-19  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004076  3-hydroxydecanoyl-[acyl-carrier-protein] dehydratase inferred for ABFAE pathway  36.24 
 
 		 154 aa  90.9  9e-18  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2091  beta-hydroxydecanoyl-ACP dehydrase  29.93 
 
 		 153 aa  89.7  2e-17  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0106  dehydratase  31.97 
 
 		 150 aa  86.3  2e-16  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4390  putative beta-hydroxyacyl-acyl carrier protein (ACP)-dehydratase  29.87 
 
 		 157 aa  83.6  0.000000000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00503781  normal  0.273691 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3609  Beta-hydroxyacyl-(acyl-carrier-protein) dehydratase, FabA/FabZ  29.94 
 
 		 167 aa  82.8  0.000000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3053  Beta-hydroxyacyl-(acyl-carrier-protein) dehydratase FabA/FabZ  30.51 
 
 		 169 aa  82.8  0.000000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.274531  normal  0.154865 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4084  Beta-hydroxyacyl-(acyl-carrier-protein) dehydratase FabA/FabZ  29.94 
 
 		 167 aa  82.8  0.000000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0938  hypothetical protein  32.3 
 
 		 165 aa  80.9  0.000000000000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS00772  hypothetical protein  30.97 
 
 		 158 aa  78.2  0.00000000000006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1500  Beta-hydroxyacyl-(acyl-carrier-protein) dehydratase FabA/FabZ  31.79 
 
 		 152 aa  74.3  0.000000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.438628  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1165  thioester dehydrase family protein  29.45 
 
 		 146 aa  72.4  0.000000000004  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.245022  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0701  Beta-hydroxyacyl-(acyl-carrier-protein) dehydratase FabA/FabZ  27.45 
 
 		 160 aa  69.7  0.00000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2759  hypothetical protein  28.08 
 
 		 157 aa  69.7  0.00000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4772  Beta-hydroxyacyl-(acyl-carrier-protein) dehydratase FabA/FabZ  28.93 
 
 		 157 aa  67.4  0.0000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3695  Beta-hydroxyacyl-(acyl-carrier-protein) dehydratase FabA/FabZ  28.93 
 
 		 157 aa  67.4  0.0000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.494212 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0901  Beta-hydroxyacyl-(acyl-carrier-protein) dehydratase FabA/FabZ  25.87 
 
 		 157 aa  62  0.000000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.595371  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4812  fabA-like domain protein  27.4 
 
 		 154 aa  61.2  0.000000008  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2167  cation ABC transporter, permease protein  27.4 
 
 		 147 aa  58.5  0.00000005  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3897  hypothetical protein  24.83 
 
 		 157 aa  55.1  0.0000006  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.941451 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4580  Beta-hydroxyacyl-(acyl-carrier-protein) dehydratase FabA/FabZ  24.5 
 
 		 160 aa  51.6  0.000006  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.632113  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0430  FabA FabZ, FabA/Z, beta-hydroxyacyl-acyl carrier protein (ACP)-dehydratase  26.62 
 
 		 165 aa  47  0.0001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1994  hypothetical protein  28.57 
 
 		 139 aa  46.2  0.0003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0666  cylZ protein  31.17 
 
 		 158 aa  42.7  0.002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2949  putative (3R)-hydroxymyristoyl-(acyl-carrier-protein) dehydratase  26.83 
 
 		 132 aa  42.7  0.003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00111585  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2917  thioester dehydratase family protein, FabZ subfamily  25.2 
 
 		 132 aa  41.6  0.005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2330  thioester dehydratase family, FabZ subfamily  28.21 
 
 		 132 aa  41.2  0.008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.707055  hitchhiker  0.0000246519 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>