25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shew_2655 on replicon NC_009092
Organism: Shewanella loihica PV-4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010506  Swoo_3303  hypothetical protein  84.09 
 
 		 396 aa  699    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.00716702  unclonable  0.0000000189971 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3233  hypothetical protein  84.34 
 
 		 396 aa  707    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3185  hypothetical protein  81.57 
 
 		 396 aa  660    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.624784  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2655  hypothetical protein  100 
 
 		 396 aa  805    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2267  hypothetical protein  43.78 
 
 		 409 aa  256  4e-67  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.00968313  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0639  hypothetical protein  42.3 
 
 		 400 aa  248  1e-64  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03863  hypothetical protein  39.35 
 
 		 398 aa  238  2e-61  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1068  putative lipoprotein  39.86 
 
 		 423 aa  235  1.0000000000000001e-60  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3313  putative lipoprotein  37.56 
 
 		 411 aa  229  9e-59  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.474661  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2701  hypothetical protein  36.79 
 
 		 405 aa  216  7e-55  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.228985  normal  0.0970727 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2414  putative lipoprotein  42.59 
 
 		 410 aa  216  7e-55  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0286985  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03650  putative lipoprotein  37.01 
 
 		 382 aa  211  2e-53  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3869  hypothetical protein  34.35 
 
 		 395 aa  206  5e-52  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3536  putative lipoprotein  37.83 
 
 		 406 aa  200  3.9999999999999996e-50  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.000000000150558  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0031  hypothetical protein  31.75 
 
 		 408 aa  177  3e-43  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1225  hypothetical protein  34.31 
 
 		 401 aa  174  2.9999999999999996e-42  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.22049  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1706  hypothetical protein  33.25 
 
 		 401 aa  147  3e-34  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.302597  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1265  putative lipoprotein  32.8 
 
 		 400 aa  146  5e-34  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2166  putative lipoprotein  27.31 
 
 		 482 aa  142  7e-33  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.843549  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0324  hypothetical protein  28.74 
 
 		 472 aa  139  1e-31  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2969  hypothetical protein  33.33 
 
 		 418 aa  137  4e-31  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0451316  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0050  hypothetical protein  30.29 
 
 		 448 aa  135  1.9999999999999998e-30  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00013841  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0463  hypothetical protein  31.17 
 
 		 451 aa  130  5.0000000000000004e-29  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000505363  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0465  hypothetical protein  27.89 
 
 		 329 aa  100  5e-20  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.501265 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4630  hypothetical protein  25.59 
 
 		 419 aa  45.1  0.002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>