36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shew_2946 on replicon NC_009092
Organism: Shewanella loihica PV-4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009092  Shew_2946  hypothetical protein  100 
 
 		 151 aa  312  9.999999999999999e-85  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0125573  normal  0.0151301 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1122  hypothetical protein  52.98 
 
 		 155 aa  155  2e-37  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000205985  normal  0.233923 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1089  hypothetical protein  54.55 
 
 		 155 aa  155  2e-37  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.000000360525  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1020  hypothetical protein  54.55 
 
 		 155 aa  155  2e-37  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000000462608  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3269  hypothetical protein  52.98 
 
 		 155 aa  155  3e-37  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000000575849  normal  0.0306422 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3719  hypothetical protein  58.27 
 
 		 148 aa  153  7e-37  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000989384  normal  0.0383104 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3071  hypothetical protein  55.48 
 
 		 154 aa  153  9e-37  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0110904  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3168  hypothetical protein  54.79 
 
 		 154 aa  152  2e-36  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000633672  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1025  hypothetical protein  53.59 
 
 		 155 aa  151  2.9999999999999998e-36  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000544137  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2990  hypothetical protein  54.11 
 
 		 154 aa  150  7e-36  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000446281  normal  0.422538 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3162  hypothetical protein  51.33 
 
 		 187 aa  145  2.0000000000000003e-34  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000000326454  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3496  hypothetical protein  52.52 
 
 		 144 aa  144  3e-34  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00242449  hitchhiker  0.00393071 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3576  hypothetical protein  50.65 
 
 		 154 aa  143  8.000000000000001e-34  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2860  hypothetical protein  46.71 
 
 		 150 aa  135  3.0000000000000003e-31  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000013794  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0670  hypothetical protein  45.71 
 
 		 147 aa  130  6.999999999999999e-30  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00376699  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2601  hypothetical protein  44.37 
 
 		 151 aa  129  2.0000000000000002e-29  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000020827  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4789  hypothetical protein  32.88 
 
 		 138 aa  61.2  0.000000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0307864  hitchhiker  0.00167919 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1005  hypothetical protein  31.25 
 
 		 144 aa  60.8  0.000000006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.368062  hitchhiker  0.00000000000106362 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42530  hypothetical protein  30.34 
 
 		 140 aa  58.5  0.00000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0881  hypothetical protein  28.19 
 
 		 158 aa  55.1  0.0000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00160834  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5412  hypothetical protein  28.78 
 
 		 156 aa  53.9  0.0000007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62170  hypothetical protein  30.83 
 
 		 150 aa  52.4  0.000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.157561 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0980  hypothetical protein  28.03 
 
 		 147 aa  45.8  0.0002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0845  hypothetical protein  27.27 
 
 		 138 aa  44.3  0.0005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000287816 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1508  hypothetical protein  36.67 
 
 		 163 aa  43.9  0.0009  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0660289  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2965  hypothetical protein  48.39 
 
 		 179 aa  43.1  0.001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.043854  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1127  hypothetical protein  28.24 
 
 		 157 aa  43.1  0.001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0795312  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03187  hypothetical protein  48.72 
 
 		 134 aa  42.4  0.002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1142  hypothetical protein  25.81 
 
 		 156 aa  42.4  0.002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.310409 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1286  hypothetical protein  48.08 
 
 		 146 aa  42  0.003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0373  hypothetical protein  27.13 
 
 		 179 aa  42  0.003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0268  hypothetical protein  32.35 
 
 		 168 aa  41.6  0.004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0268  hypothetical protein  32.35 
 
 		 168 aa  41.6  0.004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0260  hypothetical protein  32.35 
 
 		 168 aa  41.2  0.005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2739  hypothetical protein  33.85 
 
 		 342 aa  40.8  0.007  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0263  hypothetical protein  35.71 
 
 		 168 aa  40.4  0.009  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.624489 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>